RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G174710
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 44996388-44999747 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2100 bp · TkA02G174710|TK1151|cDNA

CCCTGATGCATCCACCCCACCGCGGTTTCCCTTTCCGACGCCATATTAACCGGGAAAACAGGCTCTGTCACACATACTCTGTATCCCTAATTTCTAACCAGTAAAACGTAAGAGGTGATCGGAGGTAGAGAAACGGCTGAAAAATGGAGGTTATGAATAACAATCTGACATTGTTTTCCGATGTGGCGATGAACACCGACAGTACTCACAGTCAGGTCGTTCCGATCACATTATTCATTGCGGTACTCTGTGTATGTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1260 bp · TkA02G174710|TK1151|CDS

ATGCTATTTGGAATTACAGGCGTTCTGATATCAACATCAATCGTCGCAGCTGGTTGCTGGTGGCTGTTTCCAAAGTTAGGGTTTGAGGGTTTGAGTATCAGCGAGTATCTTAGTATTGGGACAATTTTCTCATCTACAGATACTGTATGCACATTACAGGTCTTGAGCCAAGATGAGACGCCATTGCTATACAGCTTAGTCTTTGGTGAAGGAGTAGTAAATGATGCAACATCAGTTGTACTTTTCAATGCGGTTCAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

419 aa · TkA02G174710|TK1151|PROTEIN

MLFGITGVLISTSIVAAGCWWLFPKLGFEGLSISEYLSIGTIFSSTDTVCTLQVLSQDETPLLYSLVFGEGVVNDATSVVLFNAVQKINADTLNAQTALRIFLDFLYLFTTSTLLGVAAGLVTAYILRGLYVGRHSSVREIALMVLVAYLSYMLAELFELSGILTVFFTGVLMSHYSWHNVTESSRTTTRYAFATLSFIAETFIFLYVGMDAFDYEKWKMSKLSFWNKLAIYSTVMLLILIGRAAFVFPLSIISNYMHRS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G174710
TK1151 IDTkA02G174710
OH-1004 IDLXL04_016203
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 78.585
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G174710
位置Chr02:44996388-44999747 (-)
描述Similar to NHX4: Sodium/hydrogen exchanger 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55470 可能参与质子与钠离子（Na(+)）或钾离子（K(+)）等阳离子的低亲和力电中性交换穿膜运输。 暂无已核实直接文献
At5g27150 在质子与阳离子跨膜的低亲和力电中性交换中发挥作用。
Salt tolerance conferred by overexpression of a vacuolar Na+/H+ antiport in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1126/science.285.5431.1256
Functional conservation between yeast and plant endosomal Na(+)/H(+) antiporters.2000 · DOI: 10.1016/s0014-5793(00)01412-5
Arabidopsis thaliana and Saccharomyces cerevisiae NHX1 genes encode amiloride sensitive electroneutral Na+/H+ exchangers.2000 · DOI: 10.1042/0264-6021:3510241
Engineering salt-tolerant Brassica plants: characterization of yield and seed oil quality in transgenic plants with increased vacuolar sodium accumulation.2001 · DOI: 10.1073/pnas.231476498
The arabidopsis Na+/H+ exchanger AtNHX1 catalyzes low affinity Na+ and K+ transport in reconstituted liposomes.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m105043200
Vacuolar cation/H+ exchange, ion homeostasis, and leaf development are altered in a T-DNA insertional mutant of AtNHX1, the Arabidopsis vacuolar Na+/H+ antiporter.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01871.x
Expression of an Arabidopsis vacuolar sodium/proton antiporter gene in cotton improves photosynthetic performance under salt conditions and increases fiber yield in the field.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci201
The Arabidopsis thaliana proton transporters, AtNhx1 and Avp1, can function in cation detoxification in yeast.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.4.1480
At3g05030 在质子与阳离子跨膜的低亲和力电中性交换中发挥作用。
Differential expression and function of Arabidopsis thaliana NHX Na+/H+ antiporters in the salt stress response.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01309.x
At3g06370 可能参与质子与钠离子（Na(+)）或钾离子（K(+)）等阳离子的低亲和力电中性交换穿膜运输。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0666900 可能作为液泡膜反向转运蛋白，介导 H⁺ 与 Na⁺、K⁺ 等阳离子的低亲和力电中性交换。
Function, intracellular localization and the importance in salt tolerance of a vacuolar Na(+)/H(+) antiporter from rice.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch014
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016203 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0034486 vacuolar transmembrane transport 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:0098719 sodium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05030
ath:AT3G06370
ath:AT5G27150
ath:AT5G55470
dosa:Os07g0666900
osa:4344217
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.480
排名 1 · TkA02G174710 · TK1151
细胞膜0.213
排名 2 · TkA02G174710 · TK1151
细胞质0.199
排名 3 · TkA02G174710 · TK1151
高尔基体0.132
排名 4 · TkA02G174710 · TK1151
内质网0.127
排名 5 · TkA02G174710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00999Na_H_Exchanger2-331 aa
PF19094EMC6_arch110-158 aa
PF19094EMC6_arch174-218 aa
PF12963DUF3852189-239 aa
PF15183MRAP232-277 aa
PF19094EMC6_arch278-324 aa
PF12963DUF3852283-330 aa
PF15183MRAP314-320 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G174710PF00999Na_H_Exchanger23313.3e-45155.3
TkA02G174710PF19094EMC6_arch1101582.69.3
TkA02G174710PF19094EMC6_arch1742182.69.3
TkA02G174710PF12963DUF38521892391.510.1
TkA02G174710PF15183MRAP2322772.68.9
TkA02G174710PF19094EMC6_arch2783242.69.3
TkA02G174710PF12963DUF38522833301.510.1
TkA02G174710PF15183MRAP3143202.68.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S397拟南芥sp|Q8S397|NHX4_ARATH Sodium/hydrogen exchanger 466.900%Swiss-Prot高置信
Q68KI4拟南芥sp|Q68KI4|NHX1_ARATH Sodium/hydrogen exchanger 156.400%Swiss-Prot高置信
Q56XP4拟南芥sp|Q56XP4|NHX2_ARATH Sodium/hydrogen exchanger 256.400%Swiss-Prot高置信
Q84WG1拟南芥sp|Q84WG1|NHX3_ARATH Sodium/hydrogen exchanger 361.500%Swiss-Prot高置信
Q9SXJ8水稻sp|Q9SXJ8|NHX1_ORYSJ Sodium/hydrogen exchanger 156.100%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看