ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 26 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA02G533290
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GWHBCHF00000003
|
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Chr03:20138279-20143423 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 99.855 / 对象 51.949 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G533290 |
|
TkA02G533540
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012876
Chr03:20242251-20243802 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 39.739 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G533540 |
|
TkA02G534080
Chr02:137657184-137664467 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012871
Chr03:20138279-20143423 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 99.873 / 对象 59.520 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G534080 |
|
TkA02G534590
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|
LXL04_012864
Chr03:19963215-19964624 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.200 查询 100.000 / 对象 99.360 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G534590 |
|
TkA02G535410
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|
LXL04_012851
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CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.570 / 对象 9.931 |
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|
TkA02G535420
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|
LXL04_012851
Chr03:19715464-19737046 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 99.516 / 对象 47.156 |
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|
TkA02G535500
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012850
Chr03:19703604-19707019 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 56.258 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G535500 |
|
TkA02G535710
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|
LXL04_012840
Chr03:19617578-19619635 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.279 / 对象 58.848 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G535710 |
|
TkA02G536060
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012832
Chr03:19506202-19517571 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.700 查询 63.720 / 对象 39.954 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G536060 |
|
TkA02G536570
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012821
Chr03:19416219-19416836 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 65.854 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G536570 |
|
TkA02G536580
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012820
Chr03:19413835-19414449 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 62.745 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G536580 |
|
TkA02G537050
Chr02:138472657-138480073 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012817
Chr03:19304568-19311607 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 96.622 / 对象 15.732 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537050 |
|
TkA02G537280
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012813
Chr03:19206670-19207449 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537280 |
|
TkA02G537380
Chr02:138591793-138594067 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012808
Chr03:19165758-19171013 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 99.576 / 对象 60.102 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537380 |
|
TkA02G537410
Chr02:138605005-138606830 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022165
Chr04:145566930-145568742 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.200 查询 98.847 / 对象 88.520 |
TkA02G537410 | |
|
TkA02G537490
Chr02:138625262-138626096 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012804
Chr03:19122015-19126796 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.700 查询 54.676 / 对象 43.407 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537490 |
|
TkA02G537570
Chr02:138646356-138651603 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012799
Chr03:19068370-19068849 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.700 查询 99.363 / 对象 96.855 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G537570 |
|
TkA02G538070
Chr02:138784336-138784811 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012791
Chr03:18952819-18957193 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.000 查询 98.519 / 对象 48.110 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G538070 |
|
TkA02G538630
Chr02:138911990-138913499 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012779
Chr03:18646419-18646845 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 54.717 / 对象 93.548 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G538630 |
|
TkA02G538810
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_027193
Chr06:10799715-10807318 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.100 查询 20.359 / 对象 16.667 |
TkA02G538810 | |
|
TkA02G538900
Chr02:138985130-138986322 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012783
Chr03:18712632-18715837 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 98.885 / 对象 30.575 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G538900 |
|
TkA02G539090
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|
LXL04_012785
Chr03:18724846-18725812 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 85.000 / 对象 38.202 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G539090 |
|
TkA02G539140
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012787
Chr03:18745783-18752335 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00095 | TkA02G539140 |
|
TkA02G539820
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_025517
Chr05:112852584-112853789 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 100.000 / 对象 36.286 |
TkA02G539820 | |
|
TkA02G540680
Chr02:139495190-139497344 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012739
Chr03:18045565-18047275 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 100.000 / 对象 35.242 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G540680 |
|
TkA02G540920
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_012735
Chr03:17999307-17999715 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.700 查询 5.665 / 对象 51.190 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G540920 |
|
TkA02G541100
Chr02:139604915-139608595 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_003522
Chr01:81994558-81997860 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 85.050 / 对象 85.091 |
TkA02G541100 | |
|
TkA02G542040
Chr02:139843017-139844248 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_004324
Chr01:132533345-132540389 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.300 查询 41.538 / 对象 27.621 |
TkA02G542040 | |
|
TkA02G543500
Chr02:140165350-140165991 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_008832
Chr02:109984528-109989971 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 10.051 |
TkA02G543500 | |
|
TkA02G543510
Chr02:140166171-140166771 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_008832
Chr02:109984528-109989971 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 13.091 |
TkA02G543510 | |
|
TkA02G543870
Chr02:140268194-140271572 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012706
Chr03:17392904-17397314 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 38.968 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G543870 |
|
TkA02G543880
Chr02:140271894-140272379 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012706
Chr03:17392904-17397314 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 94.410 / 对象 21.777 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G543880 |
|
TkA02G544050
Chr02:140308983-140312388 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012704
Chr03:17359673-17363297 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 93.088 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G544050 |
|
TkA02G544340
Chr02:140384171-140384598 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_008048
Chr02:82070937-82073193 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 40.070 |
TkA02G544340 | |
|
TkA02G544640
Chr02:140441865-140445390 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012698
Chr03:17201394-17204319 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.573 / 对象 55.602 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G544640 |
|
TkA02G544650
Chr02:140447561-140450161 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_029889
Chr06:102902008-102914798 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 95.798 / 对象 17.091 |
TkA02G544650 | |
|
TkA02G544940
Chr02:140510324-140513375 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012695
Chr03:17132486-17135370 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 55.618 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G544940 |
|
TkA02G544970
Chr02:140532554-140537908 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_016666
Chr03:130396381-130398282 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 92.949 / 对象 38.158 |
TkA02G544970 | |
|
TkA02G545400
Chr02:140645656-140648605 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_012689
Chr03:16966420-16969037 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.800 查询 95.238 / 对象 57.772 |
JCVI_TKOH_00096 | TkA02G545400 |
|
TkA02G545520
Chr02:140692042-140693510 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015080
Chr03:63152946-63154715 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.800 查询 35.294 / 对象 27.638 |
TkA02G545520 | |
|
TkA02G545950
Chr02:140824929-140826423 (+)
GWHBCHF00000003
|
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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