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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G544190
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 137229399-137233425 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1849 bp · TkA03G544190|TK1151|cDNA

GAAAGTCTCGCCGTTCAACATCTTCGGGGCTTCTCCAACATCTCTCCTCACTCGAGCAGAGATGCCAGGGCCAACAGTGGAGTTGGAGCTACCAGTGGAACCACAATCGCTGAAGAAGCTCAGCCTTAAATCCCTAAAACGGGCTCTCGATCTCTTTTCTCCTGTTCACTCTCAGTTCCCTCCTCCCGACCCCGAAAGCAAGAAGATACGGTTGAGCCTTAAGCTACACGTTGAGTATGGTGGAATCAAAAGCGTTCCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1422 bp · TkA03G544190|TK1151|CDS

ATGCCAGGGCCAACAGTGGAGTTGGAGCTACCAGTGGAACCACAATCGCTGAAGAAGCTCAGCCTTAAATCCCTAAAACGGGCTCTCGATCTCTTTTCTCCTGTTCACTCTCAGTTCCCTCCTCCCGACCCCGAAAGCAAGAAGATACGGTTGAGCCTTAAGCTACACGTTGAGTATGGTGGAATCAAAAGCGTTCCAAATCAGCCTAACAAAAGTTCCTCACAAAATCAAGCTGCACCTTCAAGCTCAAATGCTCTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

473 aa · TkA03G544190|TK1151|PROTEIN

MPGPTVELELPVEPQSLKKLSLKSLKRALDLFSPVHSQFPPPDPESKKIRLSLKLHVEYGGIKSVPNQPNKSSSQNQAAPSSSNALVLSEASKKGDLTTTTPVQTKNLGDGTSSGKSISIISSHGTSERNLSTAALMERIPSRWPRPAWHAPWKNYRVISGHLGWVRSIAFDPSNQWFCTGSADRTIKIWDVGTGRLRLTLTGHIEQVRGLAVSTRHTYMFSAGDDKLVKCWDLEQNKVIRSYHGHLSGVYCLALHPTID...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G544190
TK1151 IDTkA03G544190
OH-1004 IDLXL04_024463
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 29.387 / OH-1004 37.746
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G544190
位置Chr03:137229399-137233425 (+)
描述Similar to At4g06676: Protein EI24 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g15900 葡萄糖、应激和激素反应的多效调节剂。
Regulatory interaction of PRL1 WD protein with Arabidopsis SNF1-like protein kinases.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.9.5322
SKP1-SnRK protein kinase interactions mediate proteasomal binding of a plant SCF ubiquitin ligase.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.11.2742
Regulation of plant innate immunity by three proteins in a complex conserved across the plant and animal kingdoms.2007 · DOI: 10.1101/gad.1559607
Signaling from an altered cell wall to the nucleus mediates sugar-responsive growth and development in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.049965
Characterization of Arabidopsis and rice DWD proteins and their roles as substrate receptors for CUL4-RING E3 ubiquitin ligases.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.055418
Modulation of O-mediated retrograde signaling by the PLEIOTROPIC RESPONSE LOCUS 1 (PRL1) protein, a central integrator of stress and energy signaling.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03935.x
Pleiotropic regulatory locus 1 (PRL1) integrates the regulation of sugar responses with isoprenoid metabolism in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1093/mp/ssp100
Pleiotropic control of glucose and hormone responses by PRL1, a nuclear WD protein, in Arabidopsis.1998 · DOI: 10.1101/gad.12.19.3059
At3g16650 多效性调节因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024463 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0006396 RNA processing 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010215 cellulose microfibril organization 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16650
ath:AT3G43300
ath:AT4G06676
ath:AT4G15900
mmu:53317
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.763
排名 1 · TkA03G544190 · TK1151
细胞质0.251
排名 2 · TkA03G544190 · TK1151
细胞膜0.043
排名 3 · TkA03G544190 · TK1151
线粒体0.026
排名 4 · TkA03G544190 · TK1151
溶酶体／液泡0.023
排名 5 · TkA03G544190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25178Beta-prop_WDR41150-296 aa
PF25174Beta-prop_THOC3153-261 aa
PF00400WD40154-191 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz154-218 aa
PF25391WD40_Gbeta154-295 aa
PF24105Beta-prop_CAF1B_HIR1154-196 aa
PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd154-234 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz156-283 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G544190PF25178Beta-prop_WDR411502961.4e-1557.7
TkA03G544190PF25174Beta-prop_THOC31532617e-42144.0
TkA03G544190PF00400WD401541911.5e-49165.0
TkA03G544190PF24807WD40_CDC20-Fz1542182.5e-40139.3
TkA03G544190PF25391WD40_Gbeta1542952.4e-2796.6
TkA03G544190PF24105Beta-prop_CAF1B_HIR11541965.9e-2382.2
TkA03G544190PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd1542341.2e-1764.7
TkA03G544190PF24807WD40_CDC20-Fz1562832.5e-40139.3
TkA03G544190PF25047Beta-prop_TEP1_2nd1562521.9e-1867.3
TkA03G544190PF25168Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd1571979.7e-2588.2
TkA03G544190PF23869Beta-prop_WDR75_1st1571956.8e-1246.0
TkA03G544190PF30552CFAP251_N1571987.5e-0832.6
TkA03G544190PF25173Beta-prop_WDR3_1st1582761.1e-51175.9
TkA03G544190PF24814WD40_Prp191582814.4e-48164.5
TkA03G544190PF25172Beta-prop_WDR3_2nd1582754.7e-33115.4
TkA03G544190PF23419WD40_RFWD31581943.5e-1040.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42384拟南芥sp|Q42384|PRL1_ARATH Protein pleiotropic regulatory locus 179.700%Swiss-Prot高置信
Q39190拟南芥sp|Q39190|PRL2_ARATH Protein pleiotropic regulator PRL263.800%Swiss-Prot高置信

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