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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G405530
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 100839015-100848128 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5252 bp · TkA03G405530|TK1151|cDNA

ACAGGCTCCCTTAAAAGGGCATCACATGTACCTTGGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGTAACAGTATCAAAGGAGAGGCCAGGAAAACTTCAGAAATCCACAAATAGAGATTGCTCCCAAGACACACTCTTATCCTTCTATCGTCATCTTCATATATCTTTACACTTCAACCAATTATTCACTAATTTCTCATATGGCATTTTCAATCAGCCATTGACGAAACCTCCTTCCATTTTAAATTTACTGAAACAATAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

3330 bp · TkA03G405530|TK1151|CDS

ATGGCACCAAGGTCGAGCAGAGGAAAAGGAAACAAAACCAAAGCTGATAAGAAGAAGAAGGAAGAGAAAGTTGTTCCTAGTGTTCTGGACATAACAATAATCACTCCTTATGAAACTCAAGTTATACTCAAGGGCATCTCCACAGACAAAATCCTCGACGTGAAGAAATTACTAGCTGTTAATGTCGATACTTGCCATCCAACCAACTATTCTCTCTCTCACGAGGTTAAAGGAGCAAAGTTGAATGATAGGTTGGATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1109 aa · TkA03G405530|TK1151|PROTEIN

MAPRSSRGKGNKTKADKKKKEEKVVPSVLDITIITPYETQVILKGISTDKILDVKKLLAVNVDTCHPTNYSLSHEVKGAKLNDRLDLVSLKPCVLKMVEEDYTDEAHAVAHVRRLLDIVASTTRFGKPKTKRVTTGAGGEARSKKGRSQNVQVTAGRPVSSLSDGGETVENGGSSETETTATATSPVSENLDMAAIHPVPKLSDFYEFFSFSNLSPPILQLKRVDPQDAQEKREGDHFEMQIKICNGKLFQVVASTKGFY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G405530
TK1151 IDTkA03G405530
OH-1004 IDLXL04_009176
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.820 / OH-1004 71.883
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G405530
位置Chr03:100839015-100848128 (+)
描述Similar to TSS: Protein TSS
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15290 可能作为蛋白复合物的支架，富集对分生组织 G2 到 M 转变所需的关键因子（相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At4g28080 通过整合发育信号与碳源可用性，负向调控分生组织的增殖。 暂无已核实直接文献
At1g01320 可能作为蛋白复合物的支架，富集对分生组织 G2 到 M 转变所需的关键因子（相似性推测）。
REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE genes from Arabidopsis thaliana help to establish the size of the chloroplast compartment.2016 · DOI: 10.1073/pnas.1515741113
At3g52140 mRNA结合蛋白，参与线粒体在细胞质中的正确分布（通过相似性预测）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009176 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000266 mitochondrial fission 生物过程
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0008053 mitochondrial fusion 生物过程
GO:0010636 positive regulation of mitochondrial fusion 生物过程
GO:0010906 regulation of glucose metabolic process 生物过程
GO:0019750 chloroplast localization 生物过程
GO:0048312 intracellular distribution of mitochondria 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01320
ath:AT1G15290
ath:AT3G52140
ath:AT4G28080
ddi:DDB_G0292806
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.522
排名 1 · TkA03G405530 · TK1151
细胞核0.241
排名 2 · TkA03G405530 · TK1151
高尔基体0.158
排名 3 · TkA03G405530 · TK1151
细胞膜0.137
排名 4 · TkA03G405530 · TK1151
内质网0.112
排名 5 · TkA03G405530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15044CLU_N48-119 aa
PF10824T7SS_ESX_EspC136-195 aa
PF25695BKRF4524-640 aa
PF12807eIF3_p135607-607 aa
PF12807eIF3_p135691-784 aa
PF03735ENT731-780 aa
PF12807eIF3_p135793-831 aa
PF15044CLU_N803-832 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G405530PF15044CLU_N481199.5e-0833.1
TkA03G405530PF10824T7SS_ESX_EspC1361950.1213.6
TkA03G405530PF25695BKRF45246400.3711.5
TkA03G405530PF12807eIF3_p1356076076.9e-2795.3
TkA03G405530PF12807eIF3_p1356917846.9e-2795.3
TkA03G405530PF03735ENT7317800.07313.8
TkA03G405530PF12807eIF3_p1357938316.9e-2795.3
TkA03G405530PF15044CLU_N8038329.5e-0833.1
TkA03G405530PF13181TPR_88658870.08313.8
TkA03G405530PF07719TPR_28688882.2e-0834.3
TkA03G405530PF13424TPR_128699327.5e-30103.7
TkA03G405530PF17874TPR_MalT8719730.004217.1
TkA03G405530PF00515TPR_18718870.1612.5
TkA03G405530PF13374TPR_108728961.5e-2485.9
TkA03G405530PF24885TPR_NPHP38729711.5e-1144.9
TkA03G405530PF13424TPR_129019717.5e-30103.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HZK4拟南芥sp|F4HZK4|REC3_ARATH Protein REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 361.500%Swiss-Prot高置信
F4JKH6拟南芥sp|F4JKH6|REC2_ARATH Protein REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 260.900%Swiss-Prot高置信
F4HS99拟南芥sp|F4HS99|REC1_ARATH Protein REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 155.300%Swiss-Prot高置信
F4J5S1拟南芥sp|F4J5S1|CLU_ARATH Clustered mitochondria protein30.800%Swiss-Prot低置信

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