ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 53 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA05G025810
Chr05:7010378-7013678 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019173
Chr04:25375403-25390899 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 100.000 / 对象 31.127 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G025810 |
|
TkA05G025850
Chr05:7031082-7035362 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019174
Chr04:25407844-25412127 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.500 查询 100.000 / 对象 46.941 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G025850 |
|
TkA05G026550
Chr05:7208479-7209995 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024542
Chr05:93482835-93483974 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.200 查询 33.051 / 对象 53.425 |
TkA05G026550 | |
|
TkA05G026690
Chr05:7247680-7253727 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019185
Chr04:25720210-25729075 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.300 查询 85.749 / 对象 51.935 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G026690 |
|
TkA05G027360
Chr05:7403778-7405822 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_023562
Chr05:50622771-50624835 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.800 查询 100.000 / 对象 97.548 |
TkA05G027360 | |
|
TkA05G028880
Chr05:7826992-7827546 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019194
Chr04:26297186-26297749 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 98.052 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G028880 |
|
TkA05G028890
Chr05:7828846-7829635 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019195
Chr04:26299040-26299644 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 71.717 / 对象 89.308 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G028890 |
|
TkA05G028970
Chr05:7842031-7844562 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_003965
Chr01:118729850-118730548 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.900 查询 49.485 / 对象 82.759 |
TkA05G028970 | |
|
TkA05G029070
Chr05:7862591-7866563 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019197
Chr04:26332968-26335872 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 89.457 / 对象 50.269 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G029070 |
|
TkA05G029980
Chr05:8086125-8087804 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019203
Chr04:26499568-26500767 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.800 查询 98.492 / 对象 75.556 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G029980 |
|
TkA05G032350
Chr05:8740025-8740710 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019232
Chr04:26886101-26888628 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 100.000 / 对象 21.995 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G032350 |
|
TkA05G032360
Chr05:8741507-8742418 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019232
Chr04:26886101-26888628 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 90.116 / 对象 19.821 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G032360 |
|
TkA05G033120
Chr05:8945132-8949671 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019244
Chr04:27135204-27139337 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G033120 |
|
TkA05G033720
Chr05:9128489-9131583 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019249
Chr04:27311679-27325696 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 97.349 / 对象 51.084 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G033720 |
|
TkA05G034130
Chr05:9205365-9206021 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019252
Chr04:27368255-27370885 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 86.000 / 对象 20.379 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G034130 |
|
TkA05G035060
Chr05:9483556-9484128 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022956
Chr05:14993026-14993658 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G035060 | |
|
TkA05G035190
Chr05:9510690-9512132 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_029373
Chr06:88608800-88611943 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.600 查询 95.730 / 对象 35.808 |
TkA05G035190 | |
|
TkA05G036180
Chr05:9765096-9767860 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021942
Chr04:140776046-140788394 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.172 / 对象 5.448 |
TkA05G036180 | |
|
TkA05G036930
Chr05:10027172-10029812 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019278
Chr04:27872097-27877916 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.300 查询 98.246 / 对象 51.515 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G036930 |
|
TkA05G036970
Chr05:10044493-10046206 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019278
Chr04:27872097-27877916 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 91.903 / 对象 36.204 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G036970 |
|
TkA05G037670
Chr05:10213784-10214389 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024189
Chr05:83772006-83778579 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.900 查询 49.254 / 对象 27.654 |
TkA05G037670 | |
|
TkA05G038150
Chr05:10307555-10307917 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019283
Chr04:28133020-28134393 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 87.000 / 对象 26.935 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G038150 |
|
TkA05G038530
Chr05:10437719-10438931 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019292
Chr04:28227458-28229117 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.700 查询 94.565 / 对象 72.426 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G038530 |
|
TkA05G038750
Chr05:10506233-10506780 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_005552
Chr01:168325312-168326957 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 100.000 / 对象 40.637 |
TkA05G038750 | |
|
TkA05G038780
Chr05:10509826-10510284 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019847
Chr04:41701769-41702227 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G038780 | |
|
TkA05G039350
Chr05:10623084-10623698 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019303
Chr04:28391554-28394927 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.700 查询 100.000 / 对象 19.961 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G039350 |
|
TkA05G040660
Chr05:10911951-10916023 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019317
Chr04:28733353-28736797 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 86.105 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G040660 |
|
TkA05G040670
Chr05:10916492-10916919 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019319
Chr04:28737624-28738051 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G040670 |
|
TkA05G042750
Chr05:11371881-11372894 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024929
Chr05:102349186-102349787 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.800 查询 59.223 / 对象 92.958 |
TkA05G042750 | |
|
TkA05G042780
Chr05:11377831-11381944 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019317
Chr04:28733353-28736797 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 86.105 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G042780 |
|
TkA05G042850
Chr05:11402048-11402579 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019321
Chr04:28813877-28814431 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.000 查询 63.810 / 对象 94.366 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G042850 |
|
TkA05G044900
Chr05:11871289-11871793 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019346
Chr04:29342987-29345164 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 44.177 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G044900 |
|
TkA05G046160
Chr05:12181733-12182122 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_005960
Chr01:176376255-176377955 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.300 查询 65.116 / 对象 51.220 |
TkA05G046160 | |
|
TkA05G047580
Chr05:12520241-12522976 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_015642
Chr03:78505554-78507434 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
72.000 查询 71.712 / 对象 96.104 |
TkA05G047580 | |
|
TkA05G047820
Chr05:12573496-12576169 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020255
Chr04:60725782-60731734 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.100 查询 70.690 / 对象 26.063 |
TkA05G047820 | |
|
TkA05G048160
Chr05:12664830-12665186 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_038844
Chr09:51808181-51809447 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 91.525 / 对象 56.842 |
TkA05G048160 | |
|
TkA05G048330
Chr05:12695739-12696388 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019384
Chr04:30200422-30202674 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 54.244 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G048330 |
|
TkA05G048560
Chr05:12765074-12766980 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019389
Chr04:30249167-30250822 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G048560 |
|
TkA05G048570
Chr05:12768819-12771715 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019390
Chr04:30254750-30255715 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.700 查询 100.000 / 对象 56.698 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G048570 |
|
TkA05G048800
Chr05:12846237-12847503 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_009348
Chr02:123762997-123764459 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.200 查询 100.000 / 对象 79.200 |
TkA05G048800 | |
|
TkA05G049930
Chr05:13185010-13189373 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_027027
Chr06:7197794-7210770 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.700 查询 40.076 / 对象 46.445 |
TkA05G049930 | |
|
TkA05G049970
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99.000 查询 93.458 / 对象 20.161 |
TkA05G071490 |