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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 24458 条。当前显示第 100 / 245 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA03G535390
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TkA03G535790
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
99.500
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
57.900
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TkA03G538570
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
60.300
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TkA03G538650
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复杂
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TkA03G538660
TkA03G538670
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
75.000
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TkA03G538670
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
54.600
查询 85.062 / 对象 80.505
TkA03G538800
TkA03G538830
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复杂
36.300
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TkA03G538830
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
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复杂
47.200
查询 36.301 / 对象 26.768
TkA03G539030
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G539680
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复杂
89.900
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JCVI_TKOH_00147 TkA03G539870
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
76.700
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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复杂
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CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00147 TkA03G545780
TkA03G546000
Chr03:137762793-137763399 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_010743
Chr02:152480584-152481403 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
查询 100.000 / 对象 67.727
JCVI_TKOH_00147 TkA03G546000
TkA03G546020
Chr03:137766245-137766829 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_010744
Chr02:152486389-152487501 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
64.600
查询 90.370 / 对象 74.274
JCVI_TKOH_00147 TkA03G546020
TkA03G546050
Chr03:137773830-137774627 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_032572
Chr07:25693334-25694500 (+)
CM104805.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
41.900
查询 97.000 / 对象 55.249
TkA03G546050
TkA03G546280
Chr03:137831281-137835710 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_026677
Chr06:1348871-1352056 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
82.700
查询 100.000 / 对象 98.718
TkA03G546280
TkA03G546340
Chr03:137844544-137845365 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_010750
Chr02:152556947-152557885 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
91.900
查询 100.000 / 对象 87.500
JCVI_TKOH_00147 TkA03G546340
TkA03G546400
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GWHBCHF00000004
LXL04_009630
Chr02:129982081-129991239 (-)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
52.700
查询 95.492 / 对象 23.213
TkA03G546400
TkA03G546450
Chr03:137884590-137887433 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_037114
Chr08:53404985-53406801 (+)
CM104806.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
46.400
查询 79.096 / 对象 97.623
TkA03G546450
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