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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G594360
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 150940827-150943841 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1301 bp · TkA03G594360|TK1151|cDNA

CCGTCTAATCGTTGCCACCTATACATGTGAGCCACATATCATATAGATATCACCGTTCATATTCATATATACATTATACATACATGCCCCTTTTCCCATTTTCTTCGAGAATTTTTTGGGGAAATCAAAATTAAATCATGGGTGTCGATTACTACAACATACTCAAAGTCAATCGCACGGTTAGCGATGAAGATTTGAAGAAAGCATACAAGAAATTGGCCATGAAATGGCATCCTGACAAGAACATTGCTTCCACTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

834 bp · TkA03G594360|TK1151|CDS

ATGGGTGTCGATTACTACAACATACTCAAAGTCAATCGCACGGTTAGCGATGAAGATTTGAAGAAAGCATACAAGAAATTGGCCATGAAATGGCATCCTGACAAGAACATTGCTTCCACTGATGATAAAGTAGCTGAATCCAAGTTTAAGCAGATATCGGAGGCGTATTATGTCCTCAGCGACCCTAAAAAGCGCCAGATCTATGATTCATACGGGGAGGAAGGTCTCAAATCAGGCCAATTTGATGAATCGTCTCCTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

277 aa · TkA03G594360|TK1151|PROTEIN

MGVDYYNILKVNRTVSDEDLKKAYKKLAMKWHPDKNIASTDDKVAESKFKQISEAYYVLSDPKKRQIYDSYGEEGLKSGQFDESSPTYKGTTKSTSRFRFDPRDADEIFAEFFYGSDGGGGGGGGRKKGNPGGVLKNSNQKSVRKAETVENKLSCSLEELYKGSKRKMQISRIVLDDSGKPGTLEEILPIHIKPGWKKGTKITFPEKGNQEPGAAPGDLIFVVDEKPHDTFKRDGNDLVFTKRITLLEALTGKNNQGSDP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G594360
TK1151 IDTkA03G594360
OH-1004 IDLXL04_011505
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.336 / OH-1004 76.435
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G594360
位置Chr03:150940827-150943841 (-)
描述Similar to Dnajb4: DnaJ homolog subfamily B member 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011505 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0050821 protein stabilization 生物过程
GO:0090084 negative regulation of inclusion body assembly 生物过程
GO:1903334 positive regulation of protein folding 生物过程
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
bta:538426
bta:541274
dme:Dmel_CG10578
mmu:67035
pon:100174554
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.456
排名 1 · TkA03G594360 · TK1151
细胞核0.264
排名 2 · TkA03G594360 · TK1151
内质网0.209
排名 3 · TkA03G594360 · TK1151
线粒体0.124
排名 4 · TkA03G594360 · TK1151
细胞膜0.105
排名 5 · TkA03G594360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00226DnaJ4-69 aa
PF30945NFKBIL1_C16-54 aa
PF25184YxzE102-124 aa
PF01556DnaJ_C150-254 aa
PF00226DnaJ192-214 aa
PF25184YxzE244-272 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G594360PF00226DnaJ4694e-2588.4
TkA03G594360PF30945NFKBIL1_C16540.02215.3
TkA03G594360PF25184YxzE1021240.1314.0
TkA03G594360PF01556DnaJ_C1502542e-2693.6
TkA03G594360PF00226DnaJ1922144e-2588.4
TkA03G594360PF25184YxzE2442720.1314.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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