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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G030070
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 8060268-8066350 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2652 bp · TkA03G030070|TK1151|cDNA

TTTCTCTTTCACGCACTCTCTCTCTCTCTTTCGAGAAGGCGATTGCAGAGAACACTCAGTACTACTGTAAAAGAGTAACAAAGAGAAAAAAAAGGAAGAGACATAGAAAGAGAAAGACGAAAAACGACAATCAAGCAAGAATTCAAGAACTACGACAACGATATCTCTTTTTCACTATCTTCATAGAGATTGCGTCCAAGAAGATGGTACTGCTGTTATGGAAGTAGCTAGATCTTCATTCGAAGAGGAGCTGCACCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2283 bp · TkA03G030070|TK1151|CDS

ATGGAAGTAGCTAGATCTTCATTCGAAGAGGAGCTGCACCCCAAGAACAAATTCCCCTTCAATTCTATGTCACAAGATTATATTTTCAATTTTTCGCATGGGTTTGAAAGACCGTCGAGTCAAGATCAACAACAGCAGAATCACATCGCGCATCAGATCCGTCGGGATAAGTTAAGGGTCCAAGGCTTTGACACACCATCGGGTAATTCATTGGTGGGATTAGAAGATGACGGAGGTGGTGGCGGAGCCGGCGGTGGGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

760 aa · TkA03G030070|TK1151|PROTEIN

MEVARSSFEEELHPKNKFPFNSMSQDYIFNFSHGFERPSSQDQQQQNHIAHQIRRDKLRVQGFDTPSGNSLVGLEDDGGGGGAGGGLPAVYETGAGMLSEMFNFPTGGPATELLENQINFQRNQRPSAGDWYGNSAQAMQLFLMNPSHDSPSSQSSSHHHHNPSTSSSTLHMLLPNTVASSNSTLHHQQSFGSTSNSGHGQFSPSTQFAWVPPGGTSGGGGGGGDSHGLSLSLSSTLQHLEAAKVEELRIGDDPAAAMLY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G030070
TK1151 IDTkA03G030070
OH-1004 IDLXL04_006383
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 77.971
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G030070
位置Chr03:8060268-8066350 (+)
描述Similar to BLH6: BEL1-like homeodomain protein 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g36870 通过抑制叶片特定亚区的生长来确定叶片形状的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g23760 通过抑制叶片特定亚区的生长来确定叶片形状的转录因子。
The Arabidopsis BEL1-LIKE HOMEODOMAIN proteins SAW1 and SAW2 act redundantly to regulate KNOX expression spatially in leaf margins.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048769
At5g41410 通过与MADS-box因子互作，在胚珠模式形成及珠被特性决定中发挥主要作用。
Homeotic Transformation of Ovules into Carpel-like Structures in Arabidopsis.1994 · DOI: 10.1105/tpc.6.3.333
Genetic and molecular interactions between BELL1 and MADS box factors support ovule development in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.051797
The transcription factors BEL1 and SPL are required for cytokinin and auxin signaling during ovule development in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.100164
At2g35940 BEL1 样同源结构域蛋白 1。 暂无已核实直接文献
At2g16400 BEL1 样同源域蛋白 7。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006383 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0048481 plant ovule development 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19700
ath:AT1G75410
ath:AT2G16400
ath:AT4G34610
ath:AT5G41410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.971
排名 1 · TkA03G030070 · TK1151
细胞质0.093
排名 2 · TkA03G030070 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA03G030070 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkA03G030070 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA03G030070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07526POX109-163 aa
PF00046Homeodomain119-128 aa
PF07526POX313-444 aa
PF02724CDC45368-412 aa
PF05920Homeobox_KN513-552 aa
PF01496V_ATPase_I516-606 aa
PF00046Homeodomain520-552 aa
PF15996PNISR554-618 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G030070PF07526POX1091632.4e-49168.0
TkA03G030070PF00046Homeodomain1191285.2e-0730.1
TkA03G030070PF07526POX3134442.4e-49168.0
TkA03G030070PF02724CDC453684128.25.3
TkA03G030070PF05920Homeobox_KN5135522.3e-1969.6
TkA03G030070PF01496V_ATPase_I5166060.399.3
TkA03G030070PF00046Homeodomain5205525.2e-0730.1
TkA03G030070PF15996PNISR5546180.1812.9
TkA03G030070PF07526POX5636002.4e-49168.0
TkA03G030070PF06020Roughex5646607.56.1
TkA03G030070PF02724CDC455646058.25.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SW80拟南芥sp|Q9SW80|BLH2_ARATH BEL1-like homeodomain protein 248.400%Swiss-Prot中等置信
Q94KL5拟南芥sp|Q94KL5|BLH4_ARATH BEL1-like homeodomain protein 482.000%Swiss-Prot低置信
Q38897拟南芥sp|Q38897|BEL1_ARATH Homeobox protein BEL1 homolog57.000%Swiss-Prot低置信
Q9SJ56拟南芥sp|Q9SJ56|BLH1_ARATH BEL1-like homeodomain protein 149.800%Swiss-Prot低置信
Q9SIW1拟南芥sp|Q9SIW1|BLH7_ARATH BEL1-like homeodomain protein 753.200%Swiss-Prot低置信

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