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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_016203
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 115044692-115047548 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1614 bp · LXL04_016203|LXL04_016203|OH1004|cDNA

ATGGAGGTTATGAATAACAATCTGACATTGTTTTCCGATGTGGCGACGAACACCGAGAGTACTCACAGTCAGGTCGTTCCGATCACATTATTCATTGCGGTACTCTGTGTATGTTTAGTCATCGGACACTTGCTTGAAGATTATCCTTGGTTGAACGAGTCCATCACCGCTATCCTCATCGGGTTTGTTGTTGGAACAATCATCTTATGTACAAGCAAGTGGAAAAGCTCTCGTCTACTCACATTCAGTGAAGAACTGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1614 bp · LXL04_016203|LXL04_016203|OH1004|CDS

ATGGAGGTTATGAATAACAATCTGACATTGTTTTCCGATGTGGCGACGAACACCGAGAGTACTCACAGTCAGGTCGTTCCGATCACATTATTCATTGCGGTACTCTGTGTATGTTTAGTCATCGGACACTTGCTTGAAGATTATCCTTGGTTGAACGAGTCCATCACCGCTATCCTCATCGGGTTTGTTGTTGGAACAATCATCTTATGTACAAGCAAGTGGAAAAGCTCTCGTCTACTCACATTCAGTGAAGAACTGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

537 aa · LXL04_016203|LXL04_016203|OH1004|PROTEIN

MEVMNNNLTLFSDVATNTESTHSQVVPITLFIAVLCVCLVIGHLLEDYPWLNESITAILIGFVVGTIILCTSKWKSSRLLTFSEELFFIYLLPPIIFNAGFQVKKKQFFHNFFPIMLFGITGVLISTSIVAAGCWWLFPKLGFEGLSISEYLSIGTIFSSTDTVCTLQVLSQDETPLLYSLVFGEGVVNDATSVVLFNAVQKINADTLNAQTALRIFLDFLYLFTTSTLLGVAAGLVTAYILRGLYVGRHSSVREIALMV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_016203
TK1151 IDTkA02G174710
OH-1004 IDLXL04_016203
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 78.585
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_016203
位置Chr03:115044692-115047548 (+)
描述Similar to NHX4: Sodium/hydrogen exchanger 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55470 可能参与质子与钠离子（Na(+)）或钾离子（K(+)）等阳离子的低亲和力电中性交换穿膜运输。 暂无已核实直接文献
At3g05030 在质子与阳离子跨膜的低亲和力电中性交换中发挥作用。
Differential expression and function of Arabidopsis thaliana NHX Na+/H+ antiporters in the salt stress response.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01309.x
At5g27150 在质子与阳离子跨膜的低亲和力电中性交换中发挥作用。
Salt tolerance conferred by overexpression of a vacuolar Na+/H+ antiport in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1126/science.285.5431.1256
Functional conservation between yeast and plant endosomal Na(+)/H(+) antiporters.2000 · DOI: 10.1016/s0014-5793(00)01412-5
Arabidopsis thaliana and Saccharomyces cerevisiae NHX1 genes encode amiloride sensitive electroneutral Na+/H+ exchangers.2000 · DOI: 10.1042/0264-6021:3510241
Engineering salt-tolerant Brassica plants: characterization of yield and seed oil quality in transgenic plants with increased vacuolar sodium accumulation.2001 · DOI: 10.1073/pnas.231476498
The arabidopsis Na+/H+ exchanger AtNHX1 catalyzes low affinity Na+ and K+ transport in reconstituted liposomes.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m105043200
Vacuolar cation/H+ exchange, ion homeostasis, and leaf development are altered in a T-DNA insertional mutant of AtNHX1, the Arabidopsis vacuolar Na+/H+ antiporter.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01871.x
Expression of an Arabidopsis vacuolar sodium/proton antiporter gene in cotton improves photosynthetic performance under salt conditions and increases fiber yield in the field.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci201
The Arabidopsis thaliana proton transporters, AtNhx1 and Avp1, can function in cation detoxification in yeast.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.4.1480
At3g06370 可能参与质子与钠离子（Na(+)）或钾离子（K(+)）等阳离子的低亲和力电中性交换穿膜运输。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0666900 可能作为液泡膜反向转运蛋白，介导 H⁺ 与 Na⁺、K⁺ 等阳离子的低亲和力电中性交换。
Function, intracellular localization and the importance in salt tolerance of a vacuolar Na(+)/H(+) antiporter from rice.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch014
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016203 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0034486 vacuolar transmembrane transport 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:0098719 sodium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05030
ath:AT3G06370
ath:AT5G27150
ath:AT5G55470
dosa:Os07g0666900
osa:4344217
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.415
排名 1 · LXL04_016203 · OH-1004
细胞膜0.262
排名 2 · LXL04_016203 · OH-1004
细胞质0.232
排名 3 · LXL04_016203 · OH-1004
高尔基体0.120
排名 4 · LXL04_016203 · OH-1004
内质网0.114
排名 5 · LXL04_016203 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00999.27Na_H_Exchanger34-449 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_016203PF00999.27Na_H_Exchanger344493.6e-57194.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S397拟南芥Sodium/hydrogen exchanger 466.168%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q56XP4拟南芥Sodium/hydrogen exchanger 257.306%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q68KI4拟南芥Sodium/hydrogen exchanger 157.524%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q84WG1拟南芥Sodium/hydrogen exchanger 362.670%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SXJ8水稻Sodium/hydrogen exchanger 157.915%Swiss-Prot强数据库同源证据

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