同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00202
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 44
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00202当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00202 |
Chr04:92319438-95697417 | Chr09:26795734-30419318 | mixed | 44 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 44 · 当前范围 1–44 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA04G367260 | LXL04_037964 | JCVI_TKOH_00202 | 94.5 | 100.0 / 88.158 | Probable |
TkA04G367270 | LXL04_037963 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 91.304 | Complex |
TkA04G367750 | LXL04_037962 | JCVI_TKOH_00202 | 94.9 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA04G367760 | LXL04_037961 | JCVI_TKOH_00202 | 90.0 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA04G367770 | LXL04_037960 | JCVI_TKOH_00202 | 97.9 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G367790 | LXL04_037959 | JCVI_TKOH_00202 | 95.2 | 99.863 / 99.868 | Complex |
TkA04G367830 | LXL04_037958 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G367840 | LXL04_037957 | JCVI_TKOH_00202 | 97.6 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G367870 | LXL04_037956 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 87.321 | Strict |
TkA04G367960 | LXL04_037954 | JCVI_TKOH_00202 | 95.3 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA04G368350 | LXL04_037967 | JCVI_TKOH_00202 | 97.6 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G368370 | LXL04_037968 | JCVI_TKOH_00202 | 99.5 | 100.0 / 98.516 | Strict |
TkA04G368630 | LXL04_037974 | JCVI_TKOH_00202 | 87.7 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA04G369040 | LXL04_037976 | JCVI_TKOH_00202 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G369050 | LXL04_037977 | JCVI_TKOH_00202 | 99.5 | 97.964 / 100.0 | Strict |
TkA04G369260 | LXL04_037978 | JCVI_TKOH_00202 | 96.3 | 99.567 / 99.075 | Complex |
TkA04G369330 | LXL04_037979 | JCVI_TKOH_00202 | 98.7 | 83.836 / 54.789 | 待复核 |
TkA04G369350 | LXL04_037980 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 67.213 | 待复核 |
TkA04G369370 | LXL04_037981 | JCVI_TKOH_00202 | 90.0 | 99.016 / 91.436 | Complex |
TkA04G371790 | LXL04_037987 | JCVI_TKOH_00202 | 94.9 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA04G372420 | LXL04_037988 | JCVI_TKOH_00202 | 99.3 | 94.737 / 69.545 | 待复核 |
TkA04G372490 | LXL04_037990 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 65.278 | 待复核 |
TkA04G372560 | LXL04_037992 | JCVI_TKOH_00202 | 94.3 | 49.074 / 68.831 | 待复核 |
TkA04G372580 | LXL04_037993 | JCVI_TKOH_00202 | 98.9 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G373080 | LXL04_037997 | JCVI_TKOH_00202 | 99.8 | 99.845 / 99.846 | Strict |
TkA04G373630 | LXL04_037999 | JCVI_TKOH_00202 | 98.2 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G373690 | LXL04_038001 | JCVI_TKOH_00202 | 95.3 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G373760 | LXL04_038002 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G373880 | LXL04_038004 | JCVI_TKOH_00202 | 78.0 | 100.0 / 93.514 | Complex |
TkA04G373940 | LXL04_038005 | JCVI_TKOH_00202 | 94.2 | 100.0 / 98.464 | Probable |
TkA04G373950 | LXL04_038006 | JCVI_TKOH_00202 | 99.5 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA04G374010 | LXL04_038007 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA04G374020 | LXL04_038009 | JCVI_TKOH_00202 | 99.0 | 51.256 / 95.327 | 待复核 |
TkA04G374170 | LXL04_038010 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA04G374560 | LXL04_038016 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 80.916 | Complex |
TkA04G374740 | LXL04_038017 | JCVI_TKOH_00202 | 90.8 | 100.0 / 96.235 | Probable |
TkA04G375600 | LXL04_038022 | JCVI_TKOH_00202 | 90.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA04G375970 | LXL04_038024 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA04G376780 | LXL04_038028 | JCVI_TKOH_00202 | 76.4 | 96.784 / 87.002 | 待复核 |
TkA04G377150 | LXL04_038031 | JCVI_TKOH_00202 | 100.0 | 97.126 / 92.35 | 待复核 |
TkA04G378400 | LXL04_038047 | JCVI_TKOH_00202 | 89.7 | 30.952 / 30.233 | Complex |
TkA04G378410 | LXL04_038037 | JCVI_TKOH_00202 | 92.3 | 33.333 / 20.419 | Complex |
TkA04G378860 | LXL04_038054 | JCVI_TKOH_00202 | 92.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA04G379840 | LXL04_038031 | JCVI_TKOH_00202 | 85.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |