基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G560740
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 144823324-144829756
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4940 bp · TkA02G560740|TK1151|cDNA
GAAAAACCCAAAAGAAACTTCGGTTTCCGAGTCAACTCTCTCTCCCTTCACGCCTTATTTGACCGAGTCACGAAATCGGAAGACGCCGATTCTCTCTTTTATGCTTTCTTTCACACACCCCAAATCGTGTGTGCGAGAGAAAGTTGGAGAGAAGGAAAGCGTAAATCTTCATCACAATTTCACTAGCCGAATAGTCTCTTCACAATTCGGCTCATCGATTTCATCTAAAATTTCATTTTGATGGTTGTTTTTAGGGTTTT...
CDS
下载 CDS FASTA4194 bp · TkA02G560740|TK1151|CDS
ATGATGATATCGAGAGGGTTGTTTGGGTGGTCCCCACCACACATACAGCCTTTAACGCCGGTGTCGGAGGTATCGGAACCGCCGGAGTCTCCGTCGCCTTACATGGACACAAGTAACGATGCTTTACCTGTTGAAGCTGAGGAGGAAATGGAAGAGACAGAGGAGATCGAGCCGCCTCCAGCTGCTGTGCCGTTCTCTAAGCTGTTTGTGTGTGCTGATAGGTTTGATTGGGTGCTTATGGTGGTTGGATCGATTGCTGC...
1397 aa · TkA02G560740|TK1151|PROTEIN
MMISRGLFGWSPPHIQPLTPVSEVSEPPESPSPYMDTSNDALPVEAEEEMEETEEIEPPPAAVPFSKLFVCADRFDWVLMVVGSIAAAAHGTALVVYLHYFAKIVQLLGHSDEDLDVLFDRFKELTLILVYIAGGVFAAGWIEVSCWILTGERQTAVIRSRYVQVLLNQDMSFFDTYGNNGDIVSQVLSDVLLIQSALSEKVGNYIHNMATFFSGLTIGFINCWQIAGLTLLTGPFIVAAGGISNIFLHRLAENIQDAYA...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G560740 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G560740 |
| OH-1004 ID | LXL04_012450 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 99.900 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.441
溶酶体／液泡0.242
内质网0.146
细胞质0.140
高尔基体0.087
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF04955HupE_UreJ77-96 aaPF00664ABC_membrane82-352 aaPF20990DUF2207_C85-126 aaPF26768YtrI_N209-226 aaPF20990DUF2207_C254-338 aaPF04955HupE_UreJ300-371 aaPF00005ABC_tran422-567 aaPF13555AAA_29429-447 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G560740 | PF04955 | HupE_UreJ | 77 | 96 | 0.0014 | 18.8 |
| TkA02G560740 | PF00664 | ABC_membrane | 82 | 352 | 5.1e-78 | 263.2 |
| TkA02G560740 | PF20990 | DUF2207_C | 85 | 126 | 0.28 | 11.5 |
| TkA02G560740 | PF26768 | YtrI_N | 209 | 226 | 0.23 | 12.0 |
| TkA02G560740 | PF20990 | DUF2207_C | 254 | 338 | 0.28 | 11.5 |
| TkA02G560740 | PF04955 | HupE_UreJ | 300 | 371 | 0.0014 | 18.8 |
| TkA02G560740 | PF00005 | ABC_tran | 422 | 567 | 2e-51 | 174.9 |
| TkA02G560740 | PF13555 | AAA_29 | 429 | 447 | 0.00086 | 19.7 |
| TkA02G560740 | PF06414 | Zeta_toxin | 429 | 471 | 0.0064 | 16.7 |
| TkA02G560740 | PF20693 | YobI-ATPase | 429 | 451 | 0.13 | 12.5 |
| TkA02G560740 | PF02463 | SMC_N | 430 | 447 | 1.3e-06 | 28.7 |
| TkA02G560740 | PF13476 | AAA_23 | 430 | 447 | 0.14 | 13.5 |
| TkA02G560740 | PF13175 | AAA_15 | 432 | 457 | 0.00099 | 19.5 |
| TkA02G560740 | PF13304 | AAA_21 | 434 | 450 | 0.00013 | 22.8 |
| TkA02G560740 | PF02463 | SMC_N | 549 | 598 | 1.3e-06 | 28.7 |
| TkA02G560740 | PF13304 | AAA_21 | 553 | 594 | 0.00013 | 22.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8LPT1 | 拟南芥 | sp|Q8LPT1|AB6B_ARATH ABC transporter B family member 6 | 81.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9M3B9 | 拟南芥 | sp|Q9M3B9|AB20B_ARATH ABC transporter B family member 20 | 81.100% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LJX0 | 拟南芥 | sp|Q9LJX0|AB19B_ARATH ABC transporter B family member 19 | 40.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9ZR72 | 拟南芥 | sp|Q9ZR72|AB1B_ARATH ABC transporter B family member 1 | 40.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SGY1 | 拟南芥 | sp|Q9SGY1|AB10B_ARATH ABC transporter B family member 10 | 40.600% | Swiss-Prot | 中等置信 |