同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00274

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 26

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00274

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00274 Chr06 46043239-46953906 Chr05 80474485-81605005 + High 26 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00274`	Chr06:46043239-46953906	Chr05:80474485-81605005	+	26	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 26 · 当前范围 1–26 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G175430 → LXL04_024083

75.2%

TkA06G175920 → LXL04_024084

99.2%

TkA06G175930 → LXL04_024085

99.3%

TkA06G176040 → LXL04_024086

100.0%

TkA06G176050 → LXL04_024087

100.0%

TkA06G176790 → LXL04_024100

98.1%

TkA06G176830 → LXL04_024101

100.0%

TkA06G177280 → LXL04_024102

98.3%

TkA06G177290 → LXL04_024103

99.7%

TkA06G177300 → LXL04_024104

100.0%

TkA06G177320 → LXL04_024105

100.0%

TkA06G177340 → LXL04_024106

94.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G175430`	`LXL04_024083`	`JCVI_TKOH_00274`	75.2	100.0 / 78.035	待复核
`TkA06G175920`	`LXL04_024084`	`JCVI_TKOH_00274`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G175930`	`LXL04_024085`	`JCVI_TKOH_00274`	99.3	96.284 / 100.0	Complex
`TkA06G176040`	`LXL04_024086`	`JCVI_TKOH_00274`	100.0	95.161 / 67.045	待复核
`TkA06G176050`	`LXL04_024087`	`JCVI_TKOH_00274`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G176790`	`LXL04_024100`	`JCVI_TKOH_00274`	98.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G176830`	`LXL04_024101`	`JCVI_TKOH_00274`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G177280`	`LXL04_024102`	`JCVI_TKOH_00274`	98.3	100.0 / 54.059	待复核
`TkA06G177290`	`LXL04_024103`	`JCVI_TKOH_00274`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G177300`	`LXL04_024104`	`JCVI_TKOH_00274`	100.0	81.875 / 50.973	Complex
`TkA06G177320`	`LXL04_024105`	`JCVI_TKOH_00274`	100.0	100.0 / 92.179	Strict
`TkA06G177340`	`LXL04_024106`	`JCVI_TKOH_00274`	94.3	100.0 / 92.823	Probable
`TkA06G177350`	`LXL04_024107`	`JCVI_TKOH_00274`	99.1	97.994 / 49.138	待复核
`TkA06G177360`	`LXL04_024107`	`JCVI_TKOH_00274`	71.5	94.286 / 39.799	Complex
`TkA06G177410`	`LXL04_024112`	`JCVI_TKOH_00274`	85.5	93.6 / 69.231	待复核
`TkA06G177470`	`LXL04_024108`	`JCVI_TKOH_00274`	67.7	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G177560`	`LXL04_024108`	`JCVI_TKOH_00274`	66.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G177690`	`LXL04_024110`	`JCVI_TKOH_00274`	67.7	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G177730`	`LXL04_024111`	`JCVI_TKOH_00274`	99.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G178160`	`LXL04_024114`	`JCVI_TKOH_00274`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G178400`	`LXL04_024116`	`JCVI_TKOH_00274`	99.4	90.979 / 90.805	Complex
`TkA06G178530`	`LXL04_024117`	`JCVI_TKOH_00274`	78.2	37.692 / 32.164	Complex
`TkA06G178610`	`LXL04_024119`	`JCVI_TKOH_00274`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G179110`	`LXL04_024123`	`JCVI_TKOH_00274`	96.9	29.907 / 40.506	待复核
`TkA06G179210`	`LXL04_024123`	`JCVI_TKOH_00274`	96.9	29.907 / 40.506	Complex
`TkA06G179390`	`LXL04_024123`	`JCVI_TKOH_00274`	50.0	39.56 / 91.139	Complex