同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00195

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00195

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00195 Chr04 51320466-55324787 Chr08 160356-4674941 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00195`	Chr04:51320466-55324787	Chr08:160356-4674941	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA04G199410 → LXL04_034820

97.7%

TkA04G199430 → LXL04_034823

99.2%

TkA04G200360 → LXL04_034825

99.4%

TkA04G201920 → LXL04_034826

92.8%

TkA04G201930 → LXL04_034827

99.3%

TkA04G202200 → LXL04_034828

99.7%

TkA04G203020 → LXL04_034842

95.3%

TkA04G203570 → LXL04_034840

94.0%

TkA04G204340 → LXL04_034847

98.6%

TkA04G205570 → LXL04_034810

99.1%

TkA04G208830 → LXL04_034793

99.6%

TkA04G209320 → LXL04_034794

98.2%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA04G199410`	`LXL04_034820`	`JCVI_TKOH_00195`	97.7	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G199430`	`LXL04_034823`	`JCVI_TKOH_00195`	99.2	90.633 / 99.721	Strict
`TkA04G200360`	`LXL04_034825`	`JCVI_TKOH_00195`	99.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G201920`	`LXL04_034826`	`JCVI_TKOH_00195`	92.8	97.275 / 94.804	Probable
`TkA04G201930`	`LXL04_034827`	`JCVI_TKOH_00195`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA04G202200`	`LXL04_034828`	`JCVI_TKOH_00195`	99.7	92.447 / 98.392	Strict
`TkA04G203020`	`LXL04_034842`	`JCVI_TKOH_00195`	95.3	100.0 / 77.41	Complex
`TkA04G203570`	`LXL04_034840`	`JCVI_TKOH_00195`	94.0	75.0 / 94.318	Complex
`TkA04G204340`	`LXL04_034847`	`JCVI_TKOH_00195`	98.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G205570`	`LXL04_034810`	`JCVI_TKOH_00195`	99.1	96.907 / 98.121	Complex
`TkA04G208830`	`LXL04_034793`	`JCVI_TKOH_00195`	99.6	99.142 / 81.338	Complex
`TkA04G209320`	`LXL04_034794`	`JCVI_TKOH_00195`	98.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G212240`	`LXL04_034798`	`JCVI_TKOH_00195`	99.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA04G213720`	`LXL04_034795`	`JCVI_TKOH_00195`	98.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA04G213760`	`LXL04_034794`	`JCVI_TKOH_00195`	98.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G214210`	`LXL04_034793`	`JCVI_TKOH_00195`	100.0	100.0 / 100.0	待复核