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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 6 / 18 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA03G088680
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
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较可信
94.700
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JCVI_TKOH_00127 TkA03G097050
TkA03G100980
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CM104800.1
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较可信
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JCVI_TKOH_00127 TkA03G100980
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CM104800.1
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较可信
91.200
查询 76.817 / 对象 98.886
JCVI_TKOH_00127 TkA03G102660
TkA03G104570
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
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CM104803.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00155 TkA03G118700
TkA03G118710
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 96.165
JCVI_TKOH_00155 TkA03G118710
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.800
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CM104803.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
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较可信
100.000
查询 99.819 / 对象 99.819
JCVI_TKOH_00155 TkA03G118950
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较可信
99.700
查询 100.000 / 对象 100.000
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 97.340 / 对象 89.926
JCVI_TKOH_00155 TkA03G119200
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.400
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104803.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00155 TkA03G120360
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较可信
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TkA03G128900
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.800
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00130 TkA03G129970
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00115 TkA03G134270
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较可信
98.300
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JCVI_TKOH_00131 TkA03G147940
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 74.238
JCVI_TKOH_00132 TkA03G151330
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.300
查询 95.444 / 对象 83.626
JCVI_TKOH_00132 TkA03G153730
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较可信
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查询 95.833 / 对象 99.296
JCVI_TKOH_00132 TkA03G154320
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较可信
94.200
查询 98.742 / 对象 92.421
JCVI_TKOH_00132 TkA03G157130
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
97.500
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00132 TkA03G158060
TkA03G158730
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较可信
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TkA03G158730
TkA03G159140
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 79.487
TkA03G159140
TkA03G162220
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.600
查询 100.000 / 对象 97.146
JCVI_TKOH_00132 TkA03G162220
TkA03G169030
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 78.286
JCVI_TKOH_00132 TkA03G169030
TkA03G169860
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.900
查询 100.000 / 对象 89.970
JCVI_TKOH_00132 TkA03G169860
TkA03G179360
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GWHBCHF00000004
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.700
查询 96.795 / 对象 84.615
JCVI_TKOH_00132 TkA03G179360
TkA03G186610
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 98.540 / 对象 75.419
JCVI_TKOH_00132 TkA03G186610
TkA03G197190
Chr03:49503937-49507007 (-)
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LXL04_007614
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 97.938 / 对象 76.000
JCVI_TKOH_00132 TkA03G197190
TkA03G197620
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
91.400
查询 96.401 / 对象 77.374
JCVI_TKOH_00132 TkA03G197620
TkA03G208990
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.100
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00132 TkA03G208990
TkA03G213240
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GWHBCHF00000004
LXL04_007821
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
90.500
查询 100.000 / 对象 88.732
JCVI_TKOH_00134 TkA03G213240
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
93.200
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00134 TkA03G234990
TkA03G238670
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.800
查询 100.000 / 对象 74.194
JCVI_TKOH_00135 TkA03G238670
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
98.900
查询 100.000 / 对象 72.800
JCVI_TKOH_00135 TkA03G244290
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 76.101
JCVI_TKOH_00137 TkA03G254730
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.900
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00138 TkA03G275360
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.800
查询 98.485 / 对象 83.219
JCVI_TKOH_00139 TkA03G287420
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