同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00011

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 27

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00011

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00011 Chr01 41197852-42469609 Chr01 132915671-134385144 mixed High 27 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00011`	Chr01:41197852-42469609	Chr01:132915671-134385144	mixed	27	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 27 · 当前范围 1–27 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G161130 → LXL04_004330

60.5%

TkA01G161220 → LXL04_004332

92.8%

TkA01G161660 → LXL04_004330

70.2%

TkA01G161740 → LXL04_004341

60.2%

TkA01G161840 → LXL04_004350

73.7%

TkA01G161930 → LXL04_004344

100.0%

TkA01G161990 → LXL04_004345

100.0%

TkA01G162000 → LXL04_004346

57.4%

TkA01G162130 → LXL04_004351

97.3%

TkA01G162350 → LXL04_004356

58.2%

TkA01G162490 → LXL04_004359

99.3%

TkA01G163400 → LXL04_004361

94.4%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G161130`	`LXL04_004330`	`JCVI_TKOH_00011`	60.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G161220`	`LXL04_004332`	`JCVI_TKOH_00011`	92.8	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G161660`	`LXL04_004330`	`JCVI_TKOH_00011`	70.2	99.731 / 54.839	Complex
`TkA01G161740`	`LXL04_004341`	`JCVI_TKOH_00011`	60.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G161840`	`LXL04_004350`	`JCVI_TKOH_00011`	73.7	99.862 / 73.168	Complex
`TkA01G161930`	`LXL04_004344`	`JCVI_TKOH_00011`	100.0	64.059 / 37.5	Complex
`TkA01G161990`	`LXL04_004345`	`JCVI_TKOH_00011`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G162000`	`LXL04_004346`	`JCVI_TKOH_00011`	57.4	100.0 / 77.278	Complex
`TkA01G162130`	`LXL04_004351`	`JCVI_TKOH_00011`	97.3	87.708 / 33.166	待复核
`TkA01G162350`	`LXL04_004356`	`JCVI_TKOH_00011`	58.2	95.732 / 100.0	Complex
`TkA01G162490`	`LXL04_004359`	`JCVI_TKOH_00011`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G163400`	`LXL04_004361`	`JCVI_TKOH_00011`	94.4	93.45 / 30.615	待复核
`TkA01G163560`	`LXL04_004362`	`JCVI_TKOH_00011`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G163670`	`LXL04_004363`	`JCVI_TKOH_00011`	99.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G164410`	`LXL04_004366`	`JCVI_TKOH_00011`	96.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G164430`	`LXL04_004367`	`JCVI_TKOH_00011`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G164630`	`LXL04_004368`	`JCVI_TKOH_00011`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G164710`	`LXL04_004370`	`JCVI_TKOH_00011`	100.0	74.775 / 22.74	待复核
`TkA01G165100`	`LXL04_004373`	`JCVI_TKOH_00011`	100.0	64.539 / 24.462	Complex
`TkA01G165160`	`LXL04_004375`	`JCVI_TKOH_00011`	95.6	96.604 / 65.029	待复核
`TkA01G165170`	`LXL04_004375`	`JCVI_TKOH_00011`	94.7	98.381 / 27.086	Complex
`TkA01G165360`	`LXL04_004380`	`JCVI_TKOH_00011`	93.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G165370`	`LXL04_004381`	`JCVI_TKOH_00011`	91.9	88.772 / 38.834	Complex
`TkA01G165500`	`LXL04_004384`	`JCVI_TKOH_00011`	99.1	97.458 / 27.316	待复核
`TkA01G165580`	`LXL04_004385`	`JCVI_TKOH_00011`	81.0	68.75 / 77.451	Complex
`TkA01G166050`	`LXL04_004388`	`JCVI_TKOH_00011`	98.2	88.976 / 11.177	待复核
`TkA01G166090`	`LXL04_004390`	`JCVI_TKOH_00011`	100.0	89.815 / 54.802	待复核