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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G472480
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 120570279-120571920 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1551 bp · TkA02G472480|TK1151|cDNA

ATGTCTTCGTCAATCGAATCCAAAATCGCCATGGCCAAAACAGTCGTTTCCACCATCGGATCAGTCGCCGCGGCGGCAATGGTGGCTCGCAGCGTCGCACGCGAGTACTTGCCTTCAGAATTACGGGATTACTTCTATTTAAGCTTCAGAAATTTCATCTACAAGTTCTCCACGCACTTAACCATGGTTATTTACGAAACTGACGGGTTTCTGGAAAGCGAGATTTACAACGCTGCACAGCTTTACCTTGCTGCCCAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1551 bp · TkA02G472480|TK1151|CDS

ATGTCTTCGTCAATCGAATCCAAAATCGCCATGGCCAAAACAGTCGTTTCCACCATCGGATCAGTCGCCGCGGCGGCAATGGTGGCTCGCAGCGTCGCACGCGAGTACTTGCCTTCAGAATTACGGGATTACTTCTATTTAAGCTTCAGAAATTTCATCTACAAGTTCTCCACGCACTTAACCATGGTTATTTACGAAACTGACGGGTTTCTGGAAAGCGAGATTTACAACGCTGCACAGCTTTACCTTGCTGCCCAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

516 aa · TkA02G472480|TK1151|PROTEIN

MSSSIESKIAMAKTVVSTIGSVAAAAMVARSVAREYLPSELRDYFYLSFRNFIYKFSTHLTMVIYETDGFLESEIYNAAQLYLAAQSSLEIHRMKITKHRSEKNISVAMEINEEFVDVYNGVKFKWSLVSKKTPTREYYGDHVMGGSSRSETRMLELTFHRKHKDLALNTYIPFILNVSKTRKREDKCVKLFTVNATMMRPDGSTVWSSVNLDHPSNFATLAMETDVKEKLMKDLDRFLQRREYYRKVGKAWKRGYLLYG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G472480
TK1151 IDTkA02G472480
OH-1004 IDLXL04_013776
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)90.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G472480
位置Chr02:120570279-120571920 (-)
描述Similar to HSR4: Protein HYPER-SENSITIVITY-RELATED 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g50930 蛋白 HYPER-SENSITIVITY-RELATED 4。 暂无已核实直接文献
At3g50940 AAA-ATP酶 At3g50940。 暂无已核实直接文献
At2g18193 AAA-ATP酶 At2g18193。 暂无已核实直接文献
At2g18190 AAA-ATP酶 At2g18190。 暂无已核实直接文献
At5g17760 AAA-ATP酶 At5g17760。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013776 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009411 response to UV 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005740 mitochondrial envelope 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G18193
ath:AT3G50930
ath:AT3G50940
ath:AT5G17730
ath:AT5G17740
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.300
排名 1 · TkA02G472480 · TK1151
细胞核0.263
排名 2 · TkA02G472480 · TK1151
线粒体0.185
排名 3 · TkA02G472480 · TK1151
质体0.123
排名 4 · TkA02G472480 · TK1151
过氧化物酶体0.073
排名 5 · TkA02G472480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28559TPR_SusR5-117 aa
PF12775AAA_75-33 aa
PF14363AAA_assoc37-129 aa
PF01637ATPase_257-120 aa
PF13476AAA_2392-173 aa
PF13521AAA_2895-131 aa
PF10159MMtag123-166 aa
PF05673DUF815205-313 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G472480PF28559TPR_SusR51170.0008519.6
TkA02G472480PF12775AAA_75330.0613.6
TkA02G472480PF14363AAA_assoc371294.8e-2278.9
TkA02G472480PF01637ATPase_2571200.01615.7
TkA02G472480PF13476AAA_23921730.08714.2
TkA02G472480PF13521AAA_28951310.01216.5
TkA02G472480PF10159MMtag1231661.79.7
TkA02G472480PF05673DUF8152053130.0002121.2
TkA02G472480PF25568AAA_lid_At3g285402262345.9e-2484.5
TkA02G472480PF24883NPHP3_N2382790.0514.5
TkA02G472480PF13191AAA_162452780.0001822.8
TkA02G472480PF12775AAA_72532930.0613.6
TkA02G472480PF13555AAA_292542750.006716.9
TkA02G472480PF00004AAA2563951.6e-1971.3
TkA02G472480PF05496RuvB_N2563140.0005720.4
TkA02G472480PF13086AAA_112563040.001619.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZG2拟南芥sp|Q8VZG2|HSR4_ARATH Protein HYPER-SENSITIVITY-RELATED 456.400%Swiss-Prot高置信
Q147F9拟南芥sp|Q147F9|AATPC_ARATH AAA-ATPase At3g5094053.300%Swiss-Prot高置信
Q8GW96拟南芥sp|Q8GW96|AATP3_ARATH AAA-ATPase At2g1819347.600%Swiss-Prot中等置信
F4IQG2拟南芥sp|F4IQG2|AATP2_ARATH AAA-ATPase At2g1819046.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FN75拟南芥sp|Q9FN75|AATPI_ARATH AAA-ATPase At5g1776045.400%Swiss-Prot中等置信

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