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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_026696
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 1539844-1546803 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2472 bp · LXL04_026696|LXL04_026696|OH1004|cDNA

ATGAAAGAGATTAGAGATGGAACAAAAAGTAACAAAATATCCCAACCGCTTGTTTTAGACATAGAAGACTTCAAGGGCGACTTCTCATTCGATGCTTTATTTGGAAACTTAGTAAATGAGTTACTGCCTTCttttcaagaagaagaagctgatACATTAGAAGCAAATGGTAATATTAATGGGCATGATTCTTTGACTAATGGAAGGTCAGTACAACAAGGGCAATCAAGTCCTTTATTTCCAGAAGTAGATGCATTATT...

CDS

下载 CDS FASTA

2472 bp · LXL04_026696|LXL04_026696|OH1004|CDS

ATGAAAGAGATTAGAGATGGAACAAAAAGTAACAAAATATCCCAACCGCTTGTTTTAGACATAGAAGACTTCAAGGGCGACTTCTCATTCGATGCTTTATTTGGAAACTTAGTAAATGAGTTACTGCCTTCTTTTCAAGAAGAAGAAGCTGATACATTAGAAGCAAATGGTAATATTAATGGGCATGATTCTTTGACTAATGGAAGGTCAGTACAACAAGGGCAATCAAGTCCTTTATTTCCAGAAGTAGATGCATTATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

823 aa · LXL04_026696|LXL04_026696|OH1004|PROTEIN

MKEIRDGTKSNKISQPLVLDIEDFKGDFSFDALFGNLVNELLPSFQEEEADTLEANGNINGHDSLTNGRSVQQGQSSPLFPEVDALLSMFKNSCSQLVEIRKQVDGRLFNLKKDVSAQDSKHRKTLGELEKGVDGLFDSFARLDSRISSVGQTAAKIGDHLQSADSQRETASQTMELIKYLMEFNSSPGDLMELSPLFSDDSRVAEAASIAQKLRSFAEEDIGRQGVTMQSVPGNATASRGLEVAVGNLQEYCNELENRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_026696
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_026696
位置Chr06:1539844-1546803 (-)
描述Similar to SEC10a: Exocyst complex component SEC10a
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g12370 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。 暂无已核实直接文献
At5g12365 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0238100 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026696 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006892 post-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0006893 Golgi to plasma membrane transport 生物过程
GO:0006904 vesicle docking involved in exocytosis 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0060321 acceptance of pollen 生物过程
GO:0072659 protein localization to plasma membrane 生物过程
GO:0090148 membrane fission 生物过程
GO:0090522 vesicle tethering involved in exocytosis 生物过程
GO:0000145 exocyst 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G12370
ddi:DDB_G0287881
dosa:Os12g0238100
hsa:10640
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.513
排名 1 · LXL04_026696 · OH-1004
高尔基体0.355
排名 2 · LXL04_026696 · OH-1004
溶酶体／液泡0.197
排名 3 · LXL04_026696 · OH-1004
细胞核0.183
排名 4 · LXL04_026696 · OH-1004
细胞膜0.148
排名 5 · LXL04_026696 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20667.4Sec10_N84-200 aa
PF07393.18Sec10_HB206-815 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_026696PF20667.4Sec10_N842002.2e-31109.1
LXL04_026696PF07393.18Sec10_HB2068154.2e-144482.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
X5JA13拟南芥Exocyst complex component SEC10a79.708%Swiss-Prot强数据库同源证据
X5JB51拟南芥Exocyst complex component SEC10b80.316%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q2QV94水稻Exocyst complex component 573.201%Swiss-Prot强数据库同源证据

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