同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00074

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 21

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00074

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00074 Chr02 145264414-146048168 Chr02 32733986-33713564 + High 21 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00074`	Chr02:145264414-146048168	Chr02:32733986-33713564	+	21	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 21 · 当前范围 1–21 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA02G562400 → LXL04_006977

58.4%

TkA02G562490 → LXL04_006977

96.6%

TkA02G562510 → LXL04_006979

93.6%

TkA02G562600 → LXL04_006982

90.1%

TkA02G562630 → LXL04_006985

88.8%

TkA02G562710 → LXL04_006985

100.0%

TkA02G562810 → LXL04_006988

87.2%

TkA02G563520 → LXL04_006993

99.7%

TkA02G563790 → LXL04_006994

97.2%

TkA02G563800 → LXL04_006995

100.0%

TkA02G563830 → LXL04_006996

99.1%

TkA02G564060 → LXL04_006997

84.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA02G562400`	`LXL04_006977`	`JCVI_TKOH_00074`	58.4	80.299 / 63.265	Complex
`TkA02G562490`	`LXL04_006977`	`JCVI_TKOH_00074`	96.6	59.864 / 17.959	Complex
`TkA02G562510`	`LXL04_006979`	`JCVI_TKOH_00074`	93.6	42.23 / 27.84	Complex
`TkA02G562600`	`LXL04_006982`	`JCVI_TKOH_00074`	90.1	92.054 / 39.52	待复核
`TkA02G562630`	`LXL04_006985`	`JCVI_TKOH_00074`	88.8	82.237 / 76.22	Complex
`TkA02G562710`	`LXL04_006985`	`JCVI_TKOH_00074`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G562810`	`LXL04_006988`	`JCVI_TKOH_00074`	87.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G563520`	`LXL04_006993`	`JCVI_TKOH_00074`	99.7	89.696 / 100.0	Complex
`TkA02G563790`	`LXL04_006994`	`JCVI_TKOH_00074`	97.2	99.644 / 54.677	待复核
`TkA02G563800`	`LXL04_006995`	`JCVI_TKOH_00074`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA02G563830`	`LXL04_006996`	`JCVI_TKOH_00074`	99.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G564060`	`LXL04_006997`	`JCVI_TKOH_00074`	84.3	100.0 / 22.659	Complex
`TkA02G564130`	`LXL04_006997`	`JCVI_TKOH_00074`	97.0	100.0 / 88.764	Complex
`TkA02G564390`	`LXL04_007000`	`JCVI_TKOH_00074`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA02G564400`	`LXL04_007001`	`JCVI_TKOH_00074`	100.0	100.0 / 77.987	Probable
`TkA02G564410`	`LXL04_007002`	`JCVI_TKOH_00074`	99.7	95.82 / 100.0	Probable
`TkA02G564500`	`LXL04_007005`	`JCVI_TKOH_00074`	94.8	96.481 / 99.091	Probable
`TkA02G564590`	`LXL04_007007`	`JCVI_TKOH_00074`	80.0	99.44 / 99.745	待复核
`TkA02G564750`	`LXL04_007010`	`JCVI_TKOH_00074`	82.5	94.845 / 51.02	Complex
`TkA02G565680`	`LXL04_007011`	`JCVI_TKOH_00074`	99.4	94.857 / 100.0	Complex
`TkA02G565690`	`LXL04_007012`	`JCVI_TKOH_00074`	99.7	100.0 / 100.0	Probable