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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G569210
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 144364142-144367687 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2428 bp · TkA03G569210|TK1151|cDNA

CCCAAGTTGACCATTTTTATTTTTAGGAATAAACCATTTCACGGGTTCGTAAGGCGCACGTTAACATTACAAGCGAATTTGCTCTCTCGATTAAATGGCGGAGATCCCTTTTGCTCGATTAACGTAAAACAGCATATGATATTGAGTTGATTGGGAGGTGTAATTTCTCAATCTTTTTTGAGAAATCAACCCGACCCGACCTCGGTTCTGAATTCTGCAGATTGAGAAAACAGAACAAGAATGGATTCAATTTCAACTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1788 bp · TkA03G569210|TK1151|CDS

ATGGATTCAATTTCAACTTATAACAGCAACGTTATTAATCCAGAGCTGGTGCGCTTTCACGAGGGTACCACTTCGGATTCCAAAGATATGGGAGAGATCGGAATCTCCATGGAAATTCTAACTAAAGTAGACCTCCAGTTGGCATACGCATCAGAGAAATTACTAAATTTGGAAAGTCTTTTGTTATACGTATTATCATGGGAAAACGACTTTGAAGCCATAGATTCTGACGATGTCTCAGTGGAATTCGTTGAAAAATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

595 aa · TkA03G569210|TK1151|PROTEIN

MDSISTYNSNVINPELVRFHEGTTSDSKDMGEIGISMEILTKVDLQLAYASEKLLNLESLLLYVLSWENDFEAIDSDDVSVEFVEKSLTVDLLFSFVDSEVKELDRSMDSIRVDLLDAHRRVSSCKHLGELYTVVEGKLNDSGDSLKQSQEHVLEMKMKLAKLQMTSFAFDHNECFSEDFQVSDLDSKPKLQTIDKVHVLRMLEKSLSRELDLEKKLTESKQNEEDLKLKLRLTEQVAFIMEEAAEVVWGRFLEAENSSV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G569210
TK1151 IDTkA03G569210
OH-1004 IDLXL04_011153
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.496 / OH-1004 79.617
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G569210
位置Chr03:144364142-144367687 (+)
描述Similar to WIT2: WPP domain-interacting tail-anchored protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68910 与 WIT1 一起，是根尖中 RANGAP 蛋白核膜对接所必需的。
Plant nuclear shape is independently determined by the SUN-WIP-WIT2-myosin XI-i complex and CRWN1.2015 · DOI: 10.1080/19491034.2014.1003512
At5g11390 与WIT2一起，在根尖需要用于RANGAP蛋白的核膜停靠。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011153 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000132 establishment of mitotic spindle orientation 生物过程
GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007077 mitotic nuclear membrane disassembly 生物过程
GO:0007097 nuclear migration 生物过程
GO:0007528 neuromuscular junction development 生物过程
GO:0010457 centriole-centriole cohesion 生物过程
GO:0031116 positive regulation of microtubule polymerization 生物过程
GO:0031122 cytoplasmic microtubule organization 生物过程
GO:0032402 melanosome transport 生物过程
GO:0034454 microtubule anchoring at centrosome 生物过程
GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68910
ath:AT5G11390
hsa:1639
rno:29167
ssc:100519249
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.603
排名 1 · TkA03G569210 · TK1151
细胞核0.238
排名 2 · TkA03G569210 · TK1151
细胞膜0.153
排名 3 · TkA03G569210 · TK1151
高尔基体0.083
排名 4 · TkA03G569210 · TK1151
质体0.073
排名 5 · TkA03G569210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26581WIT1_2_N35-170 aa
PF05377FlaC_arch98-135 aa
PF23991DUF731098-112 aa
PF05739SNARE99-123 aa
PF08614ATG16100-164 aa
PF07544Med9100-128 aa
PF23649FKBP15124-162 aa
PF00261Tropomyosin133-133 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G569210PF26581WIT1_2_N351702.1e-46157.9
TkA03G569210PF05377FlaC_arch981350.03915.1
TkA03G569210PF23991DUF7310981125.48.3
TkA03G569210PF05739SNARE991230.4211.2
TkA03G569210PF08614ATG161001640.02115.7
TkA03G569210PF07544Med91001280.3511.7
TkA03G569210PF23649FKBP151241623e-0524.4
TkA03G569210PF00261Tropomyosin1331330.001119.2
TkA03G569210PF10779XhlA1351590.02315.6
TkA03G569210PF30677CCDC18_1st1391640.003417.4
TkA03G569210PF05557MAD1482290.001617.6
TkA03G569210PF24627PUMA_CC1521680.001219.5
TkA03G569210PF23649FKBP151952373e-0524.4
TkA03G569210PF30677CCDC18_1st1982370.003417.4
TkA03G569210PF05266DUF7241992470.009816.5
TkA03G569210PF19220Rod_CreS2002221.9e-0524.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A8MQR0拟南芥sp|A8MQR0|WIT2_ARATH WPP domain-interacting tail-anchored protein 240.300%Swiss-Prot中等置信
Q8L7E5拟南芥sp|Q8L7E5|WIT1_ARATH WPP domain-interacting tail-anchored protein 131.200%Swiss-Prot中等置信

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