同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00091
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 26
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00091当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00091 |
Chr02:115245217-116084689 | Chr03:40652569-41487364 | mixed | 26 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 26 · 当前范围 1–26 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA02G452870 | LXL04_014063 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G452950 | LXL04_014062 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 67.624 | 待复核 |
TkA02G452970 | LXL04_014061 | JCVI_TKOH_00091 | 92.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA02G453080 | LXL04_014059 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 98.621 / 58.367 | 待复核 |
TkA02G453100 | LXL04_014058 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G453270 | LXL04_014056 | JCVI_TKOH_00091 | 93.6 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA02G453540 | LXL04_014051 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 33.444 | 待复核 |
TkA02G453550 | LXL04_014051 | JCVI_TKOH_00091 | 94.5 | 67.593 / 12.146 | Complex |
TkA02G453560 | LXL04_014050 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G453590 | LXL04_014049 | JCVI_TKOH_00091 | 99.8 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G453630 | LXL04_014048 | JCVI_TKOH_00091 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA02G453920 | LXL04_014044 | JCVI_TKOH_00091 | 84.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA02G453930 | LXL04_014043 | JCVI_TKOH_00091 | 79.5 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA02G453980 | LXL04_014042 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 93.651 / 59.596 | 待复核 |
TkA02G454070 | LXL04_014041 | JCVI_TKOH_00091 | 99.5 | 90.521 / 100.0 | Strict |
TkA02G454090 | LXL04_014040 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 99.771 / 95.395 | Strict |
TkA02G454120 | LXL04_014038 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 63.964 / 25.725 | 待复核 |
TkA02G454210 | LXL04_014034 | JCVI_TKOH_00091 | 99.6 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA02G454290 | LXL04_014032 | JCVI_TKOH_00091 | 91.7 | 100.0 / 94.087 | Probable |
TkA02G454550 | LXL04_014029 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G454570 | LXL04_014028 | JCVI_TKOH_00091 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G455250 | LXL04_014027 | JCVI_TKOH_00091 | 98.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G455650 | LXL04_014021 | JCVI_TKOH_00091 | 88.1 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA02G455800 | LXL04_014020 | JCVI_TKOH_00091 | 96.5 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G455810 | LXL04_014019 | JCVI_TKOH_00091 | 99.1 | 100.0 / 86.437 | Strict |
TkA02G455820 | LXL04_014018 | JCVI_TKOH_00091 | 93.8 | 99.121 / 47.199 | 待复核 |