ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 20 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA02G348660
Chr02:88620007-88626330 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015285
Chr03:67521527-67523956 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 48.528 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G348660 |
|
TkA02G348680
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_019541
Chr04:33510099-33510515 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.300 查询 69.430 / 对象 97.101 |
TkA02G348680 | |
|
TkA02G348840
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_015282
Chr03:67477283-67490582 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.000 查询 99.592 / 对象 99.600 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G348840 |
|
TkA02G348900
Chr02:88691927-88693369 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015281
Chr03:67472121-67474718 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.500 查询 100.000 / 对象 55.491 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G348900 |
|
TkA02G349180
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_014084
Chr03:41837965-41841199 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.300 查询 79.601 / 对象 72.289 |
TkA02G349180 | |
|
TkA02G349980
Chr02:88990625-88994438 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015261
Chr03:67077773-67081620 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 99.559 / 对象 26.526 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G349980 |
|
TkA02G350060
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_029947
Chr06:103798879-103801249 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 98.895 / 对象 37.421 |
TkA02G350060 | |
|
TkA02G350810
Chr02:89216172-89223329 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015264
Chr03:67124932-67134318 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.300 查询 96.022 / 对象 46.673 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G350810 |
|
TkA02G350960
Chr02:89266225-89268033 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015263
Chr03:67090204-67091631 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G350960 |
|
TkA02G351500
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_030776
Chr06:122418771-122428282 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.100 查询 75.610 / 对象 28.097 |
TkA02G351500 | |
|
TkA02G351510
Chr02:89398165-89399189 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_004713
Chr01:144420132-144421871 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.700 查询 69.767 / 对象 39.823 |
TkA02G351510 | |
|
TkA02G352050
Chr02:89540308-89541472 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022941
Chr05:14399853-14406395 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.900 查询 16.757 / 对象 14.833 |
TkA02G352050 | |
|
TkA02G352760
Chr02:89682479-89699177 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015246
Chr03:66766260-66774083 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G352760 |
|
TkA02G353120
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_015241
Chr03:66577133-66584895 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.300 查询 95.918 / 对象 30.104 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G353120 |
|
TkA02G353200
Chr02:89800735-89803951 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015236
Chr03:66548365-66551178 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.500 查询 99.339 / 对象 64.141 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G353200 |
|
TkA02G353890
Chr02:89938805-89939194 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_016845
Chr03:135532913-135537341 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.300 查询 71.318 / 对象 38.017 |
TkA02G353890 | |
|
TkA02G355120
Chr02:90204732-90216506 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015218
Chr03:66166032-66177467 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 99.273 / 对象 52.995 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G355120 |
|
TkA02G355670
Chr02:90338559-90338870 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_005100
Chr01:154551866-154553146 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.100 查询 99.029 / 对象 29.565 |
TkA02G355670 | |
|
TkA02G356040
Chr02:90423713-90436069 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015210
Chr03:65985933-65998078 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.700 查询 90.710 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G356040 |
|
TkA02G356070
Chr02:90444781-90445119 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_009690
Chr02:131261499-131262287 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 18.750 / 对象 8.015 |
TkA02G356070 | |
|
TkA02G356460
Chr02:90539922-90541320 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015205
Chr03:65877571-65884819 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 90.618 / 对象 38.224 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G356460 |
|
TkA02G356850
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_015199
Chr03:65760925-65762797 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 78.906 / 对象 78.906 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G356850 |
|
TkA02G358350
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_015183
Chr03:65392551-65396032 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G358350 |
|
TkA02G358380
Chr02:91038423-91041148 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015179
Chr03:65372311-65374471 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 50.000 / 对象 89.062 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G358380 |
|
TkA02G358910
Chr02:91183252-91187430 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015174
Chr03:65289277-65293152 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 49.627 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G358910 |
|
TkA02G359050
Chr02:91224289-91224878 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_023972
Chr05:76238456-76239014 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 97.321 |
TkA02G359050 | |
|
TkA02G359530
Chr02:91362706-91370412 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015159
Chr03:65128977-65137017 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 98.131 / 对象 69.421 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G359530 |
|
TkA02G359700
Chr02:91410475-91412050 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015156
Chr03:65097029-65097955 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.200 查询 81.395 / 对象 68.627 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G359700 |
|
TkA02G359720
Chr02:91414877-91415218 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_013228
Chr03:26319512-26321160 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.700 查询 36.283 / 对象 33.607 |
TkA02G359720 | |
|
TkA02G359780
Chr02:91446852-91448894 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015155
Chr03:65066709-65072073 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.300 查询 100.000 / 对象 51.205 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G359780 |
|
TkA02G360120
Chr02:91533229-91541661 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015148
Chr03:64983226-64989917 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 100.000 / 对象 99.936 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G360120 |
|
TkA02G360510
Chr02:91640197-91640697 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015146
Chr03:64896521-64896865 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 68.675 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G360510 |
|
TkA02G360750
Chr02:91710207-91710949 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031998
Chr07:14625112-14625734 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.900 查询 46.512 / 对象 53.947 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G360750 |
|
TkA02G360790
Chr02:91717682-91719766 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031995
Chr07:14583855-14584970 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.300 查询 47.358 / 对象 94.715 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G360790 |
|
TkA02G360960
Chr02:91773417-91779274 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031992
Chr07:14507259-14512438 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 100.000 / 对象 34.797 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G360960 |
|
TkA02G361390
Chr02:91915886-91917143 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031984
Chr07:14376120-14380758 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 99.635 / 对象 29.216 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G361390 |
|
TkA02G361410
Chr02:91921999-91925651 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031983
Chr07:14371138-14374797 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G361410 |
|
TkA02G361600
Chr02:91964236-91965509 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_031982
Chr07:14354472-14364411 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 93.802 / 对象 10.134 |
JCVI_TKOH_00107 | TkA02G361600 |
|
TkA02G361770
Chr02:92005711-92006463 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_022049
Chr04:144035396-144036148 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA02G361770 | |
|
TkA02G362420
Chr02:92180336-92188892 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_015139
Chr03:64783853-64795777 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.900 查询 99.744 / 对象 34.767 |
JCVI_TKOH_00088 | TkA02G362420 |
|
TkA02G362460
Chr02:92198060-92199467 (-)
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|
LXL04_015138
Chr03:64776727-64778134 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
62.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104801.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 67.416 |
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|
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|
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CM104801.1
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|
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93.100 查询 69.421 / 对象 49.714 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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87.900 查询 97.704 / 对象 64.877 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 91.667 / 对象 37.643 |
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100.000 查询 100.000 / 对象 58.125 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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CM104801.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104806.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.100 查询 61.044 / 对象 100.000 |
TkA02G382360 | |
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TkA02G382440
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 99.457 / 对象 18.905 |
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CM104801.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.800 查询 81.416 / 对象 38.249 |
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CM104801.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 8.446 |
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LXL04_014925
Chr03:59706577-59713908 (+)
CM104801.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.400 查询 87.241 / 对象 20.159 |
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CM104801.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 97.073 / 对象 45.538 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.800 查询 52.000 / 对象 21.667 |
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91.400 查询 98.936 / 对象 58.307 |
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94.700 查询 66.667 / 对象 53.147 |
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97.000 查询 23.239 / 对象 13.808 |
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99.100 查询 100.000 / 对象 48.970 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 63.992 |
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