同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00283

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00283

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00283 Chr06 91219810-94145318 Chr05 27910460-29965823 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00283`	Chr06:91219810-94145318	Chr05:27910460-29965823	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G371510 → LXL04_023232

93.2%

TkA06G373150 → LXL04_023239

82.7%

TkA06G373750 → LXL04_023241

99.1%

TkA06G373800 → LXL04_023242

48.4%

TkA06G373840 → LXL04_023243

87.9%

TkA06G373920 → LXL04_023246

99.2%

TkA06G373990 → LXL04_023246

96.1%

TkA06G374100 → LXL04_023247

94.3%

TkA06G374370 → LXL04_023248

89.5%

TkA06G374380 → LXL04_023249

100.0%

TkA06G374910 → LXL04_023249

77.9%

TkA06G376240 → LXL04_023255

81.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G371510`	`LXL04_023232`	`JCVI_TKOH_00283`	93.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G373150`	`LXL04_023239`	`JCVI_TKOH_00283`	82.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G373750`	`LXL04_023241`	`JCVI_TKOH_00283`	99.1	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G373800`	`LXL04_023242`	`JCVI_TKOH_00283`	48.4	69.863 / 85.0	待复核
`TkA06G373840`	`LXL04_023243`	`JCVI_TKOH_00283`	87.9	99.719 / 99.691	待复核
`TkA06G373920`	`LXL04_023246`	`JCVI_TKOH_00283`	99.2	99.721 / 69.38	待复核
`TkA06G373990`	`LXL04_023246`	`JCVI_TKOH_00283`	96.1	52.551 / 19.961	Complex
`TkA06G374100`	`LXL04_023247`	`JCVI_TKOH_00283`	94.3	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G374370`	`LXL04_023248`	`JCVI_TKOH_00283`	89.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G374380`	`LXL04_023249`	`JCVI_TKOH_00283`	100.0	100.0 / 45.54	待复核
`TkA06G374910`	`LXL04_023249`	`JCVI_TKOH_00283`	77.9	100.0 / 88.028	待复核
`TkA06G376240`	`LXL04_023255`	`JCVI_TKOH_00283`	81.9	87.446 / 73.588	Complex
`TkA06G376330`	`LXL04_023256`	`JCVI_TKOH_00283`	100.0	100.0 / 87.931	Strict
`TkA06G376550`	`LXL04_023257`	`JCVI_TKOH_00283`	99.7	92.049 / 55.844	待复核
`TkA06G376990`	`LXL04_023259`	`JCVI_TKOH_00283`	100.0	100.0 / 98.123	Complex
`TkA06G377070`	`LXL04_023260`	`JCVI_TKOH_00283`	99.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G377200`	`LXL04_023265`	`JCVI_TKOH_00283`	99.8	84.749 / 100.0	Strict
`TkA06G380100`	`LXL04_023266`	`JCVI_TKOH_00283`	94.1	100.0 / 100.0	Complex