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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 24458 条。当前显示第 95 / 245 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA03G466580
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TkA03G466580
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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TkA03G467620
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TkA03G467810
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复杂
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复杂
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TkA03G467960
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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复杂
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复杂
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TkA03G469750
TkA03G469930
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复杂
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TkA03G469930
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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TkA03G470220
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复杂
99.600
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
81.500
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TkA03G470990
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复杂
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复杂
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TkA03G471210
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复杂
54.100
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TkA03G471210
TkA03G471460
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
86.500
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TkA03G471460
TkA03G471470
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复杂
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复杂
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TkA03G471810
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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复杂
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TkA03G471880
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
99.000
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CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
98.600
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79.300
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复杂
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90.300
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TkA03G481960
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GWHBCHF00000004
LXL04_000799
Chr01:14790239-14793227 (-)
CM104799.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
60.200
查询 86.508 / 对象 32.639
TkA03G481960
TkA03G481970
Chr03:120545190-120545738 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_009910
Chr02:135801323-135801868 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
74.000
查询 80.822 / 对象 85.083
JCVI_TKOH_00147 TkA03G481970
TkA03G481990
Chr03:120556692-120557033 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_006738
Chr02:23762463-23766486 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
88.500
查询 100.000 / 对象 28.321
TkA03G481990
TkA03G482050
Chr03:120574146-120576229 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_031750
Chr07:10686171-10687825 (+)
CM104805.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
28.900
查询 50.000 / 对象 62.570
TkA03G482050
TkA03G482060
Chr03:120576664-120578115 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_020129
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CM104802.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
40.100
查询 67.568 / 对象 53.091
TkA03G482060
TkA03G482140
Chr03:120595701-120599411 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_009914
Chr02:135859661-135863390 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
查询 100.000 / 对象 89.293
JCVI_TKOH_00147 TkA03G482140
TkA03G482230
Chr03:120613118-120615960 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_027151
Chr06:9690659-9698622 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
41.400
查询 100.000 / 对象 56.444
TkA03G482230
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