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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012613
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 15584317-15587693 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1461 bp · LXL04_012613|LXL04_012613|OH1004|cDNA

ATGAAGACAGAAAGTCTTCGACATACGAAGCAACATGGATCATGGCCAAATATGAACGTGAGAAGATGGTTGAATTTGAAGAAGGGAGCAGATGATTTTCATTCTGTAAATGTTGCATCAGATAGGAGCGAGAGAAGGAAAAGTTGTTCCGATGATGGGCGATACGCCGTCGTACCAGAGGAGTTATCAGATGAATGGTTGATAGATGATGACTCCAAACAAGAGAAATCTGATCTAAGTATGTTTGTTGGCACATGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1461 bp · LXL04_012613|LXL04_012613|OH1004|CDS

ATGAAGACAGAAAGTCTTCGACATACGAAGCAACATGGATCATGGCCAAATATGAACGTGAGAAGATGGTTGAATTTGAAGAAGGGAGCAGATGATTTTCATTCTGTAAATGTTGCATCAGATAGGAGCGAGAGAAGGAAAAGTTGTTCCGATGATGGGCGATACGCCGTCGTACCAGAGGAGTTATCAGATGAATGGTTGATAGATGATGACTCCAAACAAGAGAAATCTGATCTAAGTATGTTTGTTGGCACATGGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

486 aa · LXL04_012613|LXL04_012613|OH1004|PROTEIN

MKTESLRHTKQHGSWPNMNVRRWLNLKKGADDFHSVNVASDRSERRKSCSDDGRYAVVPEELSDEWLIDDDSKQEKSDLSMFVGTWNVGGNCPHKGLDVSDWLTTSSPADIYVIGFQEIVPLNAGNVLGTENKSPAVKWLSLIHQALNTTTPELPLNYSPTTPVDHHHQIKSRASFSDLLSLEDEFGQQEYQQYFNNGSNPSTNSDAKQNPGFCLVASKQMVGIFLCVFIRQDLRHHVSNLKISCVGRGIMGYLGNKGSV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012613
TK1151 IDTkA02G549820
OH-1004 IDLXL04_012613
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012613
位置Chr03:15584317-15587693 (-)
描述Similar to IP5P8: Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g37440 I型肌醇多磷酸 5-磷酸酶 8。 暂无已核实直接文献
At3g63240 I 型肌醇多磷酸 5-磷酸酶 4。 暂无已核实直接文献
At2g32010 对 PtdIns(4,5)P₂ 及较弱程度上的 PtdIns(3,4,5)P₃ 具有磷酸酶活性，但不作用于 Ins(1,4,5)P₃。
CVP2- and CVL1-mediated phosphoinositide signaling as a regulator of the ARF GAP SFC/VAN3 in establishment of foliar vein patterns.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03920.x
Primary root protophloem differentiation requires balanced phosphatidylinositol-4,5-biphosphate levels and systemically affects root branching.2015 · DOI: 10.1242/dev.118364
At1g05470 可能对 PtdIns(4,5)P₂ 和 PtdIns(3,4,5)P₃ 具有磷酸酶活性。
Genetic regulation of vascular tissue patterning in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.11.2123
Cotyledon vascular pattern2-mediated inositol (1,4,5) triphosphate signal transduction is essential for closed venation patterns of Arabidopsis foliar organs.2004 · DOI: 10.1105/tpc.021030
CVP2- and CVL1-mediated phosphoinositide signaling as a regulator of the ARF GAP SFC/VAN3 in establishment of foliar vein patterns.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03920.x
Primary root protophloem differentiation requires balanced phosphatidylinositol-4,5-biphosphate levels and systemically affects root branching.2015 · DOI: 10.1242/dev.118364
At2g01900 对 PtdIns(4,5)P2 具有磷酸酶活性，并对 PtdIns(3,4,5)P3 具有较低的活性，但对 Ins(1,4,5)P3 无活性。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012613 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0032957 inositol trisphosphate metabolic process 生物过程
GO:0046856 phosphatidylinositol dephosphorylation 生物过程
GO:0071472 cellular response to salt stress 生物过程
GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05470
ath:AT2G32010
ath:AT2G37440
ath:AT3G63240
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.354
排名 1 · LXL04_012613 · OH-1004
细胞核0.265
排名 2 · LXL04_012613 · OH-1004
细胞膜0.193
排名 3 · LXL04_012613 · OH-1004
质体0.115
排名 4 · LXL04_012613 · OH-1004
高尔基体0.100
排名 5 · LXL04_012613 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22669.3Exo_endo_phos284-440 aa
PF03372.30Exo_endo_phos84-435 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012613PF22669.3Exo_endo_phos2844408.9e-77259.2
LXL04_012613PF03372.30Exo_endo_phos844351.6e-0938.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WT19拟南芥Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 852.475%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8GTS0拟南芥Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 444.902%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q0WQ41拟南芥Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 755.116%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LR47拟南芥Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 663.675%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SIS4拟南芥Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 945.974%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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