同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00257

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00257

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00257 Chr06 106498776-107009099 Chr03 50471716-51657369 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00257`	Chr06:106498776-107009099	Chr03:50471716-51657369	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G430750 → LXL04_014499

88.6%

TkA06G430850 → LXL04_014506

99.4%

TkA06G430880 → LXL04_014507

99.5%

TkA06G430890 → LXL04_014508

99.7%

TkA06G430930 → LXL04_014510

98.5%

TkA06G431450 → LXL04_014516

92.9%

TkA06G431470 → LXL04_014517

98.9%

TkA06G431480 → LXL04_014518

98.7%

TkA06G431540 → LXL04_014520

99.7%

TkA06G431750 → LXL04_014521

98.6%

TkA06G431900 → LXL04_014525

74.5%

TkA06G431910 → LXL04_014525

48.6%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G430750`	`LXL04_014499`	`JCVI_TKOH_00257`	88.6	99.128 / 100.0	Complex
`TkA06G430850`	`LXL04_014506`	`JCVI_TKOH_00257`	99.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G430880`	`LXL04_014507`	`JCVI_TKOH_00257`	99.5	100.0 / 95.683	Complex
`TkA06G430890`	`LXL04_014508`	`JCVI_TKOH_00257`	99.7	37.237 / 100.0	待复核
`TkA06G430930`	`LXL04_014510`	`JCVI_TKOH_00257`	98.5	97.671 / 84.27	Complex
`TkA06G431450`	`LXL04_014516`	`JCVI_TKOH_00257`	92.9	100.0 / 79.375	Complex
`TkA06G431470`	`LXL04_014517`	`JCVI_TKOH_00257`	98.9	100.0 / 34.426	待复核
`TkA06G431480`	`LXL04_014518`	`JCVI_TKOH_00257`	98.7	98.677 / 81.087	待复核
`TkA06G431540`	`LXL04_014520`	`JCVI_TKOH_00257`	99.7	99.67 / 83.657	Complex
`TkA06G431750`	`LXL04_014521`	`JCVI_TKOH_00257`	98.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G431900`	`LXL04_014525`	`JCVI_TKOH_00257`	74.5	88.828 / 44.054	Complex
`TkA06G431910`	`LXL04_014525`	`JCVI_TKOH_00257`	48.6	95.643 / 59.054	Complex
`TkA06G431970`	`LXL04_014525`	`JCVI_TKOH_00257`	56.7	92.5 / 29.73	Complex
`TkA06G432140`	`LXL04_014526`	`JCVI_TKOH_00257`	93.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G432170`	`LXL04_014527`	`JCVI_TKOH_00257`	99.4	95.446 / 54.144	待复核
`TkA06G432410`	`LXL04_014528`	`JCVI_TKOH_00257`	100.0	98.901 / 37.113	待复核