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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 20 / 92 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA02G348660
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CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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CM104802.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
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查询 69.430 / 对象 97.101
TkA02G348680
TkA02G348840
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CM104801.1
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需复核
81.000
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JCVI_TKOH_00087 TkA02G348840
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CM104801.1
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需复核
93.500
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CM104801.1
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需复核
85.300
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TkA02G349180
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CM104801.1
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需复核
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CM104804.1
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需复核
95.500
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TkA02G350060
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CM104801.1
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需复核
81.300
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CM104801.1
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需复核
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104804.1
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需复核
87.100
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TkA02G351500
TkA02G351510
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CM104799.1
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需复核
96.700
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TkA02G351510
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CM104803.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
83.900
查询 16.757 / 对象 14.833
TkA02G352050
TkA02G352760
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
86.100
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104801.1
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需复核
88.300
查询 95.918 / 对象 30.104
JCVI_TKOH_00087 TkA02G353120
TkA02G353200
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CM104801.1
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需复核
97.500
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JCVI_TKOH_00087 TkA02G353200
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
78.300
查询 71.318 / 对象 38.017
TkA02G353890
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CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
98.000
查询 99.273 / 对象 52.995
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CM104799.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
95.100
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需复核
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需复核
100.000
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CM104801.1
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需复核
100.000
查询 90.618 / 对象 38.224
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CM104801.1
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需复核
100.000
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需复核
81.600
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需复核
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JCVI_TKOH_00087 TkA02G358380
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CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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CM104803.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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TkA02G359050
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
99.800
查询 98.131 / 对象 69.421
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
95.200
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JCVI_TKOH_00087 TkA02G359700
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
92.700
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TkA02G359720
TkA02G359780
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LXL04_015155
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CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
95.300
查询 100.000 / 对象 51.205
JCVI_TKOH_00087 TkA02G359780
TkA02G360120
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LXL04_015148
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
92.400
查询 100.000 / 对象 99.936
JCVI_TKOH_00087 TkA02G360120
TkA02G360510
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LXL04_015146
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CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
100.000
查询 68.675 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00087 TkA02G360510
TkA02G360750
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
93.900
查询 46.512 / 对象 53.947
JCVI_TKOH_00107 TkA02G360750
TkA02G360790
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CM104805.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
95.300
查询 47.358 / 对象 94.715
JCVI_TKOH_00107 TkA02G360790
TkA02G360960
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CM104805.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.100
查询 100.000 / 对象 34.797
JCVI_TKOH_00107 TkA02G360960
TkA02G361390
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CM104805.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.300
查询 99.635 / 对象 29.216
JCVI_TKOH_00107 TkA02G361390
TkA02G361410
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GWHBCHF00000003
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Chr07:14371138-14374797 (+)
CM104805.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
95.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00107 TkA02G361410
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GWHBCHF00000003
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Chr07:14354472-14364411 (+)
CM104805.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.100
查询 93.802 / 对象 10.134
JCVI_TKOH_00107 TkA02G361600
TkA02G361770
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GWHBCHF00000003
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Chr04:144035396-144036148 (-)
CM104802.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
97.500
查询 100.000 / 对象 100.000
TkA02G361770
TkA02G362420
Chr02:92180336-92188892 (-)
GWHBCHF00000003
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Chr03:64783853-64795777 (+)
CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.900
查询 99.744 / 对象 34.767
JCVI_TKOH_00088 TkA02G362420
TkA02G362460
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Chr03:64776727-64778134 (+)
CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
62.700
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00088 TkA02G362460
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Chr03:64729478-64731315 (+)
CM104801.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
98.900
查询 100.000 / 对象 67.416
JCVI_TKOH_00088 TkA02G362620
TkA02G362910
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Chr03:64618067-64633119 (+)
CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.000
查询 89.489 / 对象 25.190
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
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