基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G404600
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 102798049-102800908
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1816 bp · TkA02G404600|TK1151|cDNA
ATAATTAATATCTTTGACATATGAGAATTTGTGTGTATGGTGTTTGACAAAGATGTATATGGTGGAAGGAAAAGATGGCATCCACCATTGTTGATGCACCACTCATTTACAACAATACTAACATTATCAGGTCGATTATATTCTAAGAACTAACTTATTTTCAGTCCCACAAACAAAGAAGGTAACAAAAAAACTTTTAAGAAAAAACAAATAACACCACCATAGATATTCATTTGAAGTCGACAAAGACACGGAACAAA...
CDS
下载 CDS FASTA1089 bp · TkA02G404600|TK1151|CDS
ATGGGAGCTCAGAAGAGCGTCCATGCTGGCAAAGCCAAGATAGACTTCAATGTTGATTTCACGCACAGGCTATGTGCTGCTATGATGGTACATTCATTCAGAAATTCAGGCACTGGTAGTCCGCTTTCACTGATTGTTGGGAGCCTTTGCATAAAACACCCAAACTTATTTGGAAAAAGTGAGAAGCTTGATTTATTATGGGATAAAGGCCTTTCAGATTCCAATATATTGATTGCTTATAGAAAGCCAAGACCCGAATG...
362 aa · TkA02G404600|TK1151|PROTEIN
MGAQKSVHAGKAKIDFNVDFTHRLCAAMMVHSFRNSGTGSPLSLIVGSLCIKHPNLFGKSEKLDLLWDKGLSDSNILIAYRKPRPEWLAQHSFVIQHVISPEVGIHGVPIDNFSKTGSGGVNLCRFSAGLDLDEPGTSNWTTKTSIKFEHVRPVNDDGRSINRDPHGYSVTSSGNFHDNMVVLKQESRFAKANDHSFTRFSLQIEQGIPLMSKWLIFNRFKFAASKGLKVGPGFLLASLTGGSIVGDIAPYQAFAIGGVG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G404600 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G404600 |
| OH-1004 ID | LXL04_014689 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Probable |
| 蛋白一致性 (%) | 92.300 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA02G404600 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:102798049-102800908 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to P39: Outer envelope protein 39, chloroplastic | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0030162 regulation of proteolysis 生物过程 GO:1900057 positive regulation of leaf senescence 生物过程 GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009536 plastid 细胞组分 GO:0009707 chloroplast outer membrane 细胞组分 GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分 GO:0015267 channel activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G44160 ath:AT3G48620 ath:AT5G19620 dosa:Os02g0196300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.737
线粒体0.118
细胞质0.084
溶酶体／液泡0.066
细胞膜0.041
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01103Omp8555-358 aaPF03865ShlB252-321 aaPF03865ShlB328-354 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G404600 | PF01103 | Omp85 | 55 | 358 | 3.4e-29 | 103.1 |
| TkA02G404600 | PF03865 | ShlB | 252 | 321 | 0.08 | 13.1 |
| TkA02G404600 | PF03865 | ShlB | 328 | 354 | 0.08 | 13.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q5PP51 | 拟南芥 | sp|Q5PP51|SP2_ARATH Protein SUPPRESSOR OF PPI1 LOCUS 2, chloroplastic | 71.300% | Swiss-Prot | 高置信 |
F4JF35 | 拟南芥 | sp|F4JF35|OEP36_ARATH Outer envelope protein 36, chloroplastic | 56.400% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9C5J8 | 拟南芥 | sp|Q9C5J8|OEP80_ARATH Outer envelope protein 80, chloroplastic | 37.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
A2X208 | 水稻 | sp|A2X208|OEP80_ORYSI Outer envelope protein 80, chloroplastic | 36.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q6H7M7 | 水稻 | sp|Q6H7M7|OEP80_ORYSJ Outer envelope protein 80, chloroplastic | 36.200% | Swiss-Prot | 中等置信 |