ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 6 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA03G088680
Chr03:22562313-22562795 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_006916
Chr02:29806348-29807475 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 76.000 |
JCVI_TKOH_00127 | TkA03G088680 |
|
TkA03G097050
Chr03:24603993-24604952 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_006968
Chr02:32558744-32562405 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 89.270 |
JCVI_TKOH_00127 | TkA03G097050 |
|
TkA03G100980
Chr03:25506164-25507731 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_006954
Chr02:31961706-31962875 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 99.491 / 对象 99.486 |
JCVI_TKOH_00127 | TkA03G100980 |
|
TkA03G102660
Chr03:26238088-26240801 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_006979
Chr02:32819146-32820758 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.200 查询 76.817 / 对象 98.886 |
JCVI_TKOH_00127 | TkA03G102660 |
|
TkA03G104570
Chr03:26769354-26770226 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007029
Chr02:34100075-34101043 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.100 查询 100.000 / 对象 90.062 |
JCVI_TKOH_00128 | TkA03G104570 |
|
TkA03G118110
Chr03:30187920-30189190 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025813
Chr05:117247948-117248803 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118110 |
|
TkA03G118700
Chr03:30330888-30331265 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025809
Chr05:117089826-117090203 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118700 |
|
TkA03G118710
Chr03:30333653-30335513 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025808
Chr05:117080188-117081278 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 96.165 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118710 |
|
TkA03G118720
Chr03:30336244-30342778 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025807
Chr05:117076198-117078660 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118720 |
|
TkA03G118940
Chr03:30371243-30372221 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025805
Chr05:117045595-117046257 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118940 |
|
TkA03G118950
Chr03:30373954-30377360 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025804
Chr05:117040294-117043319 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 99.819 / 对象 99.819 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118950 |
|
TkA03G118960
Chr03:30379268-30384595 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025803
Chr05:117032918-117038266 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G118960 |
|
TkA03G119200
Chr03:30434834-30436575 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025793
Chr05:116977633-116978856 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 97.340 / 对象 89.926 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G119200 |
|
TkA03G119940
Chr03:30642099-30646416 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025770
Chr05:116780064-116783260 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G119940 |
|
TkA03G120360
Chr03:30793815-30795543 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025758
Chr05:116657153-116658479 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00155 | TkA03G120360 |
|
TkA03G128900
Chr03:33084323-33087665 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007711
Chr02:57605671-57606775 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.200 查询 100.000 / 对象 70.000 |
TkA03G128900 | |
|
TkA03G129970
Chr03:33353748-33355977 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007169
Chr02:38062758-38064123 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00130 | TkA03G129970 |
|
TkA03G134270
Chr03:34421601-34422387 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_002288
Chr01:45290834-45291620 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00115 | TkA03G134270 |
|
TkA03G147940
Chr03:37670466-37672304 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007251
Chr02:41138437-41140277 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.300 查询 78.829 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00131 | TkA03G147940 |
|
TkA03G151330
Chr03:38427211-38429624 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007308
Chr02:43557356-43559774 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 74.238 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G151330 |
|
TkA03G153730
Chr03:39007939-39009558 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007313
Chr02:44019406-44021387 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 95.444 / 对象 83.626 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G153730 |
|
TkA03G154320
Chr03:39158377-39158811 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007315
Chr02:44197836-44198335 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 95.833 / 对象 99.296 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G154320 |
|
TkA03G157130
Chr03:39839510-39842582 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007326
Chr02:44351781-44354530 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.200 查询 98.742 / 对象 92.421 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G157130 |
|
TkA03G158060
Chr03:40081059-40096553 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007334
Chr02:44607553-44622763 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G158060 |
|
TkA03G158730
Chr03:40241613-40243907 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007374
Chr02:45882836-45886770 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.600 查询 100.000 / 对象 98.778 |
TkA03G158730 | |
|
TkA03G159140
Chr03:40344322-40349267 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007379
Chr02:46122767-46127964 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 79.487 |
TkA03G159140 | |
|
TkA03G162220
Chr03:41138038-41143546 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007357
Chr02:45396416-45402772 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.600 查询 100.000 / 对象 97.146 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G162220 |
|
TkA03G169030
Chr03:42827670-42828083 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007400
Chr02:46636098-46636702 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 78.286 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G169030 |
|
TkA03G169860
Chr03:43047430-43048320 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007389
Chr02:46415958-46416947 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.900 查询 100.000 / 对象 89.970 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G169860 |
|
TkA03G179360
Chr03:45255440-45259399 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007460
Chr02:49116694-49119566 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 96.795 / 对象 84.615 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G179360 |
|
TkA03G186610
Chr03:46997760-47000506 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007524
Chr02:51253318-51254134 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 98.540 / 对象 75.419 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G186610 |
|
TkA03G197190
Chr03:49503937-49507007 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007614
Chr02:54203463-54206193 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 97.938 / 对象 76.000 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G197190 |
|
TkA03G197620
Chr03:49616846-49620294 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007622
Chr02:54362832-54365668 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.400 查询 96.401 / 对象 77.374 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G197620 |
|
TkA03G208990
Chr03:52484027-52486285 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007706
Chr02:57328721-57330689 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00132 | TkA03G208990 |
|
TkA03G213240
Chr03:53479402-53481412 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007821
Chr02:63389214-63390814 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.500 查询 100.000 / 对象 88.732 |
JCVI_TKOH_00134 | TkA03G213240 |
|
TkA03G234990
Chr03:58511420-58511731 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007872
Chr02:69354777-69355088 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00134 | TkA03G234990 |
|
TkA03G238670
Chr03:59379193-59380313 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007909
Chr02:74084239-74086580 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 100.000 / 对象 74.194 |
JCVI_TKOH_00135 | TkA03G238670 |
|
TkA03G244290
Chr03:60798656-60800227 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007923
Chr02:75199991-75202550 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.900 查询 100.000 / 对象 72.800 |
JCVI_TKOH_00135 | TkA03G244290 |
|
TkA03G254730
Chr03:63122473-63122924 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007998
Chr02:79260507-79261438 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 76.101 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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