ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 5 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA02G527470
Chr02:136020657-136021268 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012944
Chr03:21378378-21379506 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.400 查询 100.000 / 对象 75.758 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G527470 |
|
TkA02G527710
Chr02:136097681-136100125 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012938
Chr03:21294904-21297284 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.200 查询 90.594 / 对象 77.215 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G527710 |
|
TkA02G530740
Chr02:136846876-136849167 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012916
Chr03:20802467-20804615 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 97.297 / 对象 71.186 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G530740 |
|
TkA02G534450
Chr02:137766264-137767920 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012870
Chr03:20089512-20090891 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G534450 |
|
TkA02G537510
Chr02:138630723-138631846 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012802
Chr03:19105509-19105964 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.800 查询 93.865 / 对象 96.689 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537510 |
|
TkA02G537580
Chr02:138652638-138653150 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012798
Chr03:19066588-19067100 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537580 |
|
TkA02G537640
Chr02:138665920-138666417 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012797
Chr03:19054576-19055073 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537640 |
|
TkA02G537980
Chr02:138743579-138744450 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012791
Chr03:18952819-18957193 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
95.900 查询 88.843 / 对象 76.289 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537980 |
|
TkA02G537990
Chr02:138745319-138749777 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012789
Chr03:18944509-18948784 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.300 查询 99.898 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537990 |
|
TkA02G540340
Chr02:139392313-139394125 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012746
Chr03:18095508-18097239 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G540340 |
|
TkA02G541150
Chr02:139624373-139627947 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012730
Chr03:17932340-17934854 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G541150 |
|
TkA02G544660
Chr02:140451135-140453136 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012697
Chr03:17192541-17194688 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 98.312 / 对象 83.083 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G544660 |
|
TkA02G546120
Chr02:140868435-140871000 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012674
Chr03:16682198-16684574 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.800 查询 88.475 / 对象 76.774 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G546120 |
|
TkA02G547450
Chr02:141262908-141266429 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012648
Chr03:16230965-16234371 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.700 查询 98.489 / 对象 97.587 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G547450 |
|
TkA02G550370
Chr02:141992537-141997713 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012607
Chr03:15474176-15479012 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.500 查询 100.000 / 对象 97.306 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G550370 |
|
TkA02G550460
Chr02:142024052-142029887 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012605
Chr03:15453861-15458763 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 99.053 / 对象 94.316 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G550460 |
|
TkA02G551200
Chr02:142232866-142240004 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012592
Chr03:15238359-15247981 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.100 查询 99.859 / 对象 93.183 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551200 |
|
TkA02G551520
Chr02:142312418-142315416 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012583
Chr03:15126562-15128769 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G551520 |
|
TkA02G554600
Chr02:143112105-143112419 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012528
Chr03:13988046-13988477 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.700 查询 87.500 / 对象 78.448 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G554600 |
|
TkA02G558080
Chr02:144167653-144172195 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012489
Chr03:13150761-13153393 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G558080 |
|
TkA02G558570
Chr02:144319297-144320502 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012481
Chr03:12884144-12887449 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 100.000 / 对象 75.660 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G558570 |
|
TkA02G561370
Chr02:144982925-144983419 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012439
Chr03:12250102-12250638 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.400 查询 87.582 / 对象 81.461 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G561370 |
|
TkA02G563800
Chr02:145607103-145614221 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_006995
Chr02:33060449-33066134 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00074 | TkA02G563800 |
|
TkA02G564390
Chr02:145746767-145749628 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_007000
Chr02:33252269-33254680 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00074 | TkA02G564390 |
|
TkA02G564400
Chr02:145753464-145754404 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_007001
Chr02:33258836-33259989 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 77.987 |
JCVI_TKOH_00074 | TkA02G564400 |
|
TkA02G564410
Chr02:145755113-145756861 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_007002
Chr02:33260588-33262224 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.700 查询 95.820 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00074 | TkA02G564410 |
|
TkA02G564500
Chr02:145782805-145784721 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_007005
Chr02:33334587-33336429 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 96.481 / 对象 99.091 |
JCVI_TKOH_00074 | TkA02G564500 |
|
TkA02G565690
Chr02:146044041-146048168 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_007012
Chr02:33699997-33703537 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00074 | TkA02G565690 |
|
TkA02G566880
Chr02:146461573-146463143 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012471
Chr03:12726010-12726615 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 77.273 / 对象 94.624 |
TkA02G566880 | |
|
TkA02G571390
Chr02:147544593-147546241 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012339
Chr03:10657131-10657796 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00097 | TkA02G571390 |
|
TkA02G572510
Chr02:147833982-147842699 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012295
Chr03:9906132-9907792 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.700 查询 95.380 / 对象 96.944 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G572510 |
|
TkA02G578320
Chr02:149198563-149202119 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012253
Chr03:9113021-9117651 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.200 查询 93.382 / 对象 70.538 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G578320 |
|
TkA02G578610
Chr02:149256363-149258663 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012247
Chr03:9057054-9058278 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.300 查询 89.241 / 对象 72.308 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G578610 |
|
TkA02G580850
Chr02:149852547-149853026 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012217
Chr03:8525578-8526057 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G580850 |
|
TkA02G580930
Chr02:149876000-149876317 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_006376
Chr02:9092714-9096550 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.200 查询 78.095 / 对象 73.585 |
TkA02G580930 | |
|
TkA02G583280
Chr02:150494737-150497591 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012180
Chr03:7901138-7902739 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.300 查询 83.968 / 对象 78.612 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G583280 |
|
TkA02G583660
Chr02:150578296-150579954 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012175
Chr03:7830602-7831941 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 100.000 / 对象 78.099 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G583660 |
|
TkA02G584690
Chr02:150859377-150863629 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012164
Chr03:7578057-7581484 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.600 查询 100.000 / 对象 76.331 |
JCVI_TKOH_00098 | TkA02G584690 |
|
TkA02G585080
Chr02:150968383-150969111 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012155
Chr03:7485560-7486288 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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JCVI_TKOH_00098 | TkA02G585080 |
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