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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G547480
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 141273796-141277401 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2348 bp · TkA02G547480|TK1151|cDNA

CCACGCCTCGTTTGATTTGGTCCGAACCCATTTCGACTGCCTTCAGTTTCCTTTTTAGATTTAGTCCAGCTCATCCTCCACGTCACCACGATAACCGGTCCACGTACAATAACAATTATACGTGGATCCCCAATCGCCCAATGAATATAACCTTCAGTTCAAGTAATGTGACATGTAGGATCTCATAAAATCTTCTTTCTTTGTAGTCCTTGGATTAATTCACGTTCAAGTTATCAGTCCCTTTGTTTTCTAAACCAGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1605 bp · TkA02G547480|TK1151|CDS

ATGACCAACAGCCAAGAAGGAAGCAAGGGTCAACAGGTGAACAATCATGTGAAATCTGAGTATCAGAAAGATGTGAATAGATTTCCAAGTATCACACCAAGTTCACAAAAAGATGATGAAAATCTGCATAACGAATCCAATCAGGTGGCCCCACCACAACAGCTTCAAGGGTCATTGGTCCACTGGGAGAGGTTTCTCCATGTTAGATCCATTAAGGTCATGTTGGTAGAAGATGATGACTGTACACGCCAAATTGTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

534 aa · TkA02G547480|TK1151|PROTEIN

MTNSQEGSKGQQVNNHVKSEYQKDVNRFPSITPSSQKDDENLHNESNQVAPPQQLQGSLVHWERFLHVRSIKVMLVEDDDCTRQIVTALLRNCNYEVIQAANGIQAWKILQNLSNHIDIVLTEVVMPCLSGIGLLCKIMSHKTRKNIPVIMMSSHDSMSLVFKCLSKGAVDFLVKPIRKNELKILWQHVWRRCHSSSGSGSESGTHAQKSVTSKGNLRYDNNSSKDGDDDNESDDGSGTQSTWTKTPSNQISELPDSTCG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G547480
TK1151 IDTkA02G547480
OH-1004 IDLXL04_012645
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G547480
位置Chr02:141273796-141277401 (+)
描述Similar to APRR7: Two-component response regulator-like APRR7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02810 CCA1 和 LHY 的转录抑制因子，以及 LWD1 和 LWD2 表达的正调节因子。
Circadian waves of expression of the APRR1/TOC1 family of pseudo-response regulators in Arabidopsis thaliana: insight into the plant circadian clock.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd043
At5g60100 控制光周期开花反应。
Circadian waves of expression of the APRR1/TOC1 family of pseudo-response regulators in Arabidopsis thaliana: insight into the plant circadian clock.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd043

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0284100 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XFB7 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YQ93 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012645 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048511 rhythmic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G02810
dosa:Os03g0284100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.892
排名 1 · TkA02G547480 · TK1151
细胞质0.130
排名 2 · TkA02G547480 · TK1151
细胞膜0.065
排名 3 · TkA02G547480 · TK1151
内质网0.027
排名 4 · TkA02G547480 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA02G547480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12827Peroxin-2240-122 aa
PF29701TP_0454_N71-159 aa
PF00072Response_reg73-183 aa
PF04360Serglycin193-221 aa
PF11596DUF3246194-284 aa
PF12827Peroxin-22255-279 aa
PF04360Serglycin436-462 aa
PF06203CCT483-524 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G547480PF12827Peroxin-22401220.04714.2
TkA02G547480PF29701TP_0454_N711590.002818.2
TkA02G547480PF00072Response_reg731834.3e-2279.1
TkA02G547480PF04360Serglycin1932211.39.7
TkA02G547480PF11596DUF32461942840.0513.8
TkA02G547480PF12827Peroxin-222552790.04714.2
TkA02G547480PF04360Serglycin4364621.39.7
TkA02G547480PF06203CCT4835246.8e-1658.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93WK5拟南芥sp|Q93WK5|APRR7_ARATH Two-component response regulator-like APRR770.700%Swiss-Prot低置信
Q9LVG4拟南芥sp|Q9LVG4|APRR3_ARATH Two-component response regulator-like APRR339.900%Swiss-Prot中等置信
Q10N34水稻sp|Q10N34|PRR73_ORYSJ Two-component response regulator-like PRR7335.200%Swiss-Prot中等置信
A2XFB7水稻sp|A2XFB7|PRR73_ORYSI Two-component response regulator-like PRR7335.200%Swiss-Prot中等置信
A2YQ93水稻sp|A2YQ93|PRR37_ORYSI Two-component response regulator-like PRR3733.800%Swiss-Prot中等置信

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