同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00093

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00093

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00093 Chr02 116201634-116422654 Chr03 41455970-42071592 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00093`	Chr02:116201634-116422654	Chr03:41455970-42071592	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA02G456390 → LXL04_014093

73.9%

TkA02G456400 → LXL04_014094

98.3%

TkA02G456420 → LXL04_014095

100.0%

TkA02G456430 → LXL04_014095

100.0%

TkA02G456440 → LXL04_014095

99.6%

TkA02G456550 → LXL04_014101

83.4%

TkA02G456720 → LXL04_014074

100.0%

TkA02G456730 → LXL04_014075

99.9%

TkA02G456800 → LXL04_014073

99.6%

TkA02G456810 → LXL04_014072

99.7%

TkA02G456830 → LXL04_014070

96.3%

TkA02G456840 → LXL04_014069

98.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA02G456390`	`LXL04_014093`	`JCVI_TKOH_00093`	73.9	70.4 / 20.657	Complex
`TkA02G456400`	`LXL04_014094`	`JCVI_TKOH_00093`	98.3	81.073 / 40.196	待复核
`TkA02G456420`	`LXL04_014095`	`JCVI_TKOH_00093`	100.0	100.0 / 16.555	待复核
`TkA02G456430`	`LXL04_014095`	`JCVI_TKOH_00093`	100.0	66.667 / 5.384	Complex
`TkA02G456440`	`LXL04_014095`	`JCVI_TKOH_00093`	99.6	100.0 / 16.353	待复核
`TkA02G456550`	`LXL04_014101`	`JCVI_TKOH_00093`	83.4	94.493 / 66.26	待复核
`TkA02G456720`	`LXL04_014074`	`JCVI_TKOH_00093`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G456730`	`LXL04_014075`	`JCVI_TKOH_00093`	99.9	99.287 / 49.91	待复核
`TkA02G456800`	`LXL04_014073`	`JCVI_TKOH_00093`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G456810`	`LXL04_014072`	`JCVI_TKOH_00093`	99.7	88.587 / 92.482	Strict
`TkA02G456830`	`LXL04_014070`	`JCVI_TKOH_00093`	96.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G456840`	`LXL04_014069`	`JCVI_TKOH_00093`	98.0	78.4 / 74.242	Probable
`TkA02G457030`	`LXL04_014074`	`JCVI_TKOH_00093`	69.4	95.035 / 67.677	Complex
`TkA02G457040`	`LXL04_014068`	`JCVI_TKOH_00093`	74.4	93.478 / 68.276	Complex
`TkA02G457060`	`LXL04_014061`	`JCVI_TKOH_00093`	86.3	98.765 / 41.237	Complex