TkA02G511260 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G511260

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 131278004-131279499 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

946 bp · TkA02G511260|TK1151|cDNA

TTTTTCGGCAAAAGAGGTTGAACTTGTGCTCATTTCGCGCAGATAAAAGCAGTTAACACTCTATACCAAAGGAGAGACTAACCATCAACGATGGAAATGCAAATGGACTTCGATCGTCTTCATCAGTTCGAGAACGTTCGCCGCGCTGCGGAAGCCACCTATGCCAAAACCCCTCTCGATACCGAGAACCTAACCAGATGGGGAGGGTCTTTACTTGAACTGTCGACATTCCAGAGTGTAGATGAAGCGAAGACTATGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

600 bp · TkA02G511260|TK1151|CDS

ATGGAAATGCAAATGGACTTCGATCGTCTTCATCAGTTCGAGAACGTTCGCCGCGCTGCGGAAGCCACCTATGCCAAAACCCCTCTCGATACCGAGAACCTAACCAGATGGGGAGGGTCTTTACTTGAACTGTCGACATTCCAGAGTGTAGATGAAGCGAAGACTATGATTAAAGATGCTATATCAAAACTGGATGAAGCATTGTCCATTGATCCAAAAAAACACGATGCATTGTGGTGCATGGGTAATGCTCAAACTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

199 aa · TkA02G511260|TK1151|PROTEIN

MEMQMDFDRLHQFENVRRAAEATYAKTPLDTENLTRWGGSLLELSTFQSVDEAKTMIKDAISKLDEALSIDPKKHDALWCMGNAQTSYGFLSPDKDAAKSYFDSAFTYFQKAVNEDPGNELYQKSFDVATKAPLLHEELLKQNLGQQAGAGSSTSSNARGLKTQMNSDMMYDICGWAILAVSIVVWVGFAKANVPPAPQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G511260`
TK1151 ID	TkA02G511260
OH-1004 ID	LXL04_013214
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	98.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.985 / OH-1004 70.111 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G511260

位置 Chr02:131278004-131279499 (+)

描述 Similar to TOM20: Mitochondrial import receptor subunit TOM20

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g27080`	受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。	暂无已核实直接文献
`At1g27390`	受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。	暂无已核实直接文献
`At5g40930`	受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: A2WYG9`	受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013214 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程

GO:0015031 protein transport 生物过程

GO:0045040 protein insertion into mitochondrial outer membrane 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分

GO:0005742 mitochondrial outer membrane translocase complex 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005744 TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G27390

ath:AT3G27080

ath:AT5G40930

dosa:Os01g0921600

sot:102603648

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.490

排名 1 · TkA02G511260 · TK1151

质体0.191

排名 2 · TkA02G511260 · TK1151

细胞质0.140

排名 3 · TkA02G511260 · TK1151

内质网0.097

排名 4 · TkA02G511260 · TK1151

细胞核0.078

排名 5 · TkA02G511260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06552TOM20_plant7-191 aa

PF14559TPR_1919-32 aa

PF21033RMD1-356-129 aa

PF13414TPR_1158-85 aa

PF07719TPR_258-73 aa

PF14559TPR_1958-79 aa

PF13414TPR_1194-111 aa

PF07719TPR_2102-119 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G511260	`PF06552`	TOM20_plant	7	191	4.2e-80	268.7
TkA02G511260	`PF14559`	TPR_19	19	32	0.017	16.1
TkA02G511260	`PF21033`	RMD1-3	56	129	8.3e-05	22.6
TkA02G511260	`PF13414`	TPR_11	58	85	0.001	19.4
TkA02G511260	`PF07719`	TPR_2	58	73	0.003	18.3
TkA02G511260	`PF14559`	TPR_19	58	79	0.017	16.1
TkA02G511260	`PF13414`	TPR_11	94	111	0.001	19.4
TkA02G511260	`PF07719`	TPR_2	102	119	0.003	18.3
TkA02G511260	`PF14559`	TPR_19	102	119	0.017	16.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P82874`	拟南芥	sp\|P82874\|TO203_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-3	50.500%	Swiss-Prot	高置信
`P82873`	拟南芥	sp\|P82873\|TO202_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-2	49.000%	Swiss-Prot	中等置信
`P82805`	拟南芥	sp\|P82805\|TO204_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-4	49.700%	Swiss-Prot	中等置信
`A2WYG9`	水稻	sp\|A2WYG9\|TOM20_ORYSI Probable mitochondrial import receptor subunit TOM20	46.600%	Swiss-Prot	中等置信

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