TkA02G373150 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G373150

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 94965349-94974072 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3943 bp · TkA02G373150|TK1151|cDNA

GTTACTTTTAGCGTGTGTGTGTGTAAAGATTAGTAGATTAAATTAAAATGTACACATACTATATATAGGTTTGATTCGACCGGAGGAAACTATCCTGGGGGTTTGAAATTTTGACACATCAAAACCGAATCATGATGTAAAATCAAGGAAGGCTTTGATTCGATATTTCGATTGTTGGAGAATTTGATCCTGCGAAATAATCCAACAGGTGAAATGGACATGCTAATGGTGAATTAAGAATGGGAAGTACCAGGGAACAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2388 bp · TkA02G373150|TK1151|CDS

ATGGGGGCAATTGTCACCGGAGATCGGTATCTCGAATCGCTAGTGAAGTTCGTCGAGAAGCAGGCTGGTCCGTTGATCGAAGGAACGATTGTATTGAAGTTGAATCCGGTTGGCCTTCACTACGTTCAATCCAGGCTCGAATCATTGGCGGAGCTTGAGAGGCTCCTCGCTGGAGCTCCTGTTGATTACCTCCGTGCCTATGTTTCCGACCTTGGTGATCACCGGGCGCTTGAGCAGCTCCGACGGATCCTACGGATACT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

795 aa · TkA02G373150|TK1151|PROTEIN

MGAIVTGDRYLESLVKFVEKQAGPLIEGTIVLKLNPVGLHYVQSRLESLAELERLLAGAPVDYLRAYVSDLGDHRALEQLRRILRILTSLKVISVLPPPSCRDPTPLCLLPFSRLKVLELRGCDLSTSAARGLLELRHTLEKIICHNSTDALRHVFASRIAEIEHSPHWKRLSFVSCAYNGLVLMDESLRLLPVVETLDLSRNKFTKVDNLLRCSKLKHLDLGFNQLRTIASFSKVTCQIVKLVLRNNALTTMRGVENLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G373150`
TK1151 ID	TkA02G373150
OH-1004 ID	LXL04_015035
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	99.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 77.789 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G373150`
位置	Chr02:94965349-94974072 (-)
描述	Similar to stk11ip: Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_015035` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0008104 intracellular protein localization 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005765 lysosomal membrane 细胞组分 GO:0035578 azurophil granule lumen 细胞组分 GO:0019901 protein kinase binding 分子功能 GO:0140311 protein sequestering activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	gga:424195 hsa:114790 mmu:71728 xla:432019 xtr:394784 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.525

排名 1 · TkA02G373150 · TK1151

细胞核0.291

排名 2 · TkA02G373150 · TK1151

细胞膜0.196

排名 3 · TkA02G373150 · TK1151

高尔基体0.111

排名 4 · TkA02G373150 · TK1151

内质网0.075

排名 5 · TkA02G373150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_4114-150 aa

PF13855LRR_8114-125 aa

PF00560LRR_1114-128 aa

PF13516LRR_6115-130 aa

PF14580LRR_9160-220 aa

PF13855LRR_8186-227 aa

PF24048LRR_NXF1-5193-252 aa

PF12799LRR_4195-233 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G373150	`PF12799`	LRR_4	114	150	9e-16	58.3
TkA02G373150	`PF13855`	LRR_8	114	125	2.1e-10	40.9
TkA02G373150	`PF00560`	LRR_1	114	128	1.7e-05	24.7
TkA02G373150	`PF13516`	LRR_6	115	130	0.002	18.7
TkA02G373150	`PF14580`	LRR_9	160	220	1.9e-06	28.3
TkA02G373150	`PF13855`	LRR_8	186	227	2.1e-10	40.9
TkA02G373150	`PF24048`	LRR_NXF1-5	193	252	2.2e-08	34.5
TkA02G373150	`PF12799`	LRR_4	195	233	9e-16	58.3
TkA02G373150	`PF13855`	LRR_8	195	232	2.1e-10	40.9
TkA02G373150	`PF13516`	LRR_6	195	206	0.002	18.7
TkA02G373150	`PF14580`	LRR_9	196	266	1.9e-06	28.3
TkA02G373150	`PF00560`	LRR_1	196	207	1.7e-05	24.7
TkA02G373150	`PF13516`	LRR_6	214	227	0.002	18.7
TkA02G373150	`PF00560`	LRR_1	216	229	1.7e-05	24.7
TkA02G373150	`PF14580`	LRR_9	222	326	1.9e-06	28.3
TkA02G373150	`PF12799`	LRR_4	241	279	9e-16	58.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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