基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_014925
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 59706577-59713908
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3768 bp · LXL04_014925|LXL04_014925|OH1004|cDNA
ATGGATGTTTTTAGTGAAATTATGAAGCCGGTTGTTCAGGTTCTCATGGTTCCTGCAAAAAAAGAACTAGGTTATTTGATTTCATGTGCAACACATGTGAAGGACATGCGTAGAAAAATGACAGAGTTGGAAGTTGCAAAATGCGGTGAGGAAGAGCACTTGAACCGGAACACAGAAAACCGTTTAGAGATTTCATCTCAAGTGAGGGAATGGTTGGAAAAAGTAAAAAACATTAATGCAAAGGTGGAAAACTTTCCAAG...
CDS
下载 CDS FASTA3768 bp · LXL04_014925|LXL04_014925|OH1004|CDS
ATGGATGTTTTTAGTGAAATTATGAAGCCGGTTGTTCAGGTTCTCATGGTTCCTGCAAAAAAAGAACTAGGTTATTTGATTTCATGTGCAACACATGTGAAGGACATGCGTAGAAAAATGACAGAGTTGGAAGTTGCAAAATGCGGTGAGGAAGAGCACTTGAACCGGAACACAGAAAACCGTTTAGAGATTTCATCTCAAGTGAGGGAATGGTTGGAAAAAGTAAAAAACATTAATGCAAAGGTGGAAAACTTTCCAAG...
1255 aa · LXL04_014925|LXL04_014925|OH1004|PROTEIN
MDVFSEIMKPVVQVLMVPAKKELGYLISCATHVKDMRRKMTELEVAKCGEEEHLNRNTENRLEISSQVREWLEKVKNINAKVENFPSDVGSCFNIMDRHKLGRKAFQILEEIESVTTQHSLITWSDRPIPLGRVDSTRTSVSAPLTTNHHEDFQSRNQTFLEALKAFQPNHKSHMIALCGMGGVGKTTMMEKLKKVAEKKKMFNYIVEVVIGENTDPIAAIQDVVATYIGIELKEKDKRARANKLCQGFKAKSDGGKNKF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_014925 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_014925 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:59706577-59713908 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to RPS2: Disease resistance protein RPS2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程 GO:0016045 detection of bacterium 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0098542 defense response to other organism 生物过程 GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0005524 ATP binding 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G12280 ath:AT1G61180 ath:AT4G26090 ath:AT4G27190 ath:AT4G27220 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.590
细胞质0.242
细胞核0.183
内质网0.117
细胞外0.049
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00931.29NB-ARC170-331 aaPF23598.2LRR_14534-614 aaPF23247.2LRR_RPS2740-844 aaPF23247.2LRR_RPS2862-1016 aaPF23247.2LRR_RPS21038-1127 aaPF23247.2LRR_RPS21134-1226 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_014925 | PF00931.29 | NB-ARC | 170 | 331 | 3.2e-26 | 92.7 |
| LXL04_014925 | PF23598.2 | LRR_14 | 534 | 614 | 1.9e-09 | 37.5 |
| LXL04_014925 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 740 | 844 | 3.6e-65 | 219.5 |
| LXL04_014925 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 862 | 1016 | 3.6e-65 | 219.5 |
| LXL04_014925 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 1038 | 1127 | 3.6e-65 | 219.5 |
| LXL04_014925 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 1134 | 1226 | 3.6e-65 | 219.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q42484 | 拟南芥 | Disease resistance protein RPS2 | 25.806% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
O81825 | 拟南芥 | Probable disease resistance protein At4g27220 | 25.666% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q940K0 | 拟南芥 | Disease resistance protein UNI | 26.156% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9T048 | 拟南芥 | Disease resistance protein At4g27190 | 25.170% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
P60838 | 拟南芥 | Disease resistance protein SUMM2 | 27.619% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |