同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00332

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 19

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00332

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00332 Chr08 46340960-46888140 Chr03 147703645-148289029 mixed High 19 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00332`	Chr08:46340960-46888140	Chr03:147703645-148289029	mixed	19	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 19 · 当前范围 1–19 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA08G177050 → LXL04_017374

96.7%

TkA08G177520 → LXL04_017376

95.0%

TkA08G177550 → LXL04_017377

100.0%

TkA08G177560 → LXL04_017378

95.7%

TkA08G177780 → LXL04_017379

98.6%

TkA08G177860 → LXL04_017381

99.0%

TkA08G177990 → LXL04_017382

100.0%

TkA08G178170 → LXL04_017385

97.3%

TkA08G178260 → LXL04_017386

100.0%

TkA08G178290 → LXL04_017387

90.2%

TkA08G178300 → LXL04_017388

99.7%

TkA08G178350 → LXL04_017390

96.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA08G177050`	`LXL04_017374`	`JCVI_TKOH_00332`	96.7	86.525 / 42.361	待复核
`TkA08G177520`	`LXL04_017376`	`JCVI_TKOH_00332`	95.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G177550`	`LXL04_017377`	`JCVI_TKOH_00332`	100.0	73.034 / 73.034	Complex
`TkA08G177560`	`LXL04_017378`	`JCVI_TKOH_00332`	95.7	95.833 / 51.111	待复核
`TkA08G177780`	`LXL04_017379`	`JCVI_TKOH_00332`	98.6	72.549 / 64.348	Complex
`TkA08G177860`	`LXL04_017381`	`JCVI_TKOH_00332`	99.0	92.793 / 31.498	待复核
`TkA08G177990`	`LXL04_017382`	`JCVI_TKOH_00332`	100.0	99.697 / 86.352	Complex
`TkA08G178170`	`LXL04_017385`	`JCVI_TKOH_00332`	97.3	100.0 / 100.0	Probable
`TkA08G178260`	`LXL04_017386`	`JCVI_TKOH_00332`	100.0	90.678 / 100.0	Complex
`TkA08G178290`	`LXL04_017387`	`JCVI_TKOH_00332`	90.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G178300`	`LXL04_017388`	`JCVI_TKOH_00332`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G178350`	`LXL04_017390`	`JCVI_TKOH_00332`	96.3	100.0 / 100.0	Probable
`TkA08G178630`	`LXL04_017393`	`JCVI_TKOH_00332`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA08G178640`	`LXL04_017394`	`JCVI_TKOH_00332`	99.6	100.0 / 87.87	Probable
`TkA08G178670`	`LXL04_017396`	`JCVI_TKOH_00332`	96.5	99.695 / 46.324	待复核
`TkA08G178720`	`LXL04_017396`	`JCVI_TKOH_00332`	96.5	99.695 / 46.324	待复核
`TkA08G178930`	`LXL04_017397`	`JCVI_TKOH_00332`	98.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G178960`	`LXL04_017398`	`JCVI_TKOH_00332`	100.0	100.0 / 74.919	Probable
`TkA08G179080`	`LXL04_017399`	`JCVI_TKOH_00332`	99.1	100.0 / 47.083	待复核