同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00024

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 29

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00024

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00024 Chr01 97523617-99472972 Chr01 65990088-68610188 - High 29 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00024`	Chr01:97523617-99472972	Chr01:65990088-68610188	-	29	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 29 · 当前范围 1–29 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G390590 → LXL04_003117

99.8%

TkA01G391110 → LXL04_003124

100.0%

TkA01G391140 → LXL04_003123

100.0%

TkA01G391150 → LXL04_003122

100.0%

TkA01G391350 → LXL04_003121

100.0%

TkA01G391370 → LXL04_003120

100.0%

TkA01G392250 → LXL04_003104

100.0%

TkA01G392530 → LXL04_003103

99.3%

TkA01G393450 → LXL04_003102

100.0%

TkA01G393460 → LXL04_003101

99.5%

TkA01G393540 → LXL04_003099

96.8%

TkA01G393600 → LXL04_003098

99.7%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G390590`	`LXL04_003117`	`JCVI_TKOH_00024`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G391110`	`LXL04_003124`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G391140`	`LXL04_003123`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G391150`	`LXL04_003122`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	99.399 / 94.034	Strict
`TkA01G391350`	`LXL04_003121`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G391370`	`LXL04_003120`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G392250`	`LXL04_003104`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	68.627 / 38.889	待复核
`TkA01G392530`	`LXL04_003103`	`JCVI_TKOH_00024`	99.3	100.0 / 71.642	Complex
`TkA01G393450`	`LXL04_003102`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	99.779 / 94.942	Strict
`TkA01G393460`	`LXL04_003101`	`JCVI_TKOH_00024`	99.5	97.068 / 80.432	Strict
`TkA01G393540`	`LXL04_003099`	`JCVI_TKOH_00024`	96.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G393600`	`LXL04_003098`	`JCVI_TKOH_00024`	99.7	99.86 / 90.932	Complex
`TkA01G394270`	`LXL04_003098`	`JCVI_TKOH_00024`	75.2	99.868 / 99.872	Complex
`TkA01G394300`	`LXL04_003094`	`JCVI_TKOH_00024`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G394320`	`LXL04_003093`	`JCVI_TKOH_00024`	87.0	95.4 / 99.767	待复核
`TkA01G394590`	`LXL04_003092`	`JCVI_TKOH_00024`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G394610`	`LXL04_003090`	`JCVI_TKOH_00024`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G394630`	`LXL04_003089`	`JCVI_TKOH_00024`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G394920`	`LXL04_003088`	`JCVI_TKOH_00024`	94.0	91.429 / 83.732	Probable
`TkA01G395140`	`LXL04_003087`	`JCVI_TKOH_00024`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G395150`	`LXL04_003086`	`JCVI_TKOH_00024`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G395780`	`LXL04_003085`	`JCVI_TKOH_00024`	90.4	87.407 / 77.64	Complex
`TkA01G396140`	`LXL04_003084`	`JCVI_TKOH_00024`	95.2	99.686 / 90.489	Strict
`TkA01G396350`	`LXL04_003082`	`JCVI_TKOH_00024`	98.5	100.0 / 76.744	Complex
`TkA01G396370`	`LXL04_003080`	`JCVI_TKOH_00024`	99.0	93.571 / 77.21	Complex
`TkA01G397020`	`LXL04_003076`	`JCVI_TKOH_00024`	75.7	92.308 / 62.181	Complex
`TkA01G397330`	`LXL04_003069`	`JCVI_TKOH_00024`	87.7	56.25 / 67.241	待复核
`TkA01G397630`	`LXL04_003066`	`JCVI_TKOH_00024`	98.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G398330`	`LXL04_003062`	`JCVI_TKOH_00024`	98.7	53.726 / 43.683	待复核