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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 10 / 18 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA05G052450
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较可信
92.000
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较可信
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CM104802.1
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较可信
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较可信
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较可信
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较可信
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较可信
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JCVI_TKOH_00231 TkA05G074030
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较可信
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较可信
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较可信
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JCVI_TKOH_00231 TkA05G084410
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CM104802.1
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较可信
92.100
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JCVI_TKOH_00231 TkA05G089340
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CM104799.1
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较可信
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TkA05G093370
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较可信
92.900
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104802.1
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较可信
90.300
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CM104802.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.900
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JCVI_TKOH_00232 TkA05G108140
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CM104802.1
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较可信
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JCVI_TKOH_00232 TkA05G110620
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
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CM104801.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.200
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较可信
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较可信
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较可信
94.500
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较可信
97.000
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较可信
91.100
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JCVI_TKOH_00234 TkA05G144100
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TkA05G148580
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较可信
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JCVI_TKOH_00236 TkA05G163600
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查询 100.000 / 对象 99.003
TkA05G178290
TkA05G187690
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CM104801.1
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较可信
90.300
查询 100.000 / 对象 92.414
TkA05G187690
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TkA05G238260
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较可信
97.100
查询 96.043 / 对象 87.302
TkA05G263570
TkA05G297790
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
93.500
查询 100.000 / 对象 100.000
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TkA05G300830
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CM104802.1
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较可信
92.600
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00240 TkA05G300830
TkA05G300940
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CM104802.1
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94.200
查询 99.593 / 对象 71.409
JCVI_TKOH_00240 TkA05G300940
TkA05G301990
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CM104802.1
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较可信
92.000
查询 97.139 / 对象 93.286
JCVI_TKOH_00240 TkA05G301990
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CM104802.1
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较可信
92.800
查询 99.413 / 对象 76.596
JCVI_TKOH_00240 TkA05G302020
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GWHBCHF00000006
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CM104802.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.800
查询 93.607 / 对象 71.057
JCVI_TKOH_00240 TkA05G302030
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较可信
93.300
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00240 TkA05G304290
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CM104802.1
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较可信
98.200
查询 81.618 / 对象 77.622
JCVI_TKOH_00240 TkA05G311600
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.800
查询 100.000 / 对象 93.209
JCVI_TKOH_00240 TkA05G312730
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
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