同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00308

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 22

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00308

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00308 Chr07 78417237-79610767 Chr06 90459391-91858583 mixed High 22 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00308`	Chr07:78417237-79610767	Chr06:90459391-91858583	mixed	22	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 22 · 当前范围 1–22 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA07G312470 → LXL04_029459

99.4%

TkA07G312970 → LXL04_029462

93.2%

TkA07G313200 → LXL04_029464

72.5%

TkA07G313420 → LXL04_029465

99.6%

TkA07G313430 → LXL04_029466

100.0%

TkA07G313720 → LXL04_029467

99.1%

TkA07G314540 → LXL04_029472

85.5%

TkA07G314630 → LXL04_029475

100.0%

TkA07G314640 → LXL04_029476

100.0%

TkA07G315240 → LXL04_029479

99.8%

TkA07G316120 → LXL04_029452

98.8%

TkA07G316320 → LXL04_029451

99.6%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA07G312470`	`LXL04_029459`	`JCVI_TKOH_00308`	99.4	97.708 / 63.265	待复核
`TkA07G312970`	`LXL04_029462`	`JCVI_TKOH_00308`	93.2	100.0 / 100.0	Probable
`TkA07G313200`	`LXL04_029464`	`JCVI_TKOH_00308`	72.5	100.0 / 50.147	Complex
`TkA07G313420`	`LXL04_029465`	`JCVI_TKOH_00308`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G313430`	`LXL04_029466`	`JCVI_TKOH_00308`	100.0	67.907 / 73.737	待复核
`TkA07G313720`	`LXL04_029467`	`JCVI_TKOH_00308`	99.1	97.028 / 73.237	Probable
`TkA07G314540`	`LXL04_029472`	`JCVI_TKOH_00308`	85.5	94.754 / 83.882	待复核
`TkA07G314630`	`LXL04_029475`	`JCVI_TKOH_00308`	100.0	65.094 / 93.243	待复核
`TkA07G314640`	`LXL04_029476`	`JCVI_TKOH_00308`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G315240`	`LXL04_029479`	`JCVI_TKOH_00308`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G316120`	`LXL04_029452`	`JCVI_TKOH_00308`	98.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G316320`	`LXL04_029451`	`JCVI_TKOH_00308`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G316350`	`LXL04_029449`	`JCVI_TKOH_00308`	85.8	88.319 / 79.295	待复核
`TkA07G316460`	`LXL04_029448`	`JCVI_TKOH_00308`	95.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G316660`	`LXL04_029447`	`JCVI_TKOH_00308`	84.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkA07G316680`	`LXL04_029446`	`JCVI_TKOH_00308`	97.8	99.277 / 88.337	Strict
`TkA07G316790`	`LXL04_029445`	`JCVI_TKOH_00308`	100.0	94.853 / 91.489	Complex
`TkA07G317250`	`LXL04_029442`	`JCVI_TKOH_00308`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G317310`	`LXL04_029439`	`JCVI_TKOH_00308`	84.4	87.595 / 88.813	待复核
`TkA07G317440`	`LXL04_029438`	`JCVI_TKOH_00308`	99.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA07G317470`	`LXL04_029437`	`JCVI_TKOH_00308`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G317620`	`LXL04_029433`	`JCVI_TKOH_00308`	79.3	100.0 / 99.14	待复核