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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G469750
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 117394225-117395633 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1142 bp · TkA03G469750|TK1151|cDNA

GTTCTTCAAACCTATTATCTAGATAGAATTAATTCTAGAAGAACTGGTTGCACAAAAATGGTGAGGGCACCTTATTTCGACAAAGATGGAGTAAAAAAAGGAGCATGGAGCGAATCTGAAGATCAACAGTTGAGATCATATATCGAGAAAAACGGTTATTCAAACTGGCGCAAGCTCCCCAAGTTAGCCGGGTTATCAAGATGTGGAAAGAGTTGCCGGCTTAGATGGATGAATTATCTTGATCCAACTATAAATCGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

804 bp · TkA03G469750|TK1151|CDS

ATGGTGAGGGCACCTTATTTCGACAAAGATGGAGTAAAAAAAGGAGCATGGAGCGAATCTGAAGATCAACAGTTGAGATCATATATCGAGAAAAACGGTTATTCAAACTGGCGCAAGCTCCCCAAGTTAGCCGGGTTATCAAGATGTGGAAAGAGTTGCCGGCTTAGATGGATGAATTATCTTGATCCAACTATAAATCGAGGAAATTACACCGACAAAGAAGAAGCTCTAATCATCAGCTTACACCGCACTCTTGGCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

267 aa · TkA03G469750|TK1151|PROTEIN

MVRAPYFDKDGVKKGAWSESEDQQLRSYIEKNGYSNWRKLPKLAGLSRCGKSCRLRWMNYLDPTINRGNYTDKEEALIISLHRTLGNKWSKIAAELPGRSDNDVKNHWHTHLRKRVITPNSPIRVSNSGHELVPSPKCSTKEKCVLEGSDLKDRDEVELLITVLSSDQSSYDANNEQQSPSSWSSSLDQVGWNSYSPEVVSNEEPVNDYWSIMGDDIFMEHMDLMVGNYDGSLTSGHDTIMIGDCLWQSVQFCGNDTCGD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G469750
TK1151 IDTkA03G469750
OH-1004 IDLXL04_025453
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)49.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.775 / OH-1004 92.760
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G469750
位置Chr03:117394225-117395633 (-)
描述Similar to MYB4: Transcription factor MYB4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g17785 转录因子MYB39。 暂无已核实直接文献
At3g12820 参与金属离子稳态，包括通过调节NAS4和NAS2基因表达获得铁离子（Fe）。 暂无已核实直接文献
At1g56160 参与金属离子稳态，包括通过调节NAS4和NAS2基因表达获得铁离子（Fe）。
Expression differences for genes involved in lignin, glutathione and sulphate metabolism in response to cadmium in Arabidopsis thaliana and the related Zn/Cd-hyperaccumulator Thlaspi caerulescens.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2007.01764.x
MYB72 is required in early signaling steps of rhizobacteria-induced systemic resistance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.113829
MYB72, a node of convergence in induced systemic resistance triggered by a fungal and a bacterial beneficial microbe.2009 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2008.00162.x
β-Glucosidase BGLU42 is a MYB72-dependent key regulator of rhizobacteria-induced systemic resistance and modulates iron deficiency responses in Arabidopsis roots.2014 · DOI: 10.1111/nph.12980
At3g23250 转录因子，参与CBF基因的低温调控以及抗冻能力的发育。
A R2R3 type MYB transcription factor is involved in the cold regulation of CBF genes and in acquired freezing tolerance.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m605895200
Transgenic expression of MYB15 confers enhanced sensitivity to abscisic acid and improved drought tolerance in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1016/s1673-8527(09)60003-5
At2g31180 转录激活剂，通过影响 CBF 基因的表达来调节耐冻性。
AtMYB14 Regulates Cold Tolerance in Arabidopsis. 2013 · DOI: 10.1007/s11105-012-0481-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025453 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009411 response to UV 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009809 lignin biosynthetic process 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0050826 response to freezing 生物过程
GO:2000652 regulation of secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G79180
ath:AT2G31180
ath:AT3G23250
dosa:Os02g0624300
dosa:Os04g0517100
osa:4330027
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.953
排名 1 · TkA03G469750 · TK1151
细胞质0.128
排名 2 · TkA03G469750 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA03G469750 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA03G469750 · TK1151
质体0.013
排名 5 · TkA03G469750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding14-61 aa
PF13921Myb_DNA-bind_617-76 aa
PF00249Myb_DNA-binding67-112 aa
PF13921Myb_DNA-bind_671-114 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G469750PF00249Myb_DNA-binding14611.4e-34118.6
TkA03G469750PF13921Myb_DNA-bind_617762.9e-2176.1
TkA03G469750PF00249Myb_DNA-binding671121.4e-34118.6
TkA03G469750PF13921Myb_DNA-bind_6711142.9e-2176.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GWP0拟南芥sp|Q8GWP0|MYB39_ARATH Transcription factor MYB3963.600%Swiss-Prot低置信
Q9LTV4拟南芥sp|Q9LTV4|MYB10_ARATH Transcription factor MYB1063.500%Swiss-Prot低置信
Q9SGU3拟南芥sp|Q9SGU3|MYB72_ARATH Transcription factor MYB7260.500%Swiss-Prot低置信
Q9LTC4拟南芥sp|Q9LTC4|MYB15_ARATH Transcription factor MYB1565.500%Swiss-Prot低置信
Q9SJX8拟南芥sp|Q9SJX8|MYB14_ARATH Transcription factor MYB1464.700%Swiss-Prot低置信

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