同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00211

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 36

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00211

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00211 Chr04 56244133-60567838 ChrUn 2023677-6142118 mixed High 36 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00211`	Chr04:56244133-60567838	ChrUn:2023677-6142118	mixed	36	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 36 · 当前范围 1–36 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA04G220690 → LXL04_039385

95.7%

TkA04G220800 → LXL04_039383

95.6%

TkA04G224110 → LXL04_039378

91.2%

TkA04G226960 → LXL04_039369

97.7%

TkA04G228170 → LXL04_039365

99.3%

TkA04G228680 → LXL04_039364

100.0%

TkA04G228690 → LXL04_039363

94.7%

TkA04G229680 → LXL04_039362

43.8%

TkA04G229750 → LXL04_039359

89.6%

TkA04G229990 → LXL04_039357

99.7%

TkA04G230650 → LXL04_039355

100.0%

TkA04G230740 → LXL04_039345

99.2%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA04G220690`	`LXL04_039385`	`JCVI_TKOH_00211`	95.7	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G220800`	`LXL04_039383`	`JCVI_TKOH_00211`	95.6	100.0 / 96.61	待复核
`TkA04G224110`	`LXL04_039378`	`JCVI_TKOH_00211`	91.2	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G226960`	`LXL04_039369`	`JCVI_TKOH_00211`	97.7	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G228170`	`LXL04_039365`	`JCVI_TKOH_00211`	99.3	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G228680`	`LXL04_039364`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G228690`	`LXL04_039363`	`JCVI_TKOH_00211`	94.7	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G229680`	`LXL04_039362`	`JCVI_TKOH_00211`	43.8	78.218 / 32.683	Complex
`TkA04G229750`	`LXL04_039359`	`JCVI_TKOH_00211`	89.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G229990`	`LXL04_039357`	`JCVI_TKOH_00211`	99.7	99.026 / 100.0	Complex
`TkA04G230650`	`LXL04_039355`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G230740`	`LXL04_039345`	`JCVI_TKOH_00211`	99.2	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G230750`	`LXL04_039344`	`JCVI_TKOH_00211`	93.7	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G230760`	`LXL04_039343`	`JCVI_TKOH_00211`	97.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G230820`	`LXL04_039341`	`JCVI_TKOH_00211`	99.8	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G230840`	`LXL04_039340`	`JCVI_TKOH_00211`	98.3	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G230850`	`LXL04_039339`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 92.254	Probable
`TkA04G230860`	`LXL04_039338`	`JCVI_TKOH_00211`	99.8	100.0 / 98.544	Probable
`TkA04G231320`	`LXL04_039337`	`JCVI_TKOH_00211`	90.9	99.605 / 90.551	Complex
`TkA04G232010`	`LXL04_039335`	`JCVI_TKOH_00211`	89.0	100.0 / 91.703	Complex
`TkA04G232510`	`LXL04_039329`	`JCVI_TKOH_00211`	69.1	100.0 / 99.393	待复核
`TkA04G232520`	`LXL04_039328`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 66.809	Complex
`TkA04G233160`	`LXL04_039326`	`JCVI_TKOH_00211`	99.1	95.339 / 66.176	Complex
`TkA04G233270`	`LXL04_039324`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G233780`	`LXL04_039335`	`JCVI_TKOH_00211`	93.3	100.0 / 91.703	待复核
`TkA04G233860`	`LXL04_039334`	`JCVI_TKOH_00211`	90.3	94.633 / 66.057	Complex
`TkA04G233890`	`LXL04_039332`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G234240`	`LXL04_039330`	`JCVI_TKOH_00211`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G234380`	`LXL04_039329`	`JCVI_TKOH_00211`	76.2	99.282 / 41.355	Complex
`TkA04G234390`	`LXL04_039328`	`JCVI_TKOH_00211`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G235070`	`LXL04_039324`	`JCVI_TKOH_00211`	98.6	80.435 / 56.705	Complex
`TkA04G235600`	`LXL04_039323`	`JCVI_TKOH_00211`	97.1	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G235630`	`LXL04_039322`	`JCVI_TKOH_00211`	91.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G237160`	`LXL04_039319`	`JCVI_TKOH_00211`	91.3	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G237190`	`LXL04_039317`	`JCVI_TKOH_00211`	98.4	100.0 / 71.595	Complex
`TkA04G238120`	`LXL04_039315`	`JCVI_TKOH_00211`	97.2	100.0 / 100.0	待复核