ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 7 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA03G456760
Chr03:114055627-114058724 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033401
Chr07:42978416-42981004 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
96.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00168 | TkA03G456760 |
|
TkA03G457560
Chr03:114200680-114204955 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033402
Chr07:43009417-43012632 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
98.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00168 | TkA03G457560 |
|
TkA03G458350
Chr03:114424763-114430841 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_029409
Chr06:89326980-89332866 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.700 查询 100.000 / 对象 99.419 |
TkA03G458350 | |
|
TkA03G460390
Chr03:114900802-114901299 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009657
Chr02:130786200-130786700 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G460390 |
|
TkA03G467460
Chr03:116715021-116717438 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009742
Chr02:132395646-132397677 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 91.667 / 对象 73.925 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G467460 |
|
TkA03G467560
Chr03:116786432-116789222 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009743
Chr02:132465425-132467784 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G467560 |
|
TkA03G468340
Chr03:117031112-117035436 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009749
Chr02:132564496-132568528 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 91.987 / 对象 71.605 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G468340 |
|
TkA03G473440
Chr03:118337110-118338492 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_017084
Chr03:140791106-140792492 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.600 查询 91.071 / 对象 100.000 |
TkA03G473440 | |
|
TkA03G479400
Chr03:119841161-119844413 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009863
Chr02:135153523-135155590 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G479400 |
|
TkA03G480280
Chr03:120106993-120109435 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009888
Chr02:135399915-135402356 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G480280 |
|
TkA03G483000
Chr03:120796022-120798529 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009923
Chr02:135997306-135999551 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.700 查询 74.843 / 对象 94.275 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G483000 |
|
TkA03G483020
Chr03:120799871-120800469 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009924
Chr02:136000892-136001520 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.500 查询 93.143 / 对象 88.108 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G483020 |
|
TkA03G487730
Chr03:122047279-122050188 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009982
Chr02:137215273-137217610 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G487730 |
|
TkA03G489720
Chr03:122746920-122748425 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010018
Chr02:137925116-137925981 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.400 查询 81.991 / 对象 73.729 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G489720 |
|
TkA03G490300
Chr03:122932386-122933274 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010024
Chr02:138177151-138177663 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.600 查询 75.806 / 对象 82.941 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G490300 |
|
TkA03G491740
Chr03:123265060-123268083 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010032
Chr02:138528172-138530971 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 76.316 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G491740 |
|
TkA03G493320
Chr03:123696473-123699926 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_038087
Chr09:31048996-31056180 (-)
CM104807.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 100.000 / 对象 72.796 |
TkA03G493320 | |
|
TkA03G494360
Chr03:124033975-124037402 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010074
Chr02:139375227-139386950 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G494360 |
|
TkA03G499580
Chr03:125405396-125408388 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010118
Chr02:140490980-140493298 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.000 查询 100.000 / 对象 76.441 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G499580 |
|
TkA03G500830
Chr03:125740537-125742065 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010125
Chr02:140650908-140652436 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G500830 |
|
TkA03G502750
Chr03:126221273-126227261 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010146
Chr02:141042079-141047888 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G502750 |
|
TkA03G508350
Chr03:127423662-127427215 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010158
Chr02:141249968-141252764 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.600 查询 86.667 / 对象 73.864 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G508350 |
|
TkA03G513170
Chr03:128735531-128737464 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010232
Chr02:142629895-142631559 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 98.165 / 对象 75.887 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G513170 |
|
TkA03G514870
Chr03:129176801-129177610 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010252
Chr02:143147792-143148601 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G514870 |
|
TkA03G515970
Chr03:129434635-129435111 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010260
Chr02:143386611-143387087 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G515970 |
|
TkA03G516220
Chr03:129514873-129516477 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010264
Chr02:143475955-143477101 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.000 查询 100.000 / 对象 77.612 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G516220 |
|
TkA03G516930
Chr03:129692001-129693462 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010283
Chr02:143657971-143661278 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 71.648 / 对象 98.942 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G516930 |
|
TkA03G517340
Chr03:129792442-129794083 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010289
Chr02:143715252-143716853 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 97.423 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G517340 |
|
TkA03G518800
Chr03:130183344-130185706 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010315
Chr02:144078061-144080538 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 99.608 / 对象 91.135 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G518800 |
|
TkA03G523720
Chr03:131436604-131437542 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010376
Chr02:145486960-145487898 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G523720 |
|
TkA03G525380
Chr03:131853875-131855227 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010392
Chr02:145978827-145979809 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G525380 |
|
TkA03G526110
Chr03:132077984-132079961 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010412
Chr02:146211333-146213007 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.100 查询 95.473 / 对象 77.592 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G526110 |
|
TkA03G526170
Chr03:132091534-132093916 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010414
Chr02:146225195-146226904 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G526170 |
|
TkA03G532480
Chr03:133924400-133927071 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010518
Chr02:148198454-148200742 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.900 查询 97.286 / 对象 77.667 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G532480 |
|
TkA03G535210
Chr03:134680070-134683979 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010547
Chr02:148885790-148889053 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.900 查询 97.189 / 对象 90.706 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G535210 |
|
TkA03G536130
Chr03:134924194-134926157 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010575
Chr02:149287229-149288642 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G536130 |
|
TkA03G536680
Chr03:135064376-135064699 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010599
Chr02:149497806-149498225 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 76.978 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G536680 |
|
TkA03G541180
Chr03:136295183-136309155 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010654
Chr02:150859179-150872968 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G541180 |
|
TkA03G541710
Chr03:136424418-136427379 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010659
Chr02:151000591-151001913 (+)
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|
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