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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G469710
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 117386151-117387178 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

645 bp · TkA03G469710|TK1151|cDNA

ATGGTGAGGGCACCTTTTTTTGACAAAAATGGAATGAAAAAAGGTGCTTGGAGTGATGAAGAAGATGGCAAGCTGAAAGCCTATATAGAGAAAAACGGCCATAGGAACTGGCGTAAACTTCCCAAGTTAGCCGGGTTATCAAGATGTGGAAAGAGTTGCAGACTCAGATGGGTGAATTATCTTCGTCCGCAAGTGAAGCGTGGAAACTACACAAGTGAAGAAGAAGATCTCATAATTAACTTACATAGAAATCATGGCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

645 bp · TkA03G469710|TK1151|CDS

ATGGTGAGGGCACCTTTTTTTGACAAAAATGGAATGAAAAAAGGTGCTTGGAGTGATGAAGAAGATGGCAAGCTGAAAGCCTATATAGAGAAAAACGGCCATAGGAACTGGCGTAAACTTCCCAAGTTAGCCGGGTTATCAAGATGTGGAAAGAGTTGCAGACTCAGATGGGTGAATTATCTTCGTCCGCAAGTGAAGCGTGGAAACTACACAAGTGAAGAAGAAGATCTCATAATTAACTTACATAGAAATCATGGCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

214 aa · TkA03G469710|TK1151|PROTEIN

MVRAPFFDKNGMKKGAWSDEEDGKLKAYIEKNGHRNWRKLPKLAGLSRCGKSCRLRWVNYLRPQVKRGNYTSEEEDLIINLHRNHGSRWSMIAAKLPGRSDNEIKNHWHTHLNEKTEVDQMVLADVCSKSSSTNNKQTSLKAYNGAYYMASNWSLLSNNESFEDFWTKPFFPDSSSDEYLAVSTNLVEYVSLSGDHDSFMVDSYLWSVMDLYGW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G469710
TK1151 IDTkA03G469710
OH-1004 IDLXL04_012163
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)74.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 54.206 / OH-1004 56.039
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G469710
位置Chr03:117386151-117387178 (-)
描述Similar to MYB4: Transcription factor MYB4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16490 转录激活因子，结合 DNA 上的 AC 顺式元件 5'-ACCTACC-3'、5'-ACCAACC-3' 和 5'-ACCTAAC-3' 的启动子，并在 SND1 介导的次级细胞壁形成过程中特异性激活木质素生物合成基因。
MYB58 and MYB63 are transcriptional activators of the lignin biosynthetic pathway during secondary cell wall formation in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.063321
At3g12820 参与金属离子稳态，包括通过调节NAS4和NAS2基因表达获得铁离子（Fe）。 暂无已核实直接文献
At3g23250 转录因子，参与CBF基因的低温调控以及抗冻能力的发育。
A R2R3 type MYB transcription factor is involved in the cold regulation of CBF genes and in acquired freezing tolerance.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m605895200
Transgenic expression of MYB15 confers enhanced sensitivity to abscisic acid and improved drought tolerance in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1016/s1673-8527(09)60003-5
At1g79180 转录激活因子，结合 DNA 上的 AC 顺式元件 5'-ACCTACC-3'、5'-ACCAACC-3' 和 5'-ACCTAAC-3' 的启动子，并在 SND1 介导的次级细胞壁形成过程中特异性激活木质素生物合成基因。
MYB58 and MYB63 are transcriptional activators of the lignin biosynthetic pathway during secondary cell wall formation in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.063321

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0517100 参与低温胁迫反应的转录激活因子。
Overexpression of the rice Osmyb4 gene increases chilling and freezing tolerance of Arabidopsis thaliana plants.2004 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01938.x
Supra-optimal expression of the cold-regulated OsMyb4 transcription factor in transgenic rice changes the complexity of transcriptional network with major effects on stress tolerance and panicle development.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2010.02221.x
The rice Osmyb4 gene enhances tolerance to frost and improves germination under unfavourable conditions in transgenic barley plants.2012 · DOI: 10.1007/s13353-011-0081-x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012163 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G31180
ath:AT3G23250
ath:AT4G21440
ath:AT4G28110
dosa:Os04g0517100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.947
排名 1 · TkA03G469710 · TK1151
细胞质0.139
排名 2 · TkA03G469710 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA03G469710 · TK1151
线粒体0.012
排名 4 · TkA03G469710 · TK1151
内质网0.011
排名 5 · TkA03G469710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15963Myb_DNA-bind_712-25 aa
PF00249Myb_DNA-binding14-61 aa
PF13921Myb_DNA-bind_617-75 aa
PF15963Myb_DNA-bind_766-117 aa
PF00249Myb_DNA-binding67-112 aa
PF13921Myb_DNA-bind_671-116 aa
PF04177TAP42133-167 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G469710PF15963Myb_DNA-bind_712250.00916.5
TkA03G469710PF00249Myb_DNA-binding14614.8e-34116.9
TkA03G469710PF13921Myb_DNA-bind_617751.9e-2073.5
TkA03G469710PF15963Myb_DNA-bind_7661170.00916.5
TkA03G469710PF00249Myb_DNA-binding671124.8e-34116.9
TkA03G469710PF13921Myb_DNA-bind_6711161.9e-2073.5
TkA03G469710PF04177TAP421331670.1412.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SA47拟南芥sp|Q9SA47|MYB58_ARATH Transcription factor MYB5859.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LTV4拟南芥sp|Q9LTV4|MYB10_ARATH Transcription factor MYB1059.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LTC4拟南芥sp|Q9LTC4|MYB15_ARATH Transcription factor MYB1550.600%Swiss-Prot高置信
Q6R0A6拟南芥sp|Q6R0A6|MYB63_ARATH Transcription factor MYB6366.400%Swiss-Prot中等置信
Q7XBH4水稻sp|Q7XBH4|MYB4_ORYSJ Transcription factor MYB464.400%Swiss-Prot中等置信

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