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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G542230
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 136567206-136569220 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1379 bp · TkA03G542230|TK1151|cDNA

TTTCGTAAGTTCCCCCTAACAAAATTCGATTTAAATCAGATTTAGCAAGAAAATCTTCAATGGCGTCTTGTTCAACATCATCCATCCAGAAAAACTTTAAGTATCATGTGTTCTTAAGCTTTAGAGGAGAAGACACACACAAGACCTTCGTTGATCATCTTTACGCTTCTCTTAAGCAAAAAGGTATTCACACCTTCAGGGATAACGAGGAACTGGAGAAAGGAAAAAAGATCGATCAACTCTTTAAAGCCATTGAAGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1320 bp · TkA03G542230|TK1151|CDS

ATGGCGTCTTGTTCAACATCATCCATCCAGAAAAACTTTAAGTATCATGTGTTCTTAAGCTTTAGAGGAGAAGACACACACAAGACCTTCGTTGATCATCTTTACGCTTCTCTTAAGCAAAAAGGTATTCACACCTTCAGGGATAACGAGGAACTGGAGAAAGGAAAAAAGATCGATCAACTCTTTAAAGCCATTGAAGAGTCGAGGTTCTTTATCATAGTTTTCTCCCAAAACTATGCATCTTCTTCTTGGTGCTTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

440 aa · TkA03G542230|TK1151|PROTEIN

MASCSTSSIQKNFKYHVFLSFRGEDTHKTFVDHLYASLKQKGIHTFRDNEELEKGKKIDQLFKAIEESRFFIIVFSQNYASSSWCLKEVTKIMECQDGNQQIAYPLFYDVEPSNIRYQTGPVGTTIAKHKTKKQIKEWEKALESAGNLVGWDLKNIANGHEAEAIDQTVKEISLKLRSIHLVNDENLIGMDRRMKDLESSLGIGLNDKTRMIGIKGMGGIGKTTIARAIFDIVSSHFEGSIFVEDVREISKKKGLESLQE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G542230
TK1151 IDTkA03G542230
OH-1004 IDLXL04_010641
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 41.470
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G542230
位置Chr03:136567206-136569220 (+)
描述Similar to RPV1: Disease resistance protein RPV1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12010 参与植物防御的 TIR-NB-LRR 受体样蛋白。
Matching NLR Immune Receptors to Autoimmunity in camta3 Mutants Using Antimorphic NLR Alleles.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.03.005

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010641 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
GO:0050135 NADP+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0061809 NAD+ nucleosidase activity, cyclic ADP-ribose generating 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.397
排名 1 · TkA03G542230 · TK1151
细胞膜0.370
排名 2 · TkA03G542230 · TK1151
细胞核0.148
排名 3 · TkA03G542230 · TK1151
内质网0.114
排名 4 · TkA03G542230 · TK1151
溶酶体／液泡0.046
排名 5 · TkA03G542230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00931NB-ARC7-73 aa
PF01582TIR14-179 aa
PF13676TIR_217-112 aa
PF00004AAA31-69 aa
PF01637ATPase_238-73 aa
PF20720nSTAND355-77 aa
PF04851ResIII58-76 aa
PF08968DUF1885115-193 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G542230PF00931NB-ARC7731.6e-2487.1
TkA03G542230PF01582TIR141796.6e-46157.1
TkA03G542230PF13676TIR_2171123.9e-1763.6
TkA03G542230PF00004AAA31690.1413.4
TkA03G542230PF01637ATPase_238730.1113.1
TkA03G542230PF20720nSTAND355770.02814.8
TkA03G542230PF04851ResIII58760.1113.1
TkA03G542230PF08968DUF18851151930.1313.0
TkA03G542230PF26856Phage_SPO1_gp511271420.113.4
TkA03G542230PF13676TIR_21331683.9e-1763.6
TkA03G542230PF04851ResIII1602520.1113.1
TkA03G542230PF13191AAA_161882400.008317.4
TkA03G542230PF00931NB-ARC2063611.6e-2487.1
TkA03G542230PF25199nSTAND_NTPase52062330.02615.1
TkA03G542230PF20720nSTAND32072510.02814.8
TkA03G542230PF01637ATPase_22072700.1113.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZ66拟南芥sp|Q9SZ66|DSC1_ARATH Disease resistance-like protein DSC138.200%Swiss-Prot中等置信

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