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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G558080
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 144167653-144172195 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2480 bp · TkA02G558080|TK1151|cDNA

AGTAGATCATAATCATCCATTGTTTTACCCGACGCTTACCAACCCTAGATTTACGCTTTATCTTATATGAATTATTTGAACTCAAAACTATTTTGTTTCTGAATTCTGTCCACTTTTTTCGAATTTGCGTTTACTATAATTGTCGTGCGGAGGATTTGAACCGAAATTTTCGGATTTCAGCTTTGAGTCAAAGATCTGCTCTCGTATCTCCGTTATCAGCTTTAATGCTTCTGTAACGGATTTCTGACGAAAGTTTATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1890 bp · TkA02G558080|TK1151|CDS

ATGAGGAGCGTTGGAGTGAGTACTAGTATTATTCCCGCAACAAAAGGATCCGCAGAACTCAATCACCATAAACGAAAAGAGCTCAAAGAAGTGAGAGATGGACCCGCATTCAACGGCCAAAGGCTGTCTGAAGAAGACGAGTCCAGAATCAATGAAGATGTCAATGGTAATAGGCGCATAGAGTTGGTTACTGTTCATAGACACCATCAACAACCTCAAGGACCTCTGGTTCAATGGGAGCGGTTTCTTCCCATTAGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

629 aa · TkA02G558080|TK1151|PROTEIN

MRSVGVSTSIIPATKGSAELNHHKRKELKEVRDGPAFNGQRLSEEDESRINEDVNGNRRIELVTVHRHHQQPQGPLVQWERFLPIRSLKVLLVDDDDCTRHVVSALLRNCSYEVTAVANGLEAWKVLIDLNKQIDLVLTEVVMPYVSGIGLLTKIMNHAPRKNIPVIMMSSDDSMGIVFNCLSKGAVDFLVKPIRKNELKNLWQHVWRKCHSSSGSESESGIRAHKPINVKSDDVSDDADDDGSDDDDEDDDDDDRSIGL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G558080
TK1151 IDTkA02G558080
OH-1004 IDLXL04_012489
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G558080
位置Chr02:144167653-144172195 (-)
描述Similar to PRR37: Two-component response regulator-like PRR37
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02810 CCA1 和 LHY 的转录抑制因子，以及 LWD1 和 LWD2 表达的正调节因子。
Circadian waves of expression of the APRR1/TOC1 family of pseudo-response regulators in Arabidopsis thaliana: insight into the plant circadian clock.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd043

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YQ93 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
Os07g0695100 可能参与长日照（LD）条件下开花时间调控的转录因子。
Natural variation in OsPRR37 regulates heading date and contributes to rice cultivation at a wide range of latitudes.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst088
Days to heading 7, a major quantitative locus determining photoperiod sensitivity and regional adaptation in rice.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1418204111
Os03g0284100 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XFB7 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012489 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048511 rhythmic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G02810
ath:AT5G60100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.915
排名 1 · TkA02G558080 · TK1151
细胞质0.104
排名 2 · TkA02G558080 · TK1151
细胞膜0.081
排名 3 · TkA02G558080 · TK1151
内质网0.033
排名 4 · TkA02G558080 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA02G558080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29701TP_0454_N88-173 aa
PF00072Response_reg90-201 aa
PF04931DNA_pol_phi233-255 aa
PF28610Glycine-rich_protein_DOT1489-569 aa
PF09425Jas_motif577-601 aa
PF06203CCT578-620 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G558080PF29701TP_0454_N881730.212.2
TkA02G558080PF00072Response_reg902011.5e-2177.4
TkA02G558080PF04931DNA_pol_phi2332552.66.8
TkA02G558080PF28610Glycine-rich_protein_DOT14895690.2811.1
TkA02G558080PF09425Jas_motif5776010.0003920.8
TkA02G558080PF06203CCT5786201.9e-1763.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93WK5拟南芥sp|Q93WK5|APRR7_ARATH Two-component response regulator-like APRR740.600%Swiss-Prot中等置信
A2YQ93水稻sp|A2YQ93|PRR37_ORYSI Two-component response regulator-like PRR3743.300%Swiss-Prot中等置信
Q0D3B6水稻sp|Q0D3B6|PRR37_ORYSJ Two-component response regulator-like PRR3743.100%Swiss-Prot中等置信
Q10N34水稻sp|Q10N34|PRR73_ORYSJ Two-component response regulator-like PRR7344.000%Swiss-Prot中等置信
A2XFB7水稻sp|A2XFB7|PRR73_ORYSI Two-component response regulator-like PRR7344.000%Swiss-Prot中等置信

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