基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_012851
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 19715464-19737046
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA9126 bp · LXL04_012851|LXL04_012851|OH1004|cDNA
ATGGCGGCAGCGATCGCCGGAGATGATCTGGCGAGGTCGATGAGCAGACGGATGAGCTTTTCATCTTCCGGCAGGCGGAGCTGGGCTTCCACTAGTATGAGGGAGGCTTTCTCGGCGGtaacaggtggtggtggtggtgatgcTTTTGCCACAAGTGGGCGGCACGACGATGAAGAGGAGCTCAAATGGGCTGCAATTGAGAGGCTTCCGACTTACGATAGATTAAAGAAAGGAATGTTGAAACAAGTTCTTGATAATGG...
CDS
下载 CDS FASTA9126 bp · LXL04_012851|LXL04_012851|OH1004|CDS
ATGGCGGCAGCGATCGCCGGAGATGATCTGGCGAGGTCGATGAGCAGACGGATGAGCTTTTCATCTTCCGGCAGGCGGAGCTGGGCTTCCACTAGTATGAGGGAGGCTTTCTCGGCGGTAACAGGTGGTGGTGGTGGTGATGCTTTTGCCACAAGTGGGCGGCACGACGATGAAGAGGAGCTCAAATGGGCTGCAATTGAGAGGCTTCCGACTTACGATAGATTAAAGAAAGGAATGTTGAAACAAGTTCTTGATAATGG...
3041 aa · LXL04_012851|LXL04_012851|OH1004|PROTEIN
MAAAIAGDDLARSMSRRMSFSSSGRRSWASTSMREAFSAVTGGGGGDAFATSGRHDDEEELKWAAIERLPTYDRLKKGMLKQVLDNGRIVHQEVDITNLGAQDKKQIIESILKVVEEDNEKFLSRVRARTDRVGIDIPKIQVRYKNLSIEGDVHVGSRALPTLLNATLNTMEGLLRFFKLVPSKKRVVKILSDVSGIVRPSRMTLLLGPPGSGKTTLLRALAGVLESDLRVTGEVTYCGHQMSEFIPQRTCAYISQHDVH...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_012851 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_012851 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:19715464-19737046 (+) |
| 描述 | Similar to PDR2: Pleiotropic drug resistance protein 2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程 GO:0009914 hormone transport 生物过程 GO:0042908 xenobiotic transport 生物过程 GO:2000032 regulation of secondary shoot formation 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能 GO:0140359 ABC-type transporter activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G66950 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.598
内质网0.166
溶酶体／液泡0.128
细胞质0.103
高尔基体0.079
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14510.12ABC_trans_N116-166 aaPF00005.34ABC_tran191-372 aaPF19055.7ABC2_membrane_7406-457 aaPF01061.30ABC2_membrane527-733 aaPF08370.17PDR_assoc738-804 aaPF00005.34ABC_tran868-1020 aaPF19055.7ABC2_membrane_71049-1116 aaPF01061.30ABC2_membrane1165-1378 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_012851 | PF14510.12 | ABC_trans_N | 116 | 166 | 4.4e-15 | 56.5 |
| LXL04_012851 | PF00005.34 | ABC_tran | 191 | 372 | 1.4e-78 | 262.9 |
| LXL04_012851 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 406 | 457 | 8.1e-30 | 104.7 |
| LXL04_012851 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 527 | 733 | 7.4e-176 | 581.8 |
| LXL04_012851 | PF08370.17 | PDR_assoc | 738 | 804 | 1.8e-48 | 162.8 |
| LXL04_012851 | PF00005.34 | ABC_tran | 868 | 1020 | 1.4e-78 | 262.9 |
| LXL04_012851 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 1049 | 1116 | 8.1e-30 | 104.7 |
| LXL04_012851 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 1165 | 1378 | 7.4e-176 | 581.8 |
| LXL04_012851 | PF00005.34 | ABC_tran | 1624 | 1789 | 1.4e-78 | 262.9 |
| LXL04_012851 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 1849 | 1900 | 8.1e-30 | 104.7 |
| LXL04_012851 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 1971 | 2110 | 7.4e-176 | 581.8 |
| LXL04_012851 | PF08370.17 | PDR_assoc | 2211 | 2277 | 1.8e-48 | 162.8 |
| LXL04_012851 | PF00005.34 | ABC_tran | 2337 | 2489 | 1.4e-78 | 262.9 |
| LXL04_012851 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 2518 | 2579 | 8.1e-30 | 104.7 |
| LXL04_012851 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 2634 | 2848 | 7.4e-176 | 581.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。