同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00161
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 12
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00161

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00161 Chr03 70160589-70365609 Chr06 1400516-1851123 mixed High 12 anchors
Chr03 70160589-70365609 Chr06 1400516-1851123 JCVI_TKOH_00161 · 12 gene pairs TkA03G284430 | LXL04_026688 | 90.0% | non_reciprocal_best_hit | Complex TkA03G284470 | LXL04_026690 | 92.9% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284500 | LXL04_026691 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA03G284700 | LXL04_026695 | 100.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284800 | LXL04_026696 | 99.9% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284820 | LXL04_026698 | 99.8% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284840 | LXL04_026699 | 97.9% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA03G284920 | LXL04_026702 | 99.7% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284930 | LXL04_026703 | 100.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284940 | LXL04_026704 | 99.4% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G284990 | LXL04_026705 | 98.1% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G285030 | LXL04_026706 | 99.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00161 Chr03:70160589-70365609 Chr06:1400516-1851123 mixed 12 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 12 · 当前范围 1–12 · 页码 1/1

TkA03G284430 → LXL04_026688
90.0%
TkA03G284470 → LXL04_026690
92.9%
TkA03G284500 → LXL04_026691
100.0%
TkA03G284700 → LXL04_026695
100.0%
TkA03G284800 → LXL04_026696
99.9%
TkA03G284820 → LXL04_026698
99.8%
TkA03G284840 → LXL04_026699
97.9%
TkA03G284920 → LXL04_026702
99.7%
TkA03G284930 → LXL04_026703
100.0%
TkA03G284940 → LXL04_026704
99.4%
TkA03G284990 → LXL04_026705
98.1%
TkA03G285030 → LXL04_026706
99.0%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA03G284430LXL04_026688JCVI_TKOH_0016190.085.526 / 14.607Complex
TkA03G284470LXL04_026690JCVI_TKOH_0016192.990.588 / 93.902Complex
TkA03G284500LXL04_026691JCVI_TKOH_00161100.0100.0 / 37.66待复核
TkA03G284700LXL04_026695JCVI_TKOH_00161100.0100.0 / 100.0Complex
TkA03G284800LXL04_026696JCVI_TKOH_0016199.9100.0 / 100.0Complex
TkA03G284820LXL04_026698JCVI_TKOH_0016199.8100.0 / 100.0Complex
TkA03G284840LXL04_026699JCVI_TKOH_0016197.9100.0 / 100.0待复核
TkA03G284920LXL04_026702JCVI_TKOH_0016199.780.272 / 57.938Complex
TkA03G284930LXL04_026703JCVI_TKOH_00161100.0100.0 / 100.0Complex
TkA03G284940LXL04_026704JCVI_TKOH_0016199.4100.0 / 100.0Complex
TkA03G284990LXL04_026705JCVI_TKOH_0016198.1100.0 / 100.0Complex
TkA03G285030LXL04_026706JCVI_TKOH_0016199.089.22 / 55.731待复核