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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G541310
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 136348081-136349355 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

906 bp · TkA03G541310|TK1151|cDNA

ATGGGTGCATTACGCATCATCTTCTTCGCCGTCTCACTTCTCGCCGCCGGCTCCGTCGTCACTGCCCACAACATCACGGCTATCTTGTCTAAGTTTCCTGAATACAGCGAATTCAACAACTACCTCTCACAGACAAAGCTTAGCGATGAAATCAACAGCCGTGAAACAATCACAGTTCTGGTGTTAAGCAACGGCGTTGTTTCCTCACTCGCCGCGAAACATCAACTCTCCGTCGTTAAAAGTGTTTTGAGCCTTCATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

906 bp · TkA03G541310|TK1151|CDS

ATGGGTGCATTACGCATCATCTTCTTCGCCGTCTCACTTCTCGCCGCCGGCTCCGTCGTCACTGCCCACAACATCACGGCTATCTTGTCTAAGTTTCCTGAATACAGCGAATTCAACAACTACCTCTCACAGACAAAGCTTAGCGATGAAATCAACAGCCGTGAAACAATCACAGTTCTGGTGTTAAGCAACGGCGTTGTTTCCTCACTCGCCGCGAAACATCAACTCTCCGTCGTTAAAAGTGTTTTGAGCCTTCATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

301 aa · TkA03G541310|TK1151|PROTEIN

MGALRIIFFAVSLLAAGSVVTAHNITAILSKFPEYSEFNNYLSQTKLSDEINSRETITVLVLSNGVVSSLAAKHQLSVVKSVLSLHILLDYYDNKKLHAISDGTTLSTTLYQTTGNSPGNVGFVNITDLKGGKVGFGSAVPGSKLDSSYTKSVKQIPYNISVLTAGDSVTLDSGVATSRLASTVLDSTPLCIFTVDNVLLPTELFGKSPSPAPSLSPETSPSSAPAPAALSPEPAAAPSPFLSPPAPPTSSPSAGPAPSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G541310
TK1151 IDTkA03G541310
OH-1004 IDLXL04_022722
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 54.153 / OH-1004 37.825
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G541310
位置Chr03:136348081-136349355 (-)
描述Similar to FLA10: Fasciclin-like arabinogalactan protein 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g60900 可能是一种细胞表面粘附蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g45470 可能是一种细胞表面粘附蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g55730 可能是一种细胞表面粘附蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g12730 可能是一种细胞表面粘附蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g12660 可能是一种细胞表面粘附蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022722 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0098552 side of membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G45470
ath:AT3G12660
ath:AT3G60900
ath:AT4G12730
ath:AT5G55730
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.492
排名 1 · TkA03G541310 · TK1151
细胞外0.249
排名 2 · TkA03G541310 · TK1151
内质网0.151
排名 3 · TkA03G541310 · TK1151
细胞质0.091
排名 4 · TkA03G541310 · TK1151
溶酶体／液泡0.048
排名 5 · TkA03G541310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30735DUF87147-89 aa
PF24384Ig_TMM6226-73 aa
PF02469Fasciclin34-110 aa
PF20381Rv147647-72 aa
PF06679DUF1180102-154 aa
PF02469Fasciclin159-201 aa
PF27998ArabinogalactanP199-281 aa
PF06679DUF1180225-288 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G541310PF30735DUF87147890.02514.2
TkA03G541310PF24384Ig_TMM6226730.02215.1
TkA03G541310PF02469Fasciclin341101.9e-0835.3
TkA03G541310PF20381Rv147647720.1812.2
TkA03G541310PF06679DUF11801021542.59.3
TkA03G541310PF02469Fasciclin1592011.9e-0835.3
TkA03G541310PF27998ArabinogalactanP1992810.0001422.9
TkA03G541310PF06679DUF11802252882.59.3
TkA03G541310PF20381Rv14762662970.1812.2
TkA03G541310PF02469Fasciclin2762921.9e-0835.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZX4拟南芥sp|Q9LZX4|FLA10_ARATH Fasciclin-like arabinogalactan protein 1045.000%Swiss-Prot中等置信
O22126拟南芥sp|O22126|FLA8_ARATH Fasciclin-like arabinogalactan protein 847.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FM65拟南芥sp|Q9FM65|FLA1_ARATH Fasciclin-like arabinogalactan protein 150.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SU13拟南芥sp|Q9SU13|FLA2_ARATH Fasciclin-like arabinogalactan protein 252.400%Swiss-Prot低置信
Q9LTW9拟南芥sp|Q9LTW9|FLA14_ARATH Fasciclin-like arabinogalactan protein 1449.700%Swiss-Prot中等置信

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