ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 4 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA02G345330
Chr02:87698020-87704670 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015347
Chr03:69137009-69143259 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.500 查询 100.000 / 对象 77.083 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G345330 |
|
TkA02G349450
Chr02:88853493-88858226 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015266
Chr03:67221208-67224673 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G349450 |
|
TkA02G352900
Chr02:89728067-89733895 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015244
Chr03:66738298-66744213 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G352900 |
|
TkA02G356550
Chr02:90566954-90567696 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015203
Chr03:65843402-65844357 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 98.020 / 对象 72.527 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G356550 |
|
TkA02G356820
Chr02:90624378-90636499 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015200
Chr03:65774171-65786729 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
95.200 查询 100.000 / 对象 99.717 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G356820 |
|
TkA02G358830
Chr02:91148435-91149552 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015177
Chr03:65328375-65329043 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.400 查询 100.000 / 对象 77.885 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G358830 |
|
TkA02G361000
Chr02:91790403-91800429 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031990
Chr07:14486965-14495580 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 84.856 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G361000 |
|
TkA02G363570
Chr02:92488089-92496927 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015131
Chr03:64490378-64492736 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.900 查询 76.404 / 对象 92.517 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G363570 |
|
TkA02G366180
Chr02:93159186-93173868 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015118
Chr03:64186108-64193138 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.100 查询 79.225 / 对象 75.424 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G366180 |
|
TkA02G367620
Chr02:93537058-93538184 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015109
Chr03:63770370-63771496 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G367620 |
|
TkA02G369820
Chr02:94112269-94117533 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015091
Chr03:63269263-63275315 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.400 查询 100.000 / 对象 92.553 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G369820 |
|
TkA02G371140
Chr02:94467292-94471593 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015062
Chr03:62818721-62825294 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.300 查询 100.000 / 对象 77.758 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G371140 |
|
TkA02G373150
Chr02:94965349-94974072 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015035
Chr03:62200690-62208082 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.900 查询 100.000 / 对象 77.789 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G373150 |
|
TkA02G379150
Chr02:96395092-96401278 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014982
Chr03:60797342-60798610 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.800 查询 83.516 / 对象 90.213 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G379150 |
|
TkA02G383140
Chr02:97385570-97390196 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014932
Chr03:59832473-59834917 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G383140 |
|
TkA02G385940
Chr02:98096392-98099219 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014894
Chr03:59151720-59153636 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 89.919 / 对象 75.338 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G385940 |
|
TkA02G386110
Chr02:98139935-98140630 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014893
Chr03:59148087-59148782 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G386110 |
|
TkA02G392700
Chr02:99806027-99806620 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014840
Chr03:57877655-57878267 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.000 查询 100.000 / 对象 96.774 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G392700 |
|
TkA02G395520
Chr02:100438639-100440385 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014810
Chr03:57353278-57354849 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 100.000 / 对象 87.917 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G395520 |
|
TkA02G396470
Chr02:100652510-100654875 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014798
Chr03:57169855-57173081 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 81.368 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G396470 |
|
TkA02G397770
Chr02:101065416-101065916 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012116
Chr03:6727330-6728099 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
95.800 查询 100.000 / 对象 72.489 |
TkA02G397770 | |
|
TkA02G397910
Chr02:101095739-101099916 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_033506
Chr07:45864166-45865803 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.100 查询 70.016 / 对象 79.266 |
TkA02G397910 | |
|
TkA02G398840
Chr02:101317515-101321329 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014770
Chr03:56621570-56624436 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 74.218 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G398840 |
|
TkA02G399450
Chr02:101461658-101463731 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014755
Chr03:56373344-56374807 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G399450 |
|
TkA02G404260
Chr02:102697725-102699072 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014703
Chr03:55119384-55120482 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G404260 |
|
TkA02G404340
Chr02:102722834-102724553 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014701
Chr03:55094137-55097763 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.000 查询 100.000 / 对象 72.283 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G404340 |
|
TkA02G404600
Chr02:102798049-102800908 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014689
Chr03:55017715-55019872 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G404600 |
|
TkA02G406340
Chr02:103301028-103304786 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014655
Chr03:54411653-54415112 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G406340 |
|
TkA02G406400
Chr02:103327011-103330747 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014651
Chr03:54372326-54375706 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G406400 |
|
TkA02G406800
Chr02:103433615-103434670 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014644
Chr03:54305406-54306782 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.900 查询 100.000 / 对象 76.638 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G406800 |
|
TkA02G407000
Chr02:103498644-103501115 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014634
Chr03:54207080-54208798 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G407000 |
|
TkA02G407250
Chr02:103566035-103567951 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014627
Chr03:54154698-54155927 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G407250 |
|
TkA02G411260
Chr02:104608368-104612414 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014583
Chr03:53027109-53030288 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.700 查询 98.602 / 对象 73.660 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G411260 |
|
TkA02G422860
Chr02:107364200-107368427 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014477
Chr03:50023211-50026884 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G422860 |
|
TkA02G424610
Chr02:107847745-107850015 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014451
Chr03:49456082-49457932 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G424610 |
|
TkA02G424640
Chr02:107862610-107865719 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014450
Chr03:49407517-49408967 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G424640 |
|
TkA02G425330
Chr02:108028868-108029209 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014441
Chr03:49312013-49314329 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.100 查询 100.000 / 对象 78.472 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G425330 |
|
TkA02G427350
Chr02:108577950-108581061 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_014416
Chr03:48734670-48737826 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00090 | TkA02G427350 |
|
TkA02G434070
Chr02:110311406-110313139 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_008171
Chr02:90761863-90763249 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00068 | TkA02G434070 |
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