基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_014034
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 40967223-40968558
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA795 bp · LXL04_014034|LXL04_014034|OH1004|cDNA
ATGTCTGCTATTAGAATCCATCCTCCTGCGACGGCGTTATCGGTATCTATCAAACACCTTACCTGCAACCCAAATACCCACCTCTTCACCACCAATTGTCGCAATTTAAAGCGTTCAGCCTTCAGAAGAAACCTAACCGTCTTCGCTATGTCGTCCGACCCTCTCGAAGTCTGCGCCAAATCGTCTATCACCGTTCCCAATAGGCTCGGCGATTGCCCTTTTACGCAGAGAGTATTGCTGACTCTGGAGGAGAAGCATCT...
CDS
下载 CDS FASTA795 bp · LXL04_014034|LXL04_014034|OH1004|CDS
ATGTCTGCTATTAGAATCCATCCTCCTGCGACGGCGTTATCGGTATCTATCAAACACCTTACCTGCAACCCAAATACCCACCTCTTCACCACCAATTGTCGCAATTTAAAGCGTTCAGCCTTCAGAAGAAACCTAACCGTCTTCGCTATGTCGTCCGACCCTCTCGAAGTCTGCGCCAAATCGTCTATCACCGTTCCCAATAGGCTCGGCGATTGCCCTTTTACGCAGAGAGTATTGCTGACTCTGGAGGAGAAGCATCT...
264 aa · LXL04_014034|LXL04_014034|OH1004|PROTEIN
MSAIRIHPPATALSVSIKHLTCNPNTHLFTTNCRNLKRSAFRRNLTVFAMSSDPLEVCAKSSITVPNRLGDCPFTQRVLLTLEEKHLPYNLKLIDLGNKPEWFLSISPEGKVPIVKLDDKWIADSDVITKTVEEKFPEPPLSTPPEKSSVGSKIFSTYIGFLKSKDAGDGTEQALLNELSTFNDYLKENGPFINGKDISGADLSLGPKLYHMEIALGYYKKWSVPDSLPHLKTYMKTVFSLESFTKTMPLTEDVIEGWRP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_014034 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_014034 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:40967223-40968558 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to DHAR2: Probable glutathione S-transferase DHAR2, chloroplastic | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程 GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0010043 response to zinc ion 生物过程 GO:0010193 response to ozone 生物过程 GO:0010731 protein glutathionylation 生物过程 GO:0019852 L-ascorbic acid metabolic process 生物过程 GO:0033355 ascorbate glutathione cycle 生物过程 GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程 GO:0043903 regulation of biological process involved in symbiotic interaction 生物过程 GO:0070301 cellular response to hydrogen peroxide 生物过程 GO:0080151 positive regulation of salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G19570 ath:AT1G75270 ath:AT5G16710 dosa:Os05g0116100 dosa:Os06g0232600 osa:4337622 osa:4340581 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.964
线粒体0.068
细胞质0.034
过氧化物酶体0.018
细胞核0.016
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF22441.3CLIC-like_N67-137 aaPF13417.13GST_N_371-140 aaPF02798.27GST_N71-129 aaPF13409.13GST_N_272-134 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_014034 | PF22441.3 | CLIC-like_N | 67 | 137 | 6.8e-08 | 33.3 |
| LXL04_014034 | PF13417.13 | GST_N_3 | 71 | 140 | 9.2e-18 | 65.1 |
| LXL04_014034 | PF02798.27 | GST_N | 71 | 129 | 3.2e-07 | 31.3 |
| LXL04_014034 | PF13409.13 | GST_N_2 | 72 | 134 | 2.2e-17 | 64.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8LE52 | 拟南芥 | Glutathione S-transferase DHAR3, chloroplastic | 64.662% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9FWR4 | 拟南芥 | Glutathione S-transferase DHAR1, mitochondrial | 59.330% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9FRL8 | 拟南芥 | Glutathione S-transferase DHAR2 | 59.330% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q67UK9 | 水稻 | Probable glutathione S-transferase DHAR2, chloroplastic | 74.236% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q65XA0 | 水稻 | Probable glutathione S-transferase DHAR1, cytosolic | 59.330% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |