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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 5 / 18 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA02G527470
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CM104801.1
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较可信
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TkA02G527710
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CM104801.1
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较可信
96.200
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较可信
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较可信
90.800
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CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
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较可信
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TkA02G537990
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较可信
92.300
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较可信
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较可信
92.000
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CM104801.1
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较可信
94.000
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CM104801.1
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较可信
90.800
查询 88.475 / 对象 76.774
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CM104801.1
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较可信
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较可信
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CM104801.1
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较可信
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CM104801.1
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较可信
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
91.700
查询 100.000 / 对象 100.000
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较可信
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.300
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CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.400
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JCVI_TKOH_00096 TkA02G561370
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较可信
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CM104800.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00074 TkA02G564390
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
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100.000
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较可信
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较可信
94.800
查询 96.481 / 对象 99.091
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较可信
99.700
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00074 TkA02G565690
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较可信
92.000
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TkA02G566880
TkA02G571390
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91.900
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00097 TkA02G571390
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较可信
90.700
查询 95.380 / 对象 96.944
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较可信
97.200
查询 93.382 / 对象 70.538
JCVI_TKOH_00098 TkA02G578320
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99.300
查询 89.241 / 对象 72.308
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查询 100.000 / 对象 100.000
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Chr02:9092714-9096550 (-)
CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
90.200
查询 78.095 / 对象 73.585
TkA02G580930
TkA02G583280
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较可信
99.300
查询 83.968 / 对象 78.612
JCVI_TKOH_00098 TkA02G583280
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GWHBCHF00000003
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Chr03:7830602-7831941 (-)
CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.500
查询 100.000 / 对象 78.099
JCVI_TKOH_00098 TkA02G583660
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CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.600
查询 100.000 / 对象 76.331
JCVI_TKOH_00098 TkA02G584690
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较可信
94.200
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00098 TkA02G585080
TkA02G589000
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LXL04_012074
Chr03:5901471-5904903 (-)
CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.200
查询 100.000 / 对象 96.988
JCVI_TKOH_00098 TkA02G589000
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LXL04_012067
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94.500
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00098 TkA02G589280
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