同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00007

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00007

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00007 Chr01 21189501-22179664 Chr01 152547700-153837624 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00007`	Chr01:21189501-22179664	Chr01:152547700-153837624	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G083180 → LXL04_005049

73.6%

TkA01G083200 → LXL04_005040

99.4%

TkA01G083370 → LXL04_005035

96.2%

TkA01G083500 → LXL04_005035

97.4%

TkA01G083710 → LXL04_005033

99.6%

TkA01G083860 → LXL04_005029

97.8%

TkA01G083880 → LXL04_005029

83.8%

TkA01G083990 → LXL04_005029

75.8%

TkA01G084020 → LXL04_005027

99.7%

TkA01G084030 → LXL04_005027

99.9%

TkA01G084530 → LXL04_005024

100.0%

TkA01G084570 → LXL04_005022

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G083180`	`LXL04_005049`	`JCVI_TKOH_00007`	73.6	98.371 / 99.588	待复核
`TkA01G083200`	`LXL04_005040`	`JCVI_TKOH_00007`	99.4	97.636 / 94.542	Complex
`TkA01G083370`	`LXL04_005035`	`JCVI_TKOH_00007`	96.2	100.0 / 55.597	待复核
`TkA01G083500`	`LXL04_005035`	`JCVI_TKOH_00007`	97.4	99.43 / 43.899	待复核
`TkA01G083710`	`LXL04_005033`	`JCVI_TKOH_00007`	99.6	100.0 / 47.132	待复核
`TkA01G083860`	`LXL04_005029`	`JCVI_TKOH_00007`	97.8	100.0 / 23.818	待复核
`TkA01G083880`	`LXL04_005029`	`JCVI_TKOH_00007`	83.8	89.5 / 23.109	Complex
`TkA01G083990`	`LXL04_005029`	`JCVI_TKOH_00007`	75.8	95.455 / 24.645	Complex
`TkA01G084020`	`LXL04_005027`	`JCVI_TKOH_00007`	99.7	93.233 / 30.718	待复核
`TkA01G084030`	`LXL04_005027`	`JCVI_TKOH_00007`	99.9	98.87 / 57.803	待复核
`TkA01G084530`	`LXL04_005024`	`JCVI_TKOH_00007`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G084570`	`LXL04_005022`	`JCVI_TKOH_00007`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G084810`	`LXL04_005020`	`JCVI_TKOH_00007`	99.2	100.0 / 91.007	Strict
`TkA01G085460`	`LXL04_005012`	`JCVI_TKOH_00007`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G085470`	`LXL04_005011`	`JCVI_TKOH_00007`	90.9	90.98 / 77.679	Probable
`TkA01G085500`	`LXL04_005010`	`JCVI_TKOH_00007`	99.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G085780`	`LXL04_005008`	`JCVI_TKOH_00007`	99.7	100.0 / 91.353	Complex
`TkA01G087040`	`LXL04_005005`	`JCVI_TKOH_00007`	99.1	86.364 / 44.882	待复核