ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 6347 条。当前显示第 19 / 64 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA02G545790
Chr02:140769924-140771192 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012684
Chr03:16827121-16827979 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G545790 |
|
TkA02G546320
Chr02:140944995-140949142 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012669
Chr03:16573687-16577519 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G546320 |
|
TkA02G546640
Chr02:141036906-141038134 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012665
Chr03:16463965-16464537 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G546640 |
|
TkA02G546950
Chr02:141126777-141129155 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012657
Chr03:16364076-16365194 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G546950 |
|
TkA02G547250
Chr02:141235146-141236282 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012650
Chr03:16267435-16268326 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547250 |
|
TkA02G547460
Chr02:141266221-141269588 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012647
Chr03:16229410-16230846 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547460 |
|
TkA02G547480
Chr02:141273796-141277401 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012645
Chr03:16218479-16220826 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
95.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547480 |
|
TkA02G547530
Chr02:141287389-141290165 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012643
Chr03:16206868-16208215 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547530 |
|
TkA02G547650
Chr02:141332284-141335022 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012641
Chr03:16152253-16154485 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547650 |
|
TkA02G547660
Chr02:141336489-141336983 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012640
Chr03:16149960-16150517 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 88.649 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547660 |
|
TkA02G548100
Chr02:141459069-141461533 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012633
Chr03:16056309-16058954 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.700 查询 100.000 / 对象 90.148 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G548100 |
|
TkA02G548640
Chr02:141602552-141604686 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012632
Chr03:15906843-15908540 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G548640 |
|
TkA02G548730
Chr02:141623841-141627609 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012631
Chr03:15885633-15886971 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G548730 |
|
TkA02G548740
Chr02:141628514-141629848 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012630
Chr03:15863246-15864580 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
97.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G548740 |
|
TkA02G549250
Chr02:141747734-141752601 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012620
Chr03:15742681-15746793 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G549250 |
|
TkA02G549740
Chr02:141851387-141853678 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012614
Chr03:15631960-15633948 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G549740 |
|
TkA02G549820
Chr02:141896775-141901443 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012613
Chr03:15584317-15587693 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G549820 |
|
TkA02G550050
Chr02:141940860-141942010 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012611
Chr03:15545944-15546718 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G550050 |
|
TkA02G550820
Chr02:142111311-142114638 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012602
Chr03:15379750-15382571 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G550820 |
|
TkA02G551030
Chr02:142180103-142181259 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012597
Chr03:15302860-15303832 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551030 |
|
TkA02G551230
Chr02:142246476-142248852 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012591
Chr03:15229259-15232098 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 97.356 / 对象 86.538 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551230 |
|
TkA02G551510
Chr02:142306639-142312902 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012584
Chr03:15129200-15134691 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.800 查询 99.141 / 对象 97.376 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551510 |
|
TkA02G551530
Chr02:142317598-142318281 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012582
Chr03:15120742-15121349 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551530 |
|
TkA02G551540
Chr02:142320539-142323381 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012580
Chr03:15110382-15112773 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551540 |
|
TkA02G552660
Chr02:142609227-142617369 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012569
Chr03:14772408-14780521 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.800 查询 100.000 / 对象 96.232 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G552660 |
|
TkA02G552670
Chr02:142618952-142623351 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012568
Chr03:14766711-14770482 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G552670 |
|
TkA02G552740
Chr02:142631800-142636206 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012567
Chr03:14754144-14756675 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G552740 |
|
TkA02G552980
Chr02:142694141-142697215 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012565
Chr03:14712320-14714965 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G552980 |
|
TkA02G553280
Chr02:142783295-142784764 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012559
Chr03:14599429-14600912 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.200 查询 85.194 / 对象 95.897 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G553280 |
|
TkA02G553330
Chr02:142793567-142795374 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012558
Chr03:14581077-14582388 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G553330 |
|
TkA02G553340
Chr02:142797041-142799727 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012557
Chr03:14576613-14578648 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G553340 |
|
TkA02G556710
Chr02:143737496-143738134 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012517
Chr03:13607594-13608232 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G556710 |
|
TkA02G556720
Chr02:143741371-143742048 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012516
Chr03:13603680-13604357 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G556720 |
|
TkA02G556810
Chr02:143776079-143776600 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012513
Chr03:13569116-13572214 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 81.221 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G556810 |
|
TkA02G556830
Chr02:143786645-143789044 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012512
Chr03:13556901-13558464 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G556830 |
|
TkA02G556990
Chr02:143845513-143849188 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012510
Chr03:13496794-13500748 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 96.691 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G556990 |
|
TkA02G557130
Chr02:143879690-143881266 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012508
Chr03:13464267-13465491 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G557130 |
|
TkA02G557230
Chr02:143919634-143921106 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012506
Chr03:13424914-13425671 (-)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G557230 |
|
TkA02G557420
Chr02:143973067-143975412 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012503
Chr03:13376444-13377721 (+)
CM104801.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 97.753 / 对象 95.956 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G557420 |
|
TkA02G557930
Chr02:144123825-144126232 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012494
Chr03:13212995-13214998 (+)
CM104801.1
|
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