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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G546320
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 140944995-140949142 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1889 bp · TkA02G546320|TK1151|cDNA

AAAAAAAAGACCCAATGGTATAGAGAGACTAGGACCCTATGCATCATGACTTATCATCCATCATCACATCAAATGTATGAATGCATGCATGCATAAAGCTTTAAAGAGATAGAAAATGAATGGAGTCGAATGGTATCACCAGATCTACAGACCAAAAGAAGCCATTGGAGACCCCACAATCTCCAGACACAGCTCAAAAGCCAACAAATTAATACCTTTATTCCGGATATGATGTCTGGCGAGATGTTTCCTATTCCTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1563 bp · TkA02G546320|TK1151|CDS

ATGGTATCACCAGATCTACAGACCAAAAGAAGCCATTGGAGACCCCACAATCTCCAGACACAGCTCAAAAGCCAACAAATTAATACCTTTATTCCGGATATGATGTCTGGCGAGATGTTTCCTATTCCTCACCACCACCACCACCACCATCAACCACCGCCACCACCACCACCGCAAGTACCAACTCTTGAACCTAACCCTAACCCTAAAGCCATCGCCAATCTCAAGAAGAAGAGAAACTTGCCGGGAACCCCAGATCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

520 aa · TkA02G546320|TK1151|PROTEIN

MVSPDLQTKRSHWRPHNLQTQLKSQQINTFIPDMMSGEMFPIPHHHHHHHQPPPPPPPQVPTLEPNPNPKAIANLKKKRNLPGTPDPDAEVMALSPKSLMATNRFVCEICNKGFQRDQNLQLHRRGHNLPWKLKQRNTKEPIKKKVYICPEKTCVHHDPSRALGDLTGIKKHFSRKHGEKKWKCEKCSKKYAVQSDWKAHSKTCGTREYKCDCGTLFSRKDSFITHRAFCDALAEESVRLTSVTPNSLGLKNEGGMNESV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G546320
TK1151 IDTkA02G546320
OH-1004 IDLXL04_012669
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G546320
位置Chr02:140944995-140949142 (-)
描述Similar to JKD: Zinc finger protein JACKDAW
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03150 转录因子，与BIB共同通过快速上调'SCARECROW'（SCR）调控组织边界和不对称细胞分裂，从而控制'SHORT-ROOT'（SHR）的核定位并限制其作用。 暂无已核实直接文献
At1g55110 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g45260 转录因子，与 JKD 一起，通过快速上调 'SCARECROW' (SCR) 来调控根部的组织边界和不对称细胞分裂，从而控制 'SHORT-ROOT' (SHR) 的核定位并限制其作用。 暂无已核实直接文献
At5g66730 转录因子通过调节种子成熟过程中的光和激素信号来促进发芽过渡。
The Arabidopsis C2H2 zinc finger INDETERMINATE DOMAIN1/ENHYDROUS promotes the transition to germination by regulating light and hormonal signaling during seed maturation.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.085134
DELLAs function as coactivators of GAI-ASSOCIATED FACTOR1 in regulation of gibberellin homeostasis and signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.125690
At4g02670 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012669 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008356 asymmetric cell division 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009937 regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010336 gibberellic acid homeostasis 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0034504 protein localization to nucleus 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45260
ath:AT3G50700
ath:AT4G02670
ath:AT5G03150
ath:AT5G66730
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.978
排名 1 · TkA02G546320 · TK1151
细胞质0.098
排名 2 · TkA02G546320 · TK1151
细胞膜0.017
排名 3 · TkA02G546320 · TK1151
线粒体0.009
排名 4 · TkA02G546320 · TK1151
内质网0.009
排名 5 · TkA02G546320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07975C1_499-128 aa
PF23250zf_DPOE_2101-117 aa
PF04810zf-Sec23_Sec24101-112 aa
PF23250zf_DPOE_2103-117 aa
PF02892zf-BED103-117 aa
PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD104-114 aa
PF13912zf-C2H2_6104-127 aa
PF00096zf-C2H2105-127 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G546320PF07975C1_4991283.08.9
TkA02G546320PF23250zf_DPOE_21011170.1612.3
TkA02G546320PF04810zf-Sec23_Sec241011120.311.8
TkA02G546320PF23250zf_DPOE_21031170.1612.3
TkA02G546320PF02892zf-BED1031170.1712.7
TkA02G546320PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD1041148.1e-1554.9
TkA02G546320PF13912zf-C2H2_61041270.02115.5
TkA02G546320PF00096zf-C2H21051277e-0833.2
TkA02G546320PF12171zf-C2H2_jaz1051270.000720.4
TkA02G546320PF12874zf-met1051270.001819.2
TkA02G546320PF13894zf-C2H2_41051270.1513.6
TkA02G546320PF23447DUF71281051147.77.2
TkA02G546320PF07975C1_41361513.08.9
TkA02G546320PF22996C2H2-2nd_BIRD-IDD1431774.2e-2278.6
TkA02G546320PF23447DUF71281511607.77.2
TkA02G546320PF23250zf_DPOE_21651930.1612.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q700D2拟南芥sp|Q700D2|IDD10_ARATH Zinc finger protein JACKDAW48.800%Swiss-Prot中等置信
Q8H1F5拟南芥sp|Q8H1F5|IDD7_ARATH Protein indeterminate-domain 756.500%Swiss-Prot中等置信
Q944L3拟南芥sp|Q944L3|IDD9_ARATH Zinc finger protein BALDIBIS85.000%Swiss-Prot低置信
Q9LVQ7拟南芥sp|Q9LVQ7|IDD1_ARATH Zinc finger protein ENHYDROUS85.600%Swiss-Prot低置信
O22759拟南芥sp|O22759|IDD12_ARATH Protein indeterminate-domain 1284.400%Swiss-Prot低置信

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